TkA03G059730 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G059730

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 15347105-15352683 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3878 bp · TkA03G059730|TK1151|cDNA

ATATAAAACATTTTCGATTCACGCGGTGTAAACGCGTTTCAGGCTCTAACACGTCGAAAAAGGGAATAGAGACCCTACTCTGGTCTTTCTACAAAAACACAAAGCAATCCATTGGAACCTTCGCTCCAATTTCCTCTCAACTAGGATGACTGATAGCCCAATCAGCCATTCTCTTTCACCTGCTTCAACAATCGCGTTTTTGCTATCGTTTTTTGAATTTGGTATTCGTACAGAAGTCTTACGAAGTTTCTTCGACCTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

3018 bp · TkA03G059730|TK1151|CDS

ATGGAGAATTACTTGAATGAGAATTTCGGCGGAGTGAAGCCGAAGAATTCGTCGGAGGAGGTGTTACAGAGATGGAGGAAGATGTGTGGTCTTGTGAAGAACCCTAAACGAAGGTTCCGTTTCACGGCCAACCTCAGTAAGCGTAACGAGGCTGCTGCTATGCGTCGCACCAATCAGAAGTTGAGGGTTGCGGTTTTGGTGTCGAAGGCAGCATTTCAGTTTGCAAAATTCGCGGAACCCAGTGATTATACGTTACCCGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1005 aa · TkA03G059730|TK1151|PROTEIN

MENYLNENFGGVKPKNSSEEVLQRWRKMCGLVKNPKRRFRFTANLSKRNEAAAMRRTNQKLRVAVLVSKAAFQFAKFAEPSDYTLPDEFKEAGFDISADEAGAVVENHDPVKLKFYGGVDGLAKKLKTCTTKGIAIDDKDLTRRKELFGTNEFTEREQRSFWVFVWEAFQDMTLMVLAACAIVSLIVGVATEGWPKGAHDGLGIVASILLVVFVTATSDYRQSLQFRDLDKEKKKISIQVTREGYRQKLSIYELLPGDIV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G059730`
TK1151 ID	TkA03G059730
OH-1004 ID	LXL04_007935
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	70.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 99.708 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G059730

位置 Chr03:15347105-15352683 (+)

描述 Similar to ACA1: Calcium-transporting ATPase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g37640`	这种镁依赖性酶催化ATP的水解，同时将钙从胞质转运到内质网。	暂无已核实直接文献
`At2g22950`	这种依赖镁的酶催化ATP水解，并伴随钙离子从胞质转运出细胞或进入细胞器。	暂无已核实直接文献
`At1g27770`	这种依赖镁的酶催化ATP水解，并伴随钙离子从胞质转运出细胞或进入细胞器。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os12g0586600`	这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。	暂无已核实直接文献
`Os03g0616400`	这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007935 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0070588 calcium ion transmembrane transport 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005262 calcium channel activity 分子功能

GO:0005388 P-type calcium transporter activity 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G27770

ath:AT2G22950

ath:AT4G37640

dosa:Os03g0616400

dosa:Os12g0586600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.414

排名 1 · TkA03G059730 · TK1151

内质网0.235

排名 2 · TkA03G059730 · TK1151

溶酶体／液泡0.161

排名 3 · TkA03G059730 · TK1151

高尔基体0.138

排名 4 · TkA03G059730 · TK1151

细胞质0.118

排名 5 · TkA03G059730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12515CaATP_NAI5-50 aa

PF00702Hydrolase13-33 aa

PF00690Cation_ATPase_N117-184 aa

PF00689Cation_ATPase_C169-226 aa

PF00122E1-E2_ATPase236-333 aa

PF00689Cation_ATPase_C351-399 aa

PF24380DUF7536355-384 aa

PF00702Hydrolase450-757 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G059730	`PF12515`	CaATP_NAI	5	50	2.9e-22	78.6
TkA03G059730	`PF00702`	Hydrolase	13	33	3.4e-14	54.4
TkA03G059730	`PF00690`	Cation_ATPase_N	117	184	1.4e-14	54.2
TkA03G059730	`PF00689`	Cation_ATPase_C	169	226	1.4e-45	156.0
TkA03G059730	`PF00122`	E1-E2_ATPase	236	333	6.5e-22	78.0
TkA03G059730	`PF00689`	Cation_ATPase_C	351	399	1.4e-45	156.0
TkA03G059730	`PF24380`	DUF7536	355	384	6.8	7.5
TkA03G059730	`PF00702`	Hydrolase	450	757	3.4e-14	54.4
TkA03G059730	`PF13246`	Cation_ATPase	488	650	1.1e-34	120.5
TkA03G059730	`PF08282`	Hydrolase_3	653	686	0.00019	21.9
TkA03G059730	`PF08282`	Hydrolase_3	728	785	0.00019	21.9
TkA03G059730	`PF00689`	Cation_ATPase_C	828	1002	1.4e-45	156.0
TkA03G059730	`PF24380`	DUF7536	950	977	6.8	7.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O81108`	拟南芥	sp\|O81108\|ACA2_ARATH Calcium-transporting ATPase 2, plasma membrane-type	78.300%	Swiss-Prot	高置信
`O64806`	拟南芥	sp\|O64806\|ACA7_ARATH Putative calcium-transporting ATPase 7, plasma membrane-type	78.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q37145`	拟南芥	sp\|Q37145\|ACA1_ARATH Calcium-transporting ATPase 1	74.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q2QMX9`	水稻	sp\|Q2QMX9\|ACA10_ORYSJ Calcium-transporting ATPase 10, plasma membrane-type	73.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q6ATV4`	水稻	sp\|Q6ATV4\|ACA3_ORYSJ Calcium-transporting ATPase 3, plasma membrane-type	67.800%	Swiss-Prot	高置信

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