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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G426970
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 106232244-106234068 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1321 bp · TkA03G426970|TK1151|cDNA

ATATAAAACTACACATTTCATAACAAAGAAAAAATAGAGAGAGCAAGACAAGTGCCATTTATCTATACACAATCGATTTCCTAGTCTGTGAAAGAGGAGAGATAAGAAATTACTAATTAATCAAAGAGATGACTATGAGCTTGGCTCATCTCACCCTTGCTTTTGGCCTTCTTGGCAATATCGTTTCATTTATGGTATTTCTAGCACCAATACCGACATTCTACAAAGTCTATAAGAAGAAATCAACAGAAGGGTTTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

894 bp · TkA03G426970|TK1151|CDS

ATGACTATGAGCTTGGCTCATCTCACCCTTGCTTTTGGCCTTCTTGGCAATATCGTTTCATTTATGGTATTTCTAGCACCAATACCGACATTCTACAAAGTCTATAAGAAGAAATCAACAGAAGGGTTTCAATCAGCGCCTTATGTAGTGGGGTTATTTAGTGCGATGCTTTGGATATATTACGCGTTTCTTAAGACCAATGTCATGCTTCTCATCACCATAAATGCAGTTGGCTGCTTCATTGAAACCTTATATATTTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

297 aa · TkA03G426970|TK1151|PROTEIN

MTMSLAHLTLAFGLLGNIVSFMVFLAPIPTFYKVYKKKSTEGFQSAPYVVGLFSAMLWIYYAFLKTNVMLLITINAVGCFIETLYICFFLFYAPKKARMESMKLIVLLIVLGFGLIVVLTELLASGANRAVIVGWICLVFSLCVFVAPMGVVRQVIKTKSVEYMPILLSTALTISAVMWFFYGLLLRDFNIAIPNVLGFTFGILQMILFFVYKNKKPVINTEKISTLEAKISNMEEQKIPELKDQKIIDIVKLGTLIHSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G426970
TK1151 IDTkA03G426970
OH-1004 IDLXL04_009322
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)75.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.327 / OH-1004 99.306
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G426970
位置Chr03:106232244-106234068 (+)
描述Similar to SWEET10: Bidirectional sugar transporter SWEET10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g48740 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。
Functional role of oligomerization for bacterial and plant SWEET sugar transporter family.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1311244110
A cascade of sequentially expressed sucrose transporters in the seed coat and endosperm provides nutrition for the Arabidopsis embryo.2015 · DOI: 10.1105/tpc.114.134585
At5g23660 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
At5g50790 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BKP4 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
Os11g0508600 介导糖跨质膜的低亲和力摄取和流出。
Sugar transporters for intercellular exchange and nutrition of pathogens.2010 · DOI: 10.1038/nature09606
Five phylogenetically close rice SWEET genes confer TAL effector-mediated susceptibility to Xanthomonas oryzae pv. oryzae.2013 · DOI: 10.1111/nph.12411
Os12g0476200 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2X5B4 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009322 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0008643 carbohydrate transport 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010431 seed maturation 生物过程
GO:0015770 sucrose transport 生物过程
GO:0048571 long-day photoperiodism 生物过程
GO:0051260 protein homooligomerization 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0008515 sucrose transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0051119 sugar transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G23660
ath:AT5G50790
dosa:Os11g0508600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.649
排名 1 · TkA03G426970 · TK1151
内质网0.147
排名 2 · TkA03G426970 · TK1151
溶酶体／液泡0.112
排名 3 · TkA03G426970 · TK1151
细胞质0.096
排名 4 · TkA03G426970 · TK1151
高尔基体0.067
排名 5 · TkA03G426970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03083MtN3_slv12-96 aa
PF04193PQ-loop14-65 aa
PF22258DUF694919-59 aa
PF04193PQ-loop71-90 aa
PF04193PQ-loop131-146 aa
PF03083MtN3_slv132-216 aa
PF22258DUF6949138-184 aa
PF04193PQ-loop155-187 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G426970PF03083MtN3_slv12962.1e-53179.0
TkA03G426970PF04193PQ-loop14650.0004820.5
TkA03G426970PF22258DUF694919590.02615.5
TkA03G426970PF04193PQ-loop71900.0004820.5
TkA03G426970PF04193PQ-loop1311460.0004820.5
TkA03G426970PF03083MtN3_slv1322162.1e-53179.0
TkA03G426970PF22258DUF69491381840.02615.5
TkA03G426970PF04193PQ-loop1551870.0004820.5
TkA03G426970PF04193PQ-loop1962090.0004820.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SMM5拟南芥sp|Q9SMM5|SWT11_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET1154.000%Swiss-Prot高置信
O82587拟南芥sp|O82587|SWT12_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET1253.500%Swiss-Prot高置信
Q9LUE3拟南芥sp|Q9LUE3|SWT10_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET1043.600%Swiss-Prot中等置信
B8BKP4水稻sp|B8BKP4|SWT14_ORYSI Bidirectional sugar transporter SWEET1461.600%Swiss-Prot高置信
Q2R3P9水稻sp|Q2R3P9|SWT14_ORYSJ Bidirectional sugar transporter SWEET1461.600%Swiss-Prot高置信
Q2QR07水稻sp|Q2QR07|SWT13_ORYSJ Bidirectional sugar transporter SWEET1360.600%Swiss-Prot高置信
A2X5B4水稻sp|A2X5B4|SWT15_ORYSI Bidirectional sugar transporter SWEET1544.000%Swiss-Prot中等置信

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