TkA03G007390 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G007390

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 1766159-1766482 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

324 bp · TkA03G007390|TK1151|cDNA

ATGTTTTCAAGGGCAGTGAAGATATTAGAAAACATGGTGATAAAGATGATGTTTGAAAGCTACGGTGTGGGAAAGTATAGTGAGTCTCATATTGCCTCCACGACTTATCTTCTTCGTTATTTAAAATACAGAGCACCGGAGATTCATGAAACGACAATGGCTATTCCTCCTCACACCGATAAAACCTTTCTGTCAATACTTCATCAGAATCAAGTTTCTGGATTGGAAATAAGATCAAGAAATGGTGAATGGATTTCTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

324 bp · TkA03G007390|TK1151|CDS

ATGTTTTCAAGGGCAGTGAAGATATTAGAAAACATGGTGATAAAGATGATGTTTGAAAGCTACGGTGTGGGAAAGTATAGTGAGTCTCATATTGCCTCCACGACTTATCTTCTTCGTTATTTAAAATACAGAGCACCGGAGATTCATGAAACGACAATGGCTATTCCTCCTCACACCGATAAAACCTTTCTGTCAATACTTCATCAGAATCAAGTTTCTGGATTGGAAATAAGATCAAGAAATGGTGAATGGATTTCTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

107 aa · TkA03G007390|TK1151|PROTEIN

MFSRAVKILENMVIKMMFESYGVGKYSESHIASTTYLLRYLKYRAPEIHETTMAIPPHTDKTFLSILHQNQVSGLEIRSRNGEWISVEYPPSSFVVMAGDACNVIDQ

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G007390`
TK1151 ID	TkA03G007390
OH-1004 ID	LXL04_002060
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	91.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 96.262 / OH-1004 32.595 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G007390

位置 Chr03:1766159-1766482 (+)

描述 Similar to AOP1.2: Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase AOP1.2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: Q944Z5`	可能的2-氧代戊二酸依赖性双加氧酶，可能参与硫代葡萄糖苷生物合成。	暂无已核实直接文献
`UniProt: Q945B6`	可能的2-氧代戊二酸依赖性双加氧酶，可能参与硫代葡萄糖苷生物合成。	暂无已核实直接文献
`At4g03070`	可能的2-氧代戊二酸依赖性双加氧酶，可能参与硫代葡萄糖苷生物合成。	暂无已核实直接文献
`At4g10490`	将水杨酸（SA）转化为2,3-二羟基苯甲酸（2,3-DHBA）（基于相似性推测）。	DOWNY MILDEW RESISTANT 6 and DMR6-LIKE OXYGENASE 1 are partially redundant but distinct suppressors of immunity in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1111/tpj.12719

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002060 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009699 phenylpropanoid biosynthetic process 生物过程

GO:0019761 glucosinolate biosynthetic process 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0016706 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

GO:0051213 dioxygenase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:ALG05135

ath:AT4G03070

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.805

排名 1 · TkA03G007390 · TK1151

细胞核0.334

排名 2 · TkA03G007390 · TK1151

内质网0.054

排名 3 · TkA03G007390 · TK1151

细胞膜0.034

排名 4 · TkA03G007390 · TK1151

细胞外0.032

排名 5 · TkA03G007390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF031712OG-FeII_Oxy37-105 aa

PF28801DUF846458-80 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G007390	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	37	105	1.2e-12	48.7
TkA03G007390	`PF28801`	DUF8464	58	80	0.27	12.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q944Z5`	拟南芥	sp\|Q944Z5\|AOP1V_ARATH Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase AOP1 (Fragment)	41.000%	Swiss-Prot	中等置信
`Q945B6`	拟南芥	sp\|Q945B6\|AOP1L_ARATH Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase AOP1.2	39.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9ZTA3`	拟南芥	sp\|Q9ZTA3\|AOP1C_ARATH Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase AOP1	39.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9ZSA7`	拟南芥	sp\|Q9ZSA7\|DLO2_ARATH Protein DMR6-LIKE OXYGENASE 2	30.200%	Swiss-Prot	中等置信

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