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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G299050
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 73583920-73590464 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1014 bp · TkA03G299050|TK1151|cDNA

ATGATAAAAAGTAAAAACTATCCATATATATGTGGACGATGTTATGGTTCAGATGCATCGGATTTGAAGGGGCCAATCAAGTATAATTATCATGATTTGCAGTTCGCAACCAACAATTTCTCCCAAGAGAATATTCTAGGTAGAGGAAGTTTTGGTGAAGTGTTCAAGGCAACCCTTGATGGTAAAAATGTTGTGGCGGTGAAGAAACTCCGAGTAGATCATGCCAGAGTAAAAACTGAATTTGAGAATGAAGTTAAGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1014 bp · TkA03G299050|TK1151|CDS

ATGATAAAAAGTAAAAACTATCCATATATATGTGGACGATGTTATGGTTCAGATGCATCGGATTTGAAGGGGCCAATCAAGTATAATTATCATGATTTGCAGTTCGCAACCAACAATTTCTCCCAAGAGAATATTCTAGGTAGAGGAAGTTTTGGTGAAGTGTTCAAGGCAACCCTTGATGGTAAAAATGTTGTGGCGGTGAAGAAACTCCGAGTAGATCATGCCAGAGTAAAAACTGAATTTGAGAATGAAGTTAAGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

337 aa · TkA03G299050|TK1151|PROTEIN

MIKSKNYPYICGRCYGSDASDLKGPIKYNYHDLQFATNNFSQENILGRGSFGEVFKATLDGKNVVAVKKLRVDHARVKTEFENEVKLISHVHHRNLLRLLGWSSEGSDLLLVLEYMPNGSLDQFLWGARKGTLDWNQRYAIICGIATGLAHLHNEFHVKIIHRDIKSTNILLTHDFKPKIADFGLARFQPEDQSHVITKFAGTLGYTAPEYALKGVLSDKVDTYSFGVVILEIISGRRSTQVNKSSSEFLLEHAWKSYEN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G299050
TK1151 IDTkA03G299050
OH-1004 IDLXL04_008986
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 76.261 / OH-1004 63.614
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G299050
位置Chr03:73583920-73590464 (+)
描述Similar to CRK3: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g56130 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56130。 暂无已核实直接文献
At1g70520 富半胱氨酸受体样蛋白激酶2。 暂无已核实直接文献
At1g56140 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56140。 暂无已核实直接文献
At4g11530 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 34。 暂无已核实直接文献
At4g23140 富半胱氨酸受体样蛋白激酶 6。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008986 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0052545 callose localization 生物过程
GO:0072593 reactive oxygen species metabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G56130
ath:AT1G70520
ath:AT1G70530
ath:AT4G23230
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.559
排名 1 · TkA03G299050 · TK1151
细胞质0.382
排名 2 · TkA03G299050 · TK1151
细胞核0.233
排名 3 · TkA03G299050 · TK1151
高尔基体0.039
排名 4 · TkA03G299050 · TK1151
内质网0.038
排名 5 · TkA03G299050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17667Pkinase_fungal33-80 aa
PF12330Haspin_kinase39-83 aa
PF00069Pkinase41-305 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr42-307 aa
PF03109ABC144-91 aa
PF31041DUF878157-111 aa
PF23428DUF711567-82 aa
PF01636APH70-153 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G299050PF17667Pkinase_fungal33800.002117.6
TkA03G299050PF12330Haspin_kinase39830.06313.0
TkA03G299050PF00069Pkinase413051.4e-47163.1
TkA03G299050PF07714PK_Tyr_Ser-Thr423071.7e-47162.6
TkA03G299050PF03109ABC144911.7e-0524.8
TkA03G299050PF31041DUF8781571110.1812.5
TkA03G299050PF23428DUF711567820.09613.3
TkA03G299050PF01636APH701530.1712.3
TkA03G299050PF12330Haspin_kinase1351960.06313.0
TkA03G299050PF31041DUF87811491920.1812.5
TkA03G299050PF01636APH1501880.1712.3
TkA03G299050PF03109ABC11521961.7e-0524.8
TkA03G299050PF17667Pkinase_fungal1532090.002117.6
TkA03G299050PF23428DUF71152112430.09613.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGH2拟南芥sp|C0LGH2|Y1561_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5613045.800%Swiss-Prot中等置信
Q9CAL3拟南芥sp|Q9CAL3|CRK2_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 245.500%Swiss-Prot中等置信
C0LGH3拟南芥sp|C0LGH3|Y5614_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5614045.900%Swiss-Prot中等置信
Q9LDQ3拟南芥sp|Q9LDQ3|CRK34_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 3444.300%Swiss-Prot中等置信
Q9C5S9拟南芥sp|Q9C5S9|CRK6_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 644.200%Swiss-Prot中等置信

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