TkA03G386370 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G386370

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 95616856-95617707 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

852 bp · TkA03G386370|TK1151|cDNA

ATGTCGTCATCATCATCATCTCCACAAACCACCGCCAACGGCGGAGAAAACGAAGGCGACTGGGTCTGGAACGAAATCAAAGCCGAAGCTCGCCGCGACGCCGAATCAGAGCCCGCCCTCGCCAGCTACCTCTACTCCACCATCATCTCTCACTCTTCTCTCACACGCTCTCTCTCTTTCCATTTAGGAAACAAACTCTGCTCCTCCACTCTGCTATCCACGCTCCTCTACGATCTCTTCCTCAACACCTTCTCCTCCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

852 bp · TkA03G386370|TK1151|CDS

ATGTCGTCATCATCATCATCTCCACAAACCACCGCCAACGGCGGAGAAAACGAAGGCGACTGGGTCTGGAACGAAATCAAAGCCGAAGCTCGCCGCGACGCCGAATCAGAGCCCGCCCTCGCCAGCTACCTCTACTCCACCATCATCTCTCACTCTTCTCTCACACGCTCTCTCTCTTTCCATTTAGGAAACAAACTCTGCTCCTCCACTCTGCTATCCACGCTCCTCTACGATCTCTTCCTCAACACCTTCTCCTCCGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

283 aa · TkA03G386370|TK1151|PROTEIN

MSSSSSSPQTTANGGENEGDWVWNEIKAEARRDAESEPALASYLYSTIISHSSLTRSLSFHLGNKLCSSTLLSTLLYDLFLNTFSSDASLLSATVADLRAARQRDPACISFAHCLLNYKGFLAIQAHRVAHRLWALNRKPIALALHSRIADVFAVDIHPAARVGKGILLDHATGVVIGETAVVGNNVSILHHVTLGGTGKVGGDRHPKIGDGVLIGAGATVLGNVKIGEGAKIGAGSLVMIDVPPWTTAVGNPARLVGGQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G386370`
TK1151 ID	TkA03G386370
OH-1004 ID	LXL04_008309
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G386370

位置 Chr03:95616856-95617707 (-)

描述 Similar to SAT5: Serine acetyltransferase 5

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g56760`	丝氨酸乙酰转移酶5。	暂无已核实直接文献
`At1g55920`	丝氨酸乙酰转移酶，催化乙酰辅酶A和L-丝氨酸生成O-乙酰-L-丝氨酸。	暂无已核实直接文献
`At3g13110`	线粒体丝氨酸乙酰基转移酶3。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os05g0533500`	可能的丝氨酸乙酰转移酶5。	暂无已核实直接文献
`Os01g0720700`	可能的丝氨酸乙酰转移酶 1。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008309 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006535 L-cysteine biosynthetic process from L-serine 生物过程

GO:0009970 cellular response to sulfate starvation 生物过程

GO:0019344 L-cysteine biosynthetic process 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0008270 zinc ion binding 分子功能

GO:0009001 serine O-acetyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G55920

ath:AT3G13110

ath:AT5G56760

dosa:Os01g0720700

dosa:Os05g0533500

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.469

排名 1 · TkA03G386370 · TK1151

细胞核0.264

排名 2 · TkA03G386370 · TK1151

线粒体0.167

排名 3 · TkA03G386370 · TK1151

过氧化物酶体0.108

排名 4 · TkA03G386370 · TK1151

质体0.094

排名 5 · TkA03G386370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06426SATase_N22-126 aa

PF25087GMPPB_C155-196 aa

PF00132Hexapep158-165 aa

PF14602Hexapep_2173-189 aa

PF00132Hexapep174-196 aa

PF25084LbH_EIF2B176-236 aa

PF00132Hexapep206-239 aa

PF25087GMPPB_C207-235 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G386370	`PF06426`	SATase_N	22	126	1.4e-34	119.2
TkA03G386370	`PF25087`	GMPPB_C	155	196	0.00041	20.8
TkA03G386370	`PF00132`	Hexapep	158	165	2.1e-13	50.0
TkA03G386370	`PF14602`	Hexapep_2	173	189	6e-07	29.8
TkA03G386370	`PF00132`	Hexapep	174	196	2.1e-13	50.0
TkA03G386370	`PF25084`	LbH_EIF2B	176	236	0.12	13.1
TkA03G386370	`PF00132`	Hexapep	206	239	2.1e-13	50.0
TkA03G386370	`PF25087`	GMPPB_C	207	235	0.00041	20.8
TkA03G386370	`PF14602`	Hexapep_2	208	238	6e-07	29.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q42538`	拟南芥	sp\|Q42538\|SAT5_ARATH Serine acetyltransferase 5	85.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q42588`	拟南芥	sp\|Q42588\|SAT1_ARATH Serine acetyltransferase 1, chloroplastic	59.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q39218`	拟南芥	sp\|Q39218\|SAT3_ARATH Serine acetyltransferase 3, mitochondrial	56.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q0DGG8`	水稻	sp\|Q0DGG8\|SAT5_ORYSJ Probable serine acetyltransferase 5	77.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q8W0E4`	水稻	sp\|Q8W0E4\|SAT1_ORYSJ Probable serine acetyltransferase 1	75.400%	Swiss-Prot	高置信

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