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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G392260
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 97256227-97256867 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

360 bp · TkA03G392260|TK1151|cDNA

GAGGAAGAAGCGAATAGGTCAATATACTCTGTTTCTACAAAGTATTACTATGCGTTTGGCTGCAAAATCGACGTCAATGTTGTTCATCGTATCAAATCTATGCCCACTGTAAGATGGGTTTTGCCGGATTCTCATCTCTGTCATGGTACCAATGATTACGGAGGAGAACCATTTATTAATGGAAATGTTGTTCTCTATGATGAGAAGTTCCATGAGGACTGGCTACAAGATCAAAACGACAATGGATTTAGGCGGAGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

306 bp · TkA03G392260|TK1151|CDS

GAGGAAGAAGCGAATAGGTCAATATACTCTGTTTCTACAAAGTATTACTATGCGTTTGGCTGCAAAATCGACGTCAATGTTGTTCATCGTATCAAATCTATGCCCACTGTAAGATGGGTTTTGCCGGATTCTCATCTCTGTCATGGTACCAATGATTACGGAGGAGAACCATTTATTAATGGAAATGTTGTTCTCTATGATGAGAAGTTCCATGAGGACTGGCTACAAGATCAAAACGACAATGGATTTAGGCGGAGAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

101 aa · TkA03G392260|TK1151|PROTEIN

EEEANRSIYSVSTKYYYAFGCKIDVNVVHRIKSMPTVRWVLPDSHLCHGTNDYGGEPFINGNVVLYDEKFHEDWLQDQNDNGFRRRRRRRSRRKEQKIDSD

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G392260
TK1151 IDTkA03G392260
OH-1004 IDLXL04_009007
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 52.332
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G392260
位置Chr03:97256227-97256867 (+)
描述Similar to MORF7: Multiple organellar RNA editing factor 7, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g72530 参与细胞器RNA编辑。
Comprehensive high-resolution analysis of the role of an Arabidopsis gene family in RNA editing.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003584
At1g11430 参与细胞器RNA编辑。 暂无已核实直接文献
At3g06790 参与细胞器RNA编辑。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009007 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002103 endonucleolytic cleavage of tetracistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, LSU-rRNA, 4.5S-rRNA, 5S-rRNA) 生物过程
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0009451 RNA modification 生物过程
GO:0009657 plastid organization 生物过程
GO:0016554 cytidine to uridine editing 生物过程
GO:0080156 mitochondrial mRNA modification 生物过程
GO:1900865 chloroplast RNA modification 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11430
ath:AT1G32580
ath:AT1G72530
ath:AT3G15000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.391
排名 1 · TkA03G392260 · TK1151
细胞质0.329
排名 2 · TkA03G392260 · TK1151
内质网0.148
排名 3 · TkA03G392260 · TK1151
溶酶体／液泡0.109
排名 4 · TkA03G392260 · TK1151
细胞膜0.086
排名 5 · TkA03G392260 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21864MORF_dom1-58 aa
PF01807Zn_ribbon_DnaG10-41 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G392260PF21864MORF_dom1581.2e-1764.3
TkA03G392260PF01807Zn_ribbon_DnaG10410.2511.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAH0拟南芥sp|Q9CAH0|MORF7_ARATH Multiple organellar RNA editing factor 7, mitochondrial66.300%Swiss-Prot高置信
Q9LPZ1拟南芥sp|Q9LPZ1|MORF9_ARATH Multiple organellar RNA editing factor 9, chloroplastic42.900%Swiss-Prot中等置信
Q84JZ6拟南芥sp|Q84JZ6|MORF3_ARATH Multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial45.300%Swiss-Prot中等置信

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