TkA03G166050 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G166050

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 42078778-42092311 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

5356 bp · TkA03G166050|TK1151|cDNA

AAATGAACCAAACCCCATGGATCGAACTTGGCTCGGTTCGCTTCAGGCCTCGACTCGTTGATGGCGCGCTTCTGCACGGCACACGTGCATAGCAACTAGACAAAACTGGTTTTTCTCTTGCTTCGCCATTACTGACTCTGATACTAAGAAGATCTGTAAGCGAAAAATCTGAGCTCAAGATTTCGATCGGTCGAATCAACCACAGAGACATATGTTTGAATAGAGAAATAGAGGAAGGGGATGGCTTTCATGGCGGTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

4854 bp · TkA03G166050|TK1151|CDS

ATGGCTTTCATGGCGGTTTTGGAGTCAGATCTACGCGCCCTCTCCGCCGAAGCACGCCGTAGGTACCCCGCCATCAAAGACGGAGCAGAGCACGCTATCTTGAAGCTCCGGTCCTTGTCAAGTTCTAGTGAAATTGCACAGCATGATGATATTCTGAGGATATTTTTGATGGCATGCGAAGTTAAGACAGTTAAACTGAGTGTCATTGGTTTATCCTGCTTGCAAAAGCTCATAGCACATGATGCTGTATCCCCTTCAGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1617 aa · TkA03G166050|TK1151|PROTEIN

MAFMAVLESDLRALSAEARRRYPAIKDGAEHAILKLRSLSSSSEIAQHDDILRIFLMACEVKTVKLSVIGLSCLQKLIAHDAVSPSALNEILATLKDHGEMADEGVQLKTLQTVLIIFQSRLQPDGEEHTAQALGICLHLLENNKSSDSVRNTAAATFRQAVALIFDHVVSSESLPSVKSVLGGYMSRSSSVSSDINHSIKYSKSMEEGLMSLDKSKMRENPTKAGKLGLRLLEDLTALAAGGSAIWLRVGSIQRAFALD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G166050`
TK1151 ID	TkA03G166050
OH-1004 ID	LXL04_007413
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA03G166050`
位置	Chr03:42078778-42092311 (-)
描述	Similar to mon2: Protein MON2 homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_007413` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006623 protein targeting to vacuole 生物过程 GO:0006895 Golgi to endosome transport 生物过程 GO:0015031 protein transport 生物过程 GO:0030036 actin cytoskeleton organization 生物过程 GO:0042147 retrograde transport, endosome to Golgi 生物过程 GO:1905279 regulation of retrograde transport, endosome to Golgi 生物过程 GO:0005768 endosome 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0031901 early endosome membrane 细胞组分 GO:0036019 endolysosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	dme:Dmel_CG8683 dpo:4816705 hsa:23041 xla:444214 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.530

排名 1 · TkA03G166050 · TK1151

高尔基体0.368

排名 2 · TkA03G166050 · TK1151

细胞核0.166

排名 3 · TkA03G166050 · TK1151

细胞膜0.133

排名 4 · TkA03G166050 · TK1151

溶酶体／液泡0.100

排名 5 · TkA03G166050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16213DCB3-170 aa

PF25780TPR_IPO5115-163 aa

PF03810IBN_N129-167 aa

PF00514Arm133-156 aa

PF02985HEAT139-160 aa

PF13513HEAT_EZ146-160 aa

PF12783Sec7-like_HUS231-386 aa

PF09324Sec7-like_HDS305-340 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G166050	`PF16213`	DCB	3	170	5.4e-40	137.7
TkA03G166050	`PF25780`	TPR_IPO5	115	163	0.0031	18.5
TkA03G166050	`PF03810`	IBN_N	129	167	0.062	14.0
TkA03G166050	`PF00514`	Arm	133	156	0.42	11.5
TkA03G166050	`PF02985`	HEAT	139	160	0.0028	18.5
TkA03G166050	`PF13513`	HEAT_EZ	146	160	0.00062	21.0
TkA03G166050	`PF12783`	Sec7-like_HUS	231	386	2.7e-22	80.0
TkA03G166050	`PF09324`	Sec7-like_HDS	305	340	5.3e-09	36.6
TkA03G166050	`PF13646`	HEAT_2	382	420	0.18	12.8
TkA03G166050	`PF00514`	Arm	388	414	0.42	11.5
TkA03G166050	`PF23325`	TPR_28	492	534	7.5e-07	29.9
TkA03G166050	`PF09324`	Sec7-like_HDS	497	522	5.3e-09	36.6
TkA03G166050	`PF16213`	DCB	570	600	5.4e-40	137.7
TkA03G166050	`PF00514`	Arm	597	606	0.42	11.5
TkA03G166050	`PF09324`	Sec7-like_HDS	599	627	5.3e-09	36.6
TkA03G166050	`PF10041`	DUF2277	633	689	0.22	12.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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