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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G381160
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 94003684-94006711 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2938 bp · TkA03G381160|TK1151|cDNA

CTCCCCGGTCCTCTCCCATTCCCGTTCGAGTAGCAAACTAAGCGATTAATTTTCCCAAACTAAAAGATAGTAGAGAAATTAACTCAGAAAGATTTGGGATTTTAATGGCGTAAAATGAAATCAAATCGAGTTAGATGGTGAGGGAATGGCAAGTTCCCAACCATCTAAAAAGGGAATAAAGAACTCCGGTGGAGGTGGTGGTGGAAACTCAGGCCAAAATTTAAAATTTGCCCGACGAACTTCAAGTGGGCGGTATATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1431 bp · TkA03G381160|TK1151|CDS

ATGGCAAGTTCCCAACCATCTAAAAAGGGAATAAAGAACTCCGGTGGAGGTGGTGGTGGAAACTCAGGCCAAAATTTAAAATTTGCCCGACGAACTTCAAGTGGGCGGTATATCACATTATCCAAAGATGAAATTGATTTATCCAGCGACTCATCTGGAAATTACTCGAATTACACAGTTCATATTCCGGCGACTTCCGACGATGAGACATCAGTGGCTACAAAAGCCGAAGAACAATATGTTTCCAATTCGTTATTCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

476 aa · TkA03G381160|TK1151|PROTEIN

MASSQPSKKGIKNSGGGGGGNSGQNLKFARRTSSGRYITLSKDEIDLSSDSSGNYSNYTVHIPATSDDETSVATKAEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDRVIDSKVTHPQMAGSKSSSCGMPACDGKVMKDDRGVDIIPCECRFKICRDCFLDAQKDSGLCPGCKEPYTAEDDDDDPVPYGGTLALPGSMSVIMRQNEEFDHNKRLFNKTSGTYGVGNAYWPPEEDGGKGGGFEDPADKPWRPLTRRIPIDTSIISPYR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G381160
TK1151 IDTkA03G381160
OH-1004 IDLXL04_004764
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.639 / OH-1004 41.667
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G381160
位置Chr03:94003684-94006711 (-)
描述Similar to CSLD4: Cellulose synthase-like protein D4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g38190 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。 暂无已核实直接文献
At3g03050 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。
AtCSLD3, a cellulose synthase-like gene important for root hair growth in arabidopsis.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.2.575

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0345500 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2YU42 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。 暂无已核实直接文献
Os06g0111800 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004764 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009833 plant-type primary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0071669 plant-type cell wall organization or biogenesis 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G03050
ath:AT4G38190
dosa:Os06g0111800
osa:4339895
osa:9271833
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.442
排名 1 · TkA03G381160 · TK1151
内质网0.180
排名 2 · TkA03G381160 · TK1151
细胞质0.160
排名 3 · TkA03G381160 · TK1151
细胞核0.145
排名 4 · TkA03G381160 · TK1151
高尔基体0.142
排名 5 · TkA03G381160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01485IBR117-155 aa
PF14570zf-RING_4122-169 aa
PF14569zf-UDP125-171 aa
PF13639zf-RING_2136-166 aa
PF13923zf-C3HC4_2142-165 aa
PF23475zf-Tbcl_FmdE147-151 aa
PF01485IBR158-174 aa
PF23475zf-Tbcl_FmdE160-173 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G381160PF01485IBR1171551.49.8
TkA03G381160PF14570zf-RING_41221698.4e-1658.2
TkA03G381160PF14569zf-UDP1251710.01116.5
TkA03G381160PF13639zf-RING_21361660.3511.9
TkA03G381160PF13923zf-C3HC4_21421650.06613.8
TkA03G381160PF23475zf-Tbcl_FmdE1471510.2611.5
TkA03G381160PF01485IBR1581741.49.8
TkA03G381160PF23475zf-Tbcl_FmdE1601730.2611.5
TkA03G381160PF03552Cellulose_synt3454619.9e-53180.5
TkA03G381160PF20980lpg1496_N3643950.1512.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZL9拟南芥sp|Q9SZL9|CSLD4_ARATH Cellulose synthase-like protein D469.800%Swiss-Prot高置信
Q9M9M4拟南芥sp|Q9M9M4|CSLD3_ARATH Cellulose synthase-like protein D359.400%Swiss-Prot高置信
Q7EZW6水稻sp|Q7EZW6|CSLD3_ORYSJ Cellulose synthase-like protein D357.800%Swiss-Prot高置信
A2YU42水稻sp|A2YU42|CSLD2_ORYSI Cellulose synthase-like protein D258.300%Swiss-Prot高置信
Q9LHZ7水稻sp|Q9LHZ7|CSLD2_ORYSJ Cellulose synthase-like protein D258.300%Swiss-Prot高置信

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