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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G358430
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 88425356-88428201 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1503 bp · TkA03G358430|TK1151|cDNA

ATGGTTGAAGAAAGGTACGCCACAGAAGTCACGAAGTGTACGCATTCACAGACAGGAAGAAATGGGAACAAGAACGATAGAAGACAGATAACCGCAATCGAAATTAAAGAAATTCCAGATACAGATAGGGCTGAATCGAGTACCAGAAATTTCGCAAGCATGTGGTGGGCAGACCTAAAAGCAGCAATAGGGCAAAGGATTAACGTCGAGGGACTGCTGTTTTCGGTATCGGTGATTACTAGAAACAAGAAATGGGTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1503 bp · TkA03G358430|TK1151|CDS

ATGGTTGAAGAAAGGTACGCCACAGAAGTCACGAAGTGTACGCATTCACAGACAGGAAGAAATGGGAACAAGAACGATAGAAGACAGATAACCGCAATCGAAATTAAAGAAATTCCAGATACAGATAGGGCTGAATCGAGTACCAGAAATTTCGCAAGCATGTGGTGGGCAGACCTAAAAGCAGCAATAGGGCAAAGGATTAACGTCGAGGGACTGCTGTTTTCGGTATCGGTGATTACTAGAAACAAGAAATGGGTGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

500 aa · TkA03G358430|TK1151|PROTEIN

MVEERYATEVTKCTHSQTGRNGNKNDRRQITAIEIKEIPDTDRAESSTRNFASMWWADLKAAIGQRINVEGLLFSVSVITRNKKWVMPHLSVRDIRYIDWDALRRKGYEGVVFDKDNTLTAPYSLALWGPLAASVESCKSVFGNNIAVFSNSAGLEEYDPDGRKARALEYVIGIRVIRHILTNVFVYVTLEMKKPAGSAEEIGKHFGCDSSKLIMVGDRPFTDIVYGNGIFVLCDNDRDGALSDAELNDFQVKCFNAPLQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G358430
TK1151 IDTkA03G358430
OH-1004 IDLXL04_013766
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.400 / OH-1004 83.966
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G358430
位置Chr03:88425356-88428201 (+)
描述Similar to MIRO1: Mitochondrial Rho GTPase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g27540 线粒体 GTP 酶需要维持线粒体的正常发育、形态和细胞内分布，而这对于胚胎细胞分裂、单倍体雄性和雌性配子的发育以及花粉管生长的进展至关重要。
EMB2473/MIRO1, an Arabidopsis Miro GTPase, is required for embryogenesis and influences mitochondrial morphology in pollen.2008 · DOI: 10.1105/tpc.107.055756
MIRO1 influences the morphology and intracellular distribution of mitochondria during embryonic cell division in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1007/s00299-010-0926-5
Arabidopsis thaliana MIRO1 and MIRO2 GTPases are unequally redundant in pollen tube growth and fusion of polar nuclei during female gametogenesis.2011 · DOI: 10.1371/journal.pone.0018530
At3g63150 钙结合线粒体GTP酶，参与盐胁迫响应期间的钙信号传导。
Arabidopsis thaliana MIRO1 and MIRO2 GTPases are unequally redundant in pollen tube growth and fusion of polar nuclei during female gametogenesis.2011 · DOI: 10.1371/journal.pone.0018530
At3g58830 磷脂甘油磷酸（PGP）磷酸酶，参与磷脂甘油（PG）的生物合成，PG是一种主要存在于叶绿体类囊体膜中的磷酸甘油脂，具有重要的光合作用功能；似乎以PGP 34:3、PGP 34:2和PGP 34:1为底物。
Arabidopsis phosphatidylglycerophosphate phosphatase 1 involved in phosphatidylglycerol biosynthesis and photosynthetic function.2016 · DOI: 10.1111/tpj.13311
Identification and characterization of a plastidial phosphatidylglycerophosphate phosphatase in Arabidopsis thaliana.2017 · DOI: 10.1111/tpj.13378
Phosphatidylglycerophosphate phosphatase is required for root growth in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1016/j.bbalip.2018.02.007
At3g05310 线粒体 GTP 酶，可能参与线粒体发育。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013766 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006655 phosphatidylglycerol biosynthetic process 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0008610 lipid biosynthetic process 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程
GO:0015979 photosynthesis 生物过程
GO:0019725 cellular homeostasis 生物过程
GO:0046486 glycerolipid metabolic process 生物过程
GO:0046839 phospholipid dephosphorylation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05310
ath:AT3G58830
ath:AT3G63150
ath:AT5G27540
dre:327143
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.208
排名 1 · TkA03G358430 · TK1151
内质网0.207
排名 2 · TkA03G358430 · TK1151
质体0.181
排名 3 · TkA03G358430 · TK1151
线粒体0.167
排名 4 · TkA03G358430 · TK1151
细胞核0.134
排名 5 · TkA03G358430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14788EF-hand_102-20 aa
PF09419PGP_phosphatase74-228 aa
PF00702Hydrolase109-131 aa
PF13405EF-hand_6113-118 aa
PF00036EF-hand_1113-117 aa
PF00036EF-hand_1156-162 aa
PF00702Hydrolase189-224 aa
PF13242Hydrolase_like197-228 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G358430PF14788EF-hand_102200.06813.9
TkA03G358430PF09419PGP_phosphatase742282.4e-35122.3
TkA03G358430PF00702Hydrolase1091310.1613.1
TkA03G358430PF13405EF-hand_61131183.1e-0524.1
TkA03G358430PF00036EF-hand_11131174.9e-0523.3
TkA03G358430PF00036EF-hand_11561624.9e-0523.3
TkA03G358430PF00702Hydrolase1892240.1613.1
TkA03G358430PF13242Hydrolase_like1972280.001918.8
TkA03G358430PF14788EF-hand_102252500.06813.9
TkA03G358430PF13405EF-hand_62302483.1e-0524.1
TkA03G358430PF13499EF-hand_72302613.9e-0524.6
TkA03G358430PF00036EF-hand_12302494.9e-0523.3
TkA03G358430PF23564EF-hand_FSTL12302500.01516.4
TkA03G358430PF13833EF-hand_82322470.5810.7
TkA03G358430PF13202EF-hand_52352502.2e-0524.4
TkA03G358430PF08356EF_assoc_22583426.1e-31107.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RXF8拟南芥sp|Q8RXF8|MIRO1_ARATH Mitochondrial Rho GTPase 168.800%Swiss-Prot低置信
F4J0W4拟南芥sp|F4J0W4|MIRO2_ARATH Mitochondrial Rho GTPase 257.700%Swiss-Prot低置信
Q9LXR9拟南芥sp|Q9LXR9|PGPP1_ARATH Phosphatidylglycerophosphate phosphatase 1, chloroplastic/mitochondrial64.600%Swiss-Prot低置信
Q9MA88拟南芥sp|Q9MA88|MIRO3_ARATH Mitochondrial Rho GTPase 352.200%Swiss-Prot低置信

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