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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G440810
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 109831507-109836262 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1938 bp · TkA03G440810|TK1151|cDNA

GTAAGTAATAATGGATCAGATGGAAAAAAACAATAGCAAGGGAAGACCAGGGTTGTTATGGGTAATTTTGAAACATGCTGACAAGATAGACATGAGTTTAATGGCTCTTGGATAGCGGATGCCTTGCAAATGGTTCGAGTATGGCTTTGATCATGTTAGTTGTGAGTCGAATGATGAATGGCTTTGCACCTACGGCTAAAATAACCCTTGGTGACGTAAATCAGTATGCAATCACCTATATGTACCTTGCTCTTGTTGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

768 bp · TkA03G440810|TK1151|CDS

ATGAAAGGTGAACTGGAGTTCAAAAACGTTGACTTTGCATACCCTTCAAGACCAGAAACCTTGGTTCTTAAAAAATTCAATCTTAAAGTGAACGCATGCGAGACCATTGGATTGGTTGGTCAAAGTGGGTCCGGTAAGTCAACAATGGTCAATCTGCTAGAAAGATTCTATGATCCCATTCATGGGGAGATATTACTAGATGGAATTAACATAAAGTTGTTCCAGTTAAAGTGGTTACGTACTCAGATGGGTTTAGTAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

255 aa · TkA03G440810|TK1151|PROTEIN

MKGELEFKNVDFAYPSRPETLVLKKFNLKVNACETIGLVGQSGSGKSTMVNLLERFYDPIHGEILLDGINIKLFQLKWLRTQMGLVSQEPILFATSIKENILFGKESATSEEIVEASKKANAHNFITQLPDGYDTLVGELGTQMSGGQKQRISIARALLREPKILLLDEATSSLDSHSAKAVQEALTYALEKTMVGRTCVMTAHRLSTIQRSNKIVVIDNGSVLEEGSHDDLLAKGETGAYFSLFSLQQQSSFTS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G440810
TK1151 IDTkA03G440810
OH-1004 IDLXL04_009468
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)87.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.510 / OH-1004 19.376
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G440810
位置Chr03:109831507-109836262 (+)
描述Similar to Os02g0190300: Putative multidrug resistance protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28345 ABC 转运蛋白 B 家族成员 15。 暂无已核实直接文献
At3g28380 ABC转运蛋白B家族成员17。 暂无已核实直接文献
At2g36910 可能参与油菜素甾醇的输出及相关信号转导。
Arabidopsis TWISTED DWARF1 regulates stamen elongation by differential activation of ABCB1,19-mediated auxin transport.2022 · DOI: 10.1093/jxb/erac185
Loss of Multiple ABCB Auxin Transporters Recapitulates the Major twisted dwarf 1 Phenotypes in Arabidopsis thaliana .2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.840260
Structure and function of the <i>Arabidopsis</i> ABC transporter ABCB19 in brassinosteroid export.2024 · DOI: 10.1126/science.adj4591
Structural insights into brassinosteroid export mediated by the Arabidopsis ABC transporter ABCB1.2025 · DOI: 10.1016/j.xplc.2024.101181
At3g28390 ABC转运蛋白B家族成员18。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0190300 推测的多药耐药蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009468 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0042626 ATPase-coupled transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0140359 ABC-type transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G28345
ath:AT3G28380
ath:AT3G28390
ath:AT3G28415
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.554
排名 1 · TkA03G440810 · TK1151
细胞核0.242
排名 2 · TkA03G440810 · TK1151
线粒体0.145
排名 3 · TkA03G440810 · TK1151
质体0.095
排名 4 · TkA03G440810 · TK1151
过氧化物酶体0.091
排名 5 · TkA03G440810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00005ABC_tran23-172 aa
PF03193RsgA_GTPase30-54 aa
PF13555AAA_2935-50 aa
PF07693KAP_NTPase35-57 aa
PF05729NACHT35-51 aa
PF13191AAA_1635-56 aa
PF01926MMR_HSR135-53 aa
PF02463SMC_N36-51 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G440810PF00005ABC_tran231721.3e-33117.3
TkA03G440810PF03193RsgA_GTPase30540.001918.8
TkA03G440810PF13555AAA_2935500.01116.1
TkA03G440810PF07693KAP_NTPase35570.03314.1
TkA03G440810PF05729NACHT35510.04714.2
TkA03G440810PF13191AAA_1635560.06914.4
TkA03G440810PF01926MMR_HSR135530.1313.1
TkA03G440810PF02463SMC_N36510.0003420.8
TkA03G440810PF01935DUF8736530.00318.4
TkA03G440810PF13238AAA_1836550.2212.7
TkA03G440810PF18751Ploopntkinase336580.2711.5
TkA03G440810PF13401AAA_22371780.001219.9
TkA03G440810PF13304AAA_2137590.00517.5
TkA03G440810PF13604AAA_3037600.0414.4
TkA03G440810PF09818ABC_ATPase38598.8e-0522.4
TkA03G440810PF07728AAA_538570.007217.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LHD1拟南芥sp|Q9LHD1|AB15B_ARATH ABC transporter B family member 1560.600%Swiss-Prot高置信
Q9LSJ6拟南芥sp|Q9LSJ6|AB17B_ARATH ABC transporter B family member 1761.000%Swiss-Prot高置信
Q9ZR72拟南芥sp|Q9ZR72|AB1B_ARATH ABC transporter B family member 160.300%Swiss-Prot高置信
Q9LSJ5拟南芥sp|Q9LSJ5|AB18B_ARATH ABC transporter B family member 1860.100%Swiss-Prot高置信
Q6YUU5水稻sp|Q6YUU5|MDR_ORYSJ Putative multidrug resistance protein63.600%Swiss-Prot高置信

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