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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G336300
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 82743065-82744261 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1119 bp · TkA03G336300|TK1151|cDNA

TTGCTTCCCCCTCCACAAAATCAGATTAAACGCAGTTTTTCTCCCATTTCTGCACATCTTCATTCCTCCACTTTCTCTCTACTCCACACACAGACCAAACCCCAGTGTTTAGCAATGGCGAAAACAAGCAACATTTTGACCACAATCCTGAACGTACTGACCTTACTCCTAGGAGTCCTCCTCATCATCGGCGCAATATGGACCGGCGTCCACCCCGGCGACGAGACCCTCTGTGAAAAAACCTTTTCCAAACCCTACTT...

CDS

下载 CDS FASTA

924 bp · TkA03G336300|TK1151|CDS

TTGCTTCCCCCTCCACAAAATCAGATTAAACGCAGTTTTTCTCCCATTTCTGCACATCTTCATTCCTCCACTTTCTCTCTACTCCACACACAGACCAAACCCCAGTGTTTAGCAATGGCGAAAACAAGCAACATTTTGACCACAATCCTGAACGTACTGACCTTACTCCTAGGAGTCCTCCTCATCATCGGCGCAATATGGACCGGCGTCCACCCCGGCGACGAGACCCTCTGTGAAAAAACCTTTTCCAAACCCTACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

307 aa · TkA03G336300|TK1151|PROTEIN

LLPPPQNQIKRSFSPISAHLHSSTFSLLHTQTKPQCLAMAKTSNILTTILNVLTLLLGVLLIIGAIWTGVHPGDETLCEKTFSKPYLFTGIFLVVLAVLGIVGASFKINAILYIYSTVLFIMILGLVAFAIFALVVTNKRIGKAVSGQGFQEYRFGDYSKWLQKHVVNEKNWGKIKSCLTGSRICTAIAQSKNSTEAFYRNNLTPLESGCCKPPGDCNFEFVNATFWEAPKSGIKSQDPDCTTWSNNQKKLCYNCESCKA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G336300
TK1151 IDTkA03G336300
OH-1004 IDLXL04_008764
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G336300
位置Chr03:82743065-82744261 (-)
描述Similar to TET8: Tetraspanin-8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g23810 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献
At1g18520 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献
At4g30430 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献
At2g19580 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献
At5g60220 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008764 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006890 retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0050829 defense response to Gram-negative bacterium 生物过程
GO:0090110 COPII-coated vesicle cargo loading 生物过程
GO:0099039 sphingolipid translocation 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0070062 extracellular exosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18520
ath:AT2G23810
ath:AT3G45600
ath:AT4G28050
ath:AT4G30430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.752
排名 1 · TkA03G336300 · TK1151
细胞质0.129
排名 2 · TkA03G336300 · TK1151
溶酶体／液泡0.098
排名 3 · TkA03G336300 · TK1151
内质网0.083
排名 4 · TkA03G336300 · TK1151
高尔基体0.047
排名 5 · TkA03G336300 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20237DUF659413-119 aa
PF19592DUF609728-107 aa
PF30689TMEM11637-153 aa
PF27259AF_149942-140 aa
PF00335Tetraspanin44-294 aa
PF27864Mollicut_2TM56-57 aa
PF27864Mollicut_2TM74-136 aa
PF27655GDU_TM85-95 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G336300PF20237DUF6594131190.06413.9
TkA03G336300PF19592DUF6097281077.77.5
TkA03G336300PF30689TMEM116371530.00516.8
TkA03G336300PF27259AF_1499421400.03814.7
TkA03G336300PF00335Tetraspanin442946.8e-31108.4
TkA03G336300PF27864Mollicut_2TM56573.98.5
TkA03G336300PF27864Mollicut_2TM741363.98.5
TkA03G336300PF27655GDU_TM85950.01815.6
TkA03G336300PF27655GDU_TM1221410.01815.6
TkA03G336300PF19592DUF60972722937.77.5
TkA03G336300PF27864Mollicut_2TM2732983.98.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8S8Q6拟南芥sp|Q8S8Q6|TET8_ARATH Tetraspanin-844.500%Swiss-Prot中等置信
Q9LPR6拟南芥sp|Q9LPR6|TET11_ARATH Tetraspanin-1144.500%Swiss-Prot中等置信
Q9M0B7拟南芥sp|Q9M0B7|TET9_ARATH Tetraspanin-938.800%Swiss-Prot中等置信
Q9ZUN5拟南芥sp|Q9ZUN5|TET2_ARATH Tetraspanin-238.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LSS4拟南芥sp|Q9LSS4|TET4_ARATH Tetraspanin-436.800%Swiss-Prot中等置信

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