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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G032570
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 8692706-8693477 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

675 bp · TkA03G032570|TK1151|cDNA

ATGAGGTGTAGTAGGTCTTCAGAGAAGACAAAGCTAATTCATAAGAAAGGGTTATGGTCGCCTGATGAAGATCAAAAGCTCAGAGATTACATCACAAACCATGGACATGGTCTGCAAAGAAACGGAAAGAGTTGCAGATTAAGATGGATTAATTATCTACGGCCAGGATTGAAAAGAGGAACCTTCACCTCACATGAAGAGGACATCGTTCTCTCTCTTCATGCCACTTTAGGCAATAAGTGGTCTCAGATGTCACAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

675 bp · TkA03G032570|TK1151|CDS

ATGAGGTGTAGTAGGTCTTCAGAGAAGACAAAGCTAATTCATAAGAAAGGGTTATGGTCGCCTGATGAAGATCAAAAGCTCAGAGATTACATCACAAACCATGGACATGGTCTGCAAAGAAACGGAAAGAGTTGCAGATTAAGATGGATTAATTATCTACGGCCAGGATTGAAAAGAGGAACCTTCACCTCACATGAAGAGGACATCGTTCTCTCTCTTCATGCCACTTTAGGCAATAAGTGGTCTCAGATGTCACAACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

224 aa · TkA03G032570|TK1151|PROTEIN

MRCSRSSEKTKLIHKKGLWSPDEDQKLRDYITNHGHGLQRNGKSCRLRWINYLRPGLKRGTFTSHEEDIVLSLHATLGNKWSQMSQHLPGRTDNEIKNHWHSHLKKKVLNLTIAMKSQDIQTLSYTRTDSSLESSEADGCRNLPKVLFADWLSLEQFHNLDASGNDDMCRYTIGSQNTVTNSELLNEGSSYGFAESDFYDLISEDNISQNFNNSAVTLYSCDEL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G032570
TK1151 IDTkA03G032570
OH-1004 IDLXL04_011885
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)95.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G032570
位置Chr03:8692706-8693477 (-)
描述Similar to LAF1: Transcription factor LAF1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g25560 通过参与光敏色素A（phyA）信号向下游应答的传递，促进光照条件下光形态建成的转录因子。
LAF1, a MYB transcription activator for phytochrome A signaling.2001 · DOI: 10.1101/gad.915001
FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL1 and FHY1-LIKE associate with the Arabidopsis transcription factors LAF1 and HFR1 to transmit phytochrome A signals for inhibition of hypocotyl elongation.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.067215
At5g26660 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g09540 协调下游靶基因小型网络的转录因子；这些基因参与木质部形成、木质部细胞分化、侧根形成等多个植物生长发育过程。
AtMYB61, an R2R3-MYB transcription factor controlling stomatal aperture in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1016/j.cub.2005.06.041
MUM ENHANCERS are important for seed coat mucilage production and mucilage secretory cell differentiation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1093/jxb/erp102
AtMYB61, an R2R3-MYB transcription factor, functions as a pleiotropic regulator via a small gene network.2012 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2012.04201.x
Interactions between the R2R3-MYB transcription factor, AtMYB61, and target DNA binding sites.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0065132
AaMYB1 and its orthologue AtMYB61 affect terpene metabolism and trichome development in Artemisia annua and Arabidopsis thaliana.2017 · DOI: 10.1111/tpj.13509
At5g65230 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g35515 转录激活剂。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011885 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000902 cell morphogenesis 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009585 red, far-red light phototransduction 生物过程
GO:0009639 response to red or far red light 生物过程
GO:0010018 far-red light signaling pathway 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
GO:0010091 trichome branching 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010214 seed coat development 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09540
ath:AT3G01140
ath:AT4G25560
ath:AT5G26660
ath:AT5G65230
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.917
排名 1 · TkA03G032570 · TK1151
细胞质0.214
排名 2 · TkA03G032570 · TK1151
线粒体0.024
排名 3 · TkA03G032570 · TK1151
细胞膜0.019
排名 4 · TkA03G032570 · TK1151
内质网0.009
排名 5 · TkA03G032570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249Myb_DNA-binding16-53 aa
PF15963Myb_DNA-bind_716-35 aa
PF13921Myb_DNA-bind_619-67 aa
PF00249Myb_DNA-binding59-104 aa
PF13921Myb_DNA-bind_662-108 aa
PF15963Myb_DNA-bind_776-119 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G032570PF00249Myb_DNA-binding16534.1e-2485.1
TkA03G032570PF15963Myb_DNA-bind_716350.01915.5
TkA03G032570PF13921Myb_DNA-bind_619671.9e-1660.7
TkA03G032570PF00249Myb_DNA-binding591044.1e-2485.1
TkA03G032570PF13921Myb_DNA-bind_6621081.9e-1660.7
TkA03G032570PF15963Myb_DNA-bind_7761190.01915.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M0K4拟南芥sp|Q9M0K4|LAF1_ARATH Transcription factor LAF156.500%Swiss-Prot中等置信
Q8LPH6拟南芥sp|Q8LPH6|MYB86_ARATH Transcription factor MYB8664.400%Swiss-Prot低置信
Q8VZQ2拟南芥sp|Q8VZQ2|MYB61_ARATH Transcription factor MYB6163.500%Swiss-Prot低置信
Q9FJP2拟南芥sp|Q9FJP2|MYB53_ARATH Transcription factor MYB5358.500%Swiss-Prot低置信
Q9SDS8拟南芥sp|Q9SDS8|MYB8_ARATH Transcription factor MYB860.000%Swiss-Prot低置信

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