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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G094840
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 24070517-24072177 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1372 bp · TkA03G094840|TK1151|cDNA

AAACATACCCCAAATTCCCTTGTTATATAATAACCCAAAAGCACCTGCTTCTTCCATGAACACCTTTCTACACTTTTAGTTTCAGAATGATGCAACAACCAAGCGGTCAACAAGGTCTCCTCCAAGATCTCTTACCACCATTTACAGAAACTTGGTCGACATATCAAAATCCTCAAGAACTTTCCGCCATTGACACTCAATTATTCCCATCTCAAGAACATGATTTTCTGCTATTACCTTCTTCTTCTTCTTCTCCCTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

960 bp · TkA03G094840|TK1151|CDS

ATGATGCAACAACCAAGCGGTCAACAAGGTCTCCTCCAAGATCTCTTACCACCATTTACAGAAACTTGGTCGACATATCAAAATCCTCAAGAACTTTCCGCCATTGACACTCAATTATTCCCATCTCAAGAACATGATTTTCTGCTATTACCTTCTTCTTCTTCTTCTCCCTCATACATGCAACTCATCTCCTCCCCTATACAACCCACATTCCAATCGCTTTACAACGATGAATCAATCTACTGTTTTGATTCCTTCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

319 aa · TkA03G094840|TK1151|PROTEIN

MMQQPSGQQGLLQDLLPPFTETWSTYQNPQELSAIDTQLFPSQEHDFLLLPSSSSSPSYMQLISSPIQPTFQSLYNDESIYCFDSFTPLNDSISPSYDHQLMVPLMAEEEEEDDDDRDGCQNAGSHDQISTVFTMGSNGEKKSNKSKKVEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTSILGDTIDYMKELLERINNLKEQDIESDMDARFKKFNMNESQARNPPKFNVERGNTDTQIHICCSTKPGLLLS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G094840
TK1151 IDTkA03G094840
OH-1004 IDLXL04_006947
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G094840
位置Chr03:24070517-24072177 (-)
描述Similar to BHLH93: Transcription factor bHLH93
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65640 转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g10570 转录因子 bHLH61。 暂无已核实直接文献
At1g12860 可能通过控制 SPCH、MUTE 和 FAMA 的连续作用在表皮中介导气孔分化。
SCREAM/ICE1 and SCREAM2 specify three cell-state transitional steps leading to arabidopsis stomatal differentiation.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.060848

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0135700 参与防御反应的转录因子，功能在RAC1下游，PAL1和WRKY19基因上游。
The bHLH Rac Immunity1 (RAI1) Is Activated by OsRac1 via OsMAPK3 and OsMAPK6 in Rice Immunity.2012 · DOI: 10.1093/pcp/pcs033
Os10g0544200 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006947 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0010371 regulation of gibberellin biosynthetic process 生物过程
GO:0010444 guard mother cell differentiation 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0045487 gibberellin catabolic process 生物过程
GO:0050826 response to freezing 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12860
ath:AT5G10570
ath:AT5G65640
dosa:Os03g0135700
dosa:Os10g0544200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.966
排名 1 · TkA03G094840 · TK1151
细胞质0.117
排名 2 · TkA03G094840 · TK1151
细胞膜0.027
排名 3 · TkA03G094840 · TK1151
内质网0.021
排名 4 · TkA03G094840 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA03G094840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00010HLH12-37 aa
PF02724CDC4571-182 aa
PF27722YqfB129-213 aa
PF00010HLH158-200 aa
PF23177bHLH_IRO3158-222 aa
PF24235RHG29_45_N159-219 aa
PF23173bHLH_SAC51160-200 aa
PF23176bHLH_LHW162-198 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G094840PF00010HLH12372.9e-1040.5
TkA03G094840PF02724CDC45711820.1710.9
TkA03G094840PF27722YqfB1292130.05114.7
TkA03G094840PF00010HLH1582002.9e-1040.5
TkA03G094840PF23177bHLH_IRO31582227.5e-0730.1
TkA03G094840PF24235RHG29_45_N1592190.1313.3
TkA03G094840PF23173bHLH_SAC511602006.5e-0523.5
TkA03G094840PF23176bHLH_LHW1621980.01915.7
TkA03G094840PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant2373064.8e-0833.7
TkA03G094840PF26956ACT_ACR_D12452840.1113.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSL1拟南芥sp|Q9LSL1|BH093_ARATH Transcription factor bHLH9365.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LXA9拟南芥sp|Q9LXA9|BH061_ARATH Transcription factor bHLH6151.100%Swiss-Prot高置信
Q9LPW3拟南芥sp|Q9LPW3|SCRM2_ARATH Transcription factor SCREAM247.400%Swiss-Prot中等置信
Q10S44水稻sp|Q10S44|BH003_ORYSJ Transcription factor BHLH362.200%Swiss-Prot中等置信
Q336V8水稻sp|Q336V8|BH004_ORYSJ Basic helix-loop-helix protein 00453.200%Swiss-Prot中等置信

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