TkA03G010580 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G010580

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 2678022-2681035 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1291 bp · TkA03G010580|TK1151|cDNA

ACTTTCTTCCTCGTTGATTCTGGTTACTGATGGCTGAAGTGATTCAGAGGGAGCAGCAACAGCTGAATCTAGTCATTAGAAAAGCATGTTTTAGTCTGCCAACAGCTTGCCCTTCGTGCTTGCCTGTCTACATCTATCTCAAATTCGCAAATGTTCCTTTCGATTCGTGTTACAATCTCACTTACCCTGATTCCGATCAAATTCCTTACGTTGACTCCGATACATACGTCGCTTACAACAATGAGAAAGGTGGTGTAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

981 bp · TkA03G010580|TK1151|CDS

ATGGCTGAAGTGATTCAGAGGGAGCAGCAACAGCTGAATCTAGTCATTAGAAAAGCATGTTTTAGTCTGCCAACAGCTTGCCCTTCGTGCTTGCCTGTCTACATCTATCTCAAATTCGCAAATGTTCCTTTCGATTCGTGTTACAATCTCACTTACCCTGATTCCGATCAAATTCCTTACGTTGACTCCGATACATACGTCGCTTACAACAATGAGAAAGGTGGTGTAATTGAAAGTTTGAAACAAGATAATATCGCTAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

326 aa · TkA03G010580|TK1151|PROTEIN

MAEVIQREQQQLNLVIRKACFSLPTACPSCLPVYIYLKFANVPFDSCYNLTYPDSDQIPYVDSDTYVAYNNEKGGVIESLKQDNIANLDSEVQTLPEWVSTIAMINSWLSDAMLYELWIGSDGSSANKIYYSDLPWPIGKLLYLKQVHNVKQLLGISKETAERREEEIYRRATIAYQALSTKLGEESFFFDNRPSSLDAIFLGHALITLYALPETSVLRGKLLEQPFLVIYADKHKAQLLDSESSASSSSSSSSTSVPRR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G010580`
TK1151 ID	TkA03G010580
OH-1004 ID	LXL04_006133
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	95.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G010580

位置 Chr03:2678022-2681035 (-)

描述 Similar to MTX1: Mitochondrial outer membrane import complex protein METAXIN

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g19080`	参与蛋白质进入线粒体的运输。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006133 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程

GO:0006839 mitochondrial transport 生物过程

GO:0007007 inner mitochondrial membrane organization 生物过程

GO:0015031 protein transport 生物过程

GO:0045040 protein insertion into mitochondrial outer membrane 生物过程

GO:0070096 mitochondrial outer membrane translocase complex assembly 生物过程

GO:0001401 SAM complex 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0140275 MIB complex 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G19080

hsa:10651

ssc:733591

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.407

排名 1 · TkA03G010580 · TK1151

内质网0.216

排名 2 · TkA03G010580 · TK1151

细胞质0.182

排名 3 · TkA03G010580 · TK1151

细胞核0.128

排名 4 · TkA03G010580 · TK1151

过氧化物酶体0.100

排名 5 · TkA03G010580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17172GST_N_428-121 aa

PF10568Tom3730-139 aa

PF08628Nexin_C75-181 aa

PF17171GST_C_6175-233 aa

PF04637Herpes_pp85230-268 aa

PF10500SR-25241-287 aa

PF08628Nexin_C263-298 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G010580	`PF17172`	GST_N_4	28	121	1.9e-16	61.2
TkA03G010580	`PF10568`	Tom37	30	139	0.0018	19.3
TkA03G010580	`PF08628`	Nexin_C	75	181	0.096	13.8
TkA03G010580	`PF17171`	GST_C_6	175	233	5.3e-13	49.2
TkA03G010580	`PF04637`	Herpes_pp85	230	268	5.0	6.0
TkA03G010580	`PF10500`	SR-25	241	287	1.7	8.9
TkA03G010580	`PF08628`	Nexin_C	263	298	0.096	13.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O64471`	拟南芥	sp\|O64471\|MTX_ARATH Mitochondrial outer membrane import complex protein METAXIN	53.200%	Swiss-Prot	高置信

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