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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G368140
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 90831127-90835834 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2707 bp · TkA03G368140|TK1151|cDNA

CCTACCAGCCCCCACTTACTGCCTCCACAACCATACCCCCCACCCGCTATTGCGTTTTCTGCGTGGCTTTTTCTCTCTCAGCATCACAGTCCCACACACAGACGAAAAGCGAAGAAAACGTTGCGACTTCATTTCCTCCTTTTGTTTTCTTCGACCCCCTACCCCACATCTATAGTAACAGTTCAGACAATTGAGTAGAAGCAGTAGCAGACATCCACCATCAGCGCCATGGCTAATCCATAGCAGACGCAGAAAAAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2211 bp · TkA03G368140|TK1151|CDS

ATGGTCATGTCGTCTTCGAATGATAATCATCCACCGACTTCTACCAAAGACCTTTTTCCATCTACATCGCTCGCTCTCACTCTCGGGATTTTTCGTGATATAAAGGAGGCGGTGGATGATCGAAAAGAGGGTGGTGCTAATACGACGGTGACGGAGATCAGCAGTGAGTATTCTGGACCGGCGAGATCACGATCGGATGAAGAATTCGACGCTGATCCTGACGTCGATGACGGAGACGACGATAACAATAAGAACAAAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

736 aa · TkA03G368140|TK1151|PROTEIN

MVMSSSNDNHPPTSTKDLFPSTSLALTLGIFRDIKEAVDDRKEGGANTTVTEISSEYSGPARSRSDEEFDADPDVDDGDDDNNKNKSKKRKKYHRHTAEQIREMEALFKESPHPDEKQRQQLSKRLGLHPRQVKFWFQNRRTQIKAIQERHENSILKSEMDKLRDENKLLRDTIKKGTCPNCGFGNKDAMNHIDEQQLHIENAKLKTEIEKLRKSIGKYPQGTSPTNSCSTGNEHENRSSLDLCSGVFGLETSRIMEIVN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G368140
TK1151 IDTkA03G368140
OH-1004 IDLXL04_008474
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G368140
位置Chr03:90831127-90835834 (-)
描述Similar to GL2: Homeobox-leucine zipper protein GLABRA 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g79840 参与表皮细胞身份决定的转录因子（可能）。 暂无已核实直接文献
At4g21750 可能参与胚胎发生过程中细胞规格和模式形成的转录因子。
Identification of a cis-regulatory element for L1 layer-specific gene expression, which is targeted by an L1-specific homeodomain protein.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01047.x
Regulation of shoot epidermal cell differentiation by a pair of homeodomain proteins in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1242/dev.00292
Arabidopsis DELLA and two HD-ZIP transcription factors regulate GA signaling in the epidermis through the L1 box cis-element.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.127647
At4g04890 可能结合L1盒DNA序列5′-TAAATG[CT]A-3′的转录因子。
Regulation of shoot epidermal cell differentiation by a pair of homeodomain proteins in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1242/dev.00292
Mutations in epidermis-specific HD-ZIP IV genes affect floral organ identity in Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12211
Arabidopsis DELLA and two HD-ZIP transcription factors regulate GA signaling in the epidermis through the L1 box cis-element.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.127647

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0760800 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os02g0674800 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008474 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010062 negative regulation of trichoblast fate specification 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0048497 maintenance of floral organ identity 生物过程
GO:0048825 cotyledon development 生物过程
GO:0090627 plant epidermal cell differentiation 生物过程
GO:0090628 plant epidermal cell fate specification 生物过程
GO:2000033 regulation of seed dormancy process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G79840
ath:AT4G04890
ath:AT4G21750
dosa:Os01g0760800
dosa:Os08g0187500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.899
排名 1 · TkA03G368140 · TK1151
细胞质0.140
排名 2 · TkA03G368140 · TK1151
细胞膜0.047
排名 3 · TkA03G368140 · TK1151
内质网0.024
排名 4 · TkA03G368140 · TK1151
质体0.021
排名 5 · TkA03G368140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02724CDC458-166 aa
PF28121VPA126784-109 aa
PF12824MRP-L2085-153 aa
PF29997SPC25_N88-124 aa
PF00046Homeodomain90-145 aa
PF14208DUF432090-140 aa
PF05920Homeobox_KN111-142 aa
PF25966Myo5a116-174 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G368140PF02724CDC4581664.16.3
TkA03G368140PF28121VPA1267841093.08.7
TkA03G368140PF12824MRP-L20851530.07613.9
TkA03G368140PF29997SPC25_N881240.6611.0
TkA03G368140PF00046Homeodomain901452.4e-1969.6
TkA03G368140PF14208DUF4320901400.113.3
TkA03G368140PF05920Homeobox_KN1111429e-0626.2
TkA03G368140PF25966Myo5a1161740.001819.0
TkA03G368140PF29997SPC25_N1192140.6611.0
TkA03G368140PF23204KIF21A_2nd1381500.01216.6
TkA03G368140PF28121VPA12671381763.08.7
TkA03G368140PF04977DivIC1431760.5510.8
TkA03G368140PF12808Mto2_bdg1431763.08.9
TkA03G368140PF29363ENTR11471761.49.2
TkA03G368140PF23204KIF21A_2nd1512120.01216.6
TkA03G368140PF07989Cnn_1N1511760.2112.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P46607拟南芥sp|P46607|HGL2_ARATH Homeobox-leucine zipper protein GLABRA 258.400%Swiss-Prot高置信
Q8RWU4拟南芥sp|Q8RWU4|ATML1_ARATH Homeobox-leucine zipper protein MERISTEM L143.400%Swiss-Prot中等置信
Q93V99拟南芥sp|Q93V99|PDF2_ARATH Homeobox-leucine zipper protein PROTODERMAL FACTOR 244.200%Swiss-Prot中等置信
Q5JMF3水稻sp|Q5JMF3|ROC9_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein ROC947.800%Swiss-Prot中等置信
Q6EPF0水稻sp|Q6EPF0|ROC5_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein ROC542.100%Swiss-Prot中等置信

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