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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G178780
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 45129728-45132600 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1379 bp · TkA03G178780|TK1151|cDNA

CACTGAGACTCCTTTCTAACAAAATCATGTAAAGCGTGAAGACGGAGTTCGAAATTAGACAGAGGAGAACAAGAAGATAAAGCAAAGGTGAATCGTAACTGATCTGCAAGGTCTCATCCTCAATGGCGCCGACCAAATCTAAACCATCGAATTCAAAGAATTATTCAGAAAACTCAGGTGTTAACAAAAAAATATGGTTCTATTCGTTGTTGCTTACAATTCAATATGGTGCTCAGCCTCTCATCTCCAAACGCTGCATC...

CDS

下载 CDS FASTA

996 bp · TkA03G178780|TK1151|CDS

ATGGCGCCGACCAAATCTAAACCATCGAATTCAAAGAATTATTCAGAAAACTCAGGTGTTAACAAAAAAATATGGTTCTATTCGTTGTTGCTTACAATTCAATATGGTGCTCAGCCTCTCATCTCCAAACGCTGCATCGGGCGAGAAGTGATTGTGACTTCATCTGTTTTGGCATGCGAGTTAGTAAAGGTTATTTGTGCAATTGGTTTAATGGCAAAAGATGGGAGTCTAAAAAGAGCAATGAAGGAATGGACTTTGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

331 aa · TkA03G178780|TK1151|PROTEIN

MAPTKSKPSNSKNYSENSGVNKKIWFYSLLLTIQYGAQPLISKRCIGREVIVTSSVLACELVKVICAIGLMAKDGSLKRAMKEWTLMGSLSASGLPAAIYALQNSLLQISYRNLDSLTFSMLNQTKLIFTAFFTYIILRQKQSYQQIGALLILILAAVLLSIGEGSRKNYGSDNRDEIVLYGIVPVLIASVLSGLASALCQWASQVKKHSSYLMTVEMSIVGSLCLLASISKSPDGQAMRQHGFFHGWTPLTFIPVFINA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G178780
TK1151 IDTkA03G178780
OH-1004 IDLXL04_007456
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G178780
位置Chr03:45129728-45132600 (-)
描述Similar to ROCK1: UDP-N-acetylglucosamine transporter ROCK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65000 介导 UDP 连接的乙酰化己糖胺穿过内质网 膜的运输。
Arabidopsis ROCK1 transports UDP-GlcNAc/UDP-GalNAc and regulates ER protein quality control and cytokinin activity.2015 · DOI: 10.1073/pnas.1419050112

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007456 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
GO:0015739 sialic acid transport 生物过程
GO:0015789 UDP-N-acetylgalactosamine transmembrane transport 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:1902183 regulation of shoot apical meristem development 生物过程
GO:1904293 negative regulation of ERAD pathway 生物过程
GO:1990569 UDP-N-acetylglucosamine transmembrane transport 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G65000
bta:520918
cfa:442991
mmu:229782
rno:310808
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.625
排名 1 · TkA03G178780 · TK1151
内质网0.241
排名 2 · TkA03G178780 · TK1151
细胞质0.083
排名 3 · TkA03G178780 · TK1151
溶酶体／液泡0.047
排名 4 · TkA03G178780 · TK1151
细胞膜0.041
排名 5 · TkA03G178780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00892EamA26-161 aa
PF16913PUNUT27-75 aa
PF04142Nuc_sug_transp47-319 aa
PF14808TMEM16459-158 aa
PF30375OpgB_N85-162 aa
PF16913PUNUT98-225 aa
PF14808TMEM164121-227 aa
PF20040DUF6442125-158 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G178780PF00892EamA261610.0001123.2
TkA03G178780PF16913PUNUT27751.7e-1041.4
TkA03G178780PF04142Nuc_sug_transp473191.7e-33116.8
TkA03G178780PF14808TMEM164591581.39.2
TkA03G178780PF30375OpgB_N851620.1912.5
TkA03G178780PF16913PUNUT982251.7e-1041.4
TkA03G178780PF14808TMEM1641212271.39.2
TkA03G178780PF20040DUF64421251580.8110.7
TkA03G178780PF12648TcpE1461930.4311.8
TkA03G178780PF00892EamA1813170.0001123.2
TkA03G178780PF30375OpgB_N1832370.1912.5
TkA03G178780PF20040DUF64422052280.8110.7
TkA03G178780PF12648TcpE2493040.4311.8
TkA03G178780PF20040DUF64422753290.8110.7
TkA03G178780PF30375OpgB_N2813160.1912.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LES0拟南芥sp|Q8LES0|ROCK1_ARATH UDP-N-acetylglucosamine transporter ROCK177.000%Swiss-Prot高置信

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