TkA03G463810 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G463810

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 115806764-115807117 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

354 bp · TkA03G463810|TK1151|cDNA

ATGGCAAGAAAATGGCGTAGAGAGGCGGCCAAGAGTGCTGCAAGGGTGGCCGACAAGGGTCATTTTGTTGTTTACACGGTGGATCATAGTCGTTTTGTGATTCCGTTGCATTATCTCAACAACAATATATTTCGTGAGCTTTTGAAGATGTCCGAGGATGAGTTTGGGTTGCCAACAAACAGGCCTATAACTTTGCCTTGTGACTCAAGCCTCATGAACTATTTAGTGAGTGTCTTTGAACGATCTCCGACCAAAGATCT...

CDS

下载 CDS FASTA

354 bp · TkA03G463810|TK1151|CDS

ATGGCAAGAAAATGGCGTAGAGAGGCGGCCAAGAGTGCTGCAAGGGTGGCCGACAAGGGTCATTTTGTTGTTTACACGGTGGATCATAGTCGTTTTGTGATTCCGTTGCATTATCTCAACAACAATATATTTCGTGAGCTTTTGAAGATGTCCGAGGATGAGTTTGGGTTGCCAACAAACAGGCCTATAACTTTGCCTTGTGACTCAAGCCTCATGAACTATTTAGTGAGTGTCTTTGAACGATCTCCGACCAAAGATCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

117 aa · TkA03G463810|TK1151|PROTEIN

MARKWRREAAKSAARVADKGHFVVYTVDHSRFVIPLHYLNNNIFRELLKMSEDEFGLPTNRPITLPCDSSLMNYLVSVFERSPTKDLEALLISIATNRCSSIDQGGENRKQVLVYGF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G463810`
TK1151 ID	TkA03G463810
OH-1004 ID	LXL04_023861
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	98.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 92.857 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G463810

位置 Chr03:115806764-115807117 (-)

描述 Similar to SAUR64: Auxin-responsive protein SAUR64

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g29450`	可能促进生长素刺激的器官伸长，如下胚轴、花药丝和花瓣。	暂无已核实直接文献
`At1g29500`	可能促进生长素刺激的器官伸长，如下胚轴、花药丝和花瓣。	暂无已核实直接文献
`At1g29440`	可能促进生长素刺激的器官伸长，例如下胚轴、雄蕊花丝和花瓣。	Arabidopsis SMALL AUXIN UP RNA63 promotes hypocotyl and stamen filament elongation.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.05024.x
`At1g29510`	可能促进生长素刺激的器官伸长，如下胚轴、花药丝和花瓣。	暂无已核实直接文献
`At1g29460`	可能促进生长素刺激的器官伸长，如下胚轴、花药丝和花瓣。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023861 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009926 auxin polar transport 生物过程

GO:0042255 ribosome assembly 生物过程

GO:0080086 stamen filament development 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005730 nucleolus 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0090406 pollen tube 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G29420

ath:AT1G29430

ath:AT1G29450

ath:AT1G29460

ath:AT1G29500

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.541

排名 1 · TkA03G463810 · TK1151

细胞核0.344

排名 2 · TkA03G463810 · TK1151

细胞膜0.182

排名 3 · TkA03G463810 · TK1151

内质网0.097

排名 4 · TkA03G463810 · TK1151

质体0.053

排名 5 · TkA03G463810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02519Auxin_inducible1-82 aa

PF02209VHP4-14 aa

PF02209VHP38-55 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G463810	`PF02519`	Auxin_inducible	1	82	1.7e-28	99.4
TkA03G463810	`PF02209`	VHP	4	14	0.26	12.0
TkA03G463810	`PF02209`	VHP	38	55	0.26	12.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q0V7Z5`	拟南芥	sp\|Q0V7Z5\|SAU64_ARATH Auxin-responsive protein SAUR64	48.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9C7Q1`	拟南芥	sp\|Q9C7Q1\|SAU66_ARATH Auxin-responsive protein SAUR66	43.300%	Swiss-Prot	中等置信
`F4I1H5`	拟南芥	sp\|F4I1H5\|SAU63_ARATH Auxin-responsive protein SAUR63	43.200%	Swiss-Prot	中等置信
`F4I1I4`	拟南芥	sp\|F4I1I4\|SAU67_ARATH Auxin-responsive protein SAUR67	43.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q0WPR6`	拟南芥	sp\|Q0WPR6\|SAU65_ARATH Auxin-responsive protein SAUR65	43.200%	Swiss-Prot	中等置信

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