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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G610970
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 157612682-157617712 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3548 bp · TkA02G610970|TK1151|cDNA

AAAGGATTACATTAACCTTTTTCTTTCAAGAAGATTACACCATACCTCACCTTTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCAATAACTGCAGTTCTACTGCTATTCCTGGTTGCCTTCTGAAATCAGAGACAAAAACCATTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATACATACATATTTTTATATATATAGATATATACCTTCATGCAAAGACTGCAACTTTTGGATCTCTCTCCAGTGTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

3060 bp · TkA02G610970|TK1151|CDS

ATGGAAGAAAGAGACAACAAGAAATGCACAGCGAAAACAAAGAGTTTCAGAGGAAGAACACATAATAACCCACCACACCAAAACCTTTATCATCATCATCATCTTCTTCATCTTCATCCCCACTATCTTTTACAGCATTCGAACGGAAATTTCGGGTTTTTTAATCAAAATCTGTACCACTCTCCTTCACCGCCTCTTCTTCCATTACCCCCACCTCAATACGCCATAACTCCATCTCTACATCTCCCTCTTCCTCTACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1019 aa · TkA02G610970|TK1151|PROTEIN

MEERDNKKCTAKTKSFRGRTHNNPPHQNLYHHHHLLHLHPHYLLQHSNGNFGFFNQNLYHSPSPPLLPLPPPQYAITPSLHLPLPLPLNHHAFTPKPHLQKPPWKQNNHHHHHPPLVATSDSELSHQSALEVIPRTINSTMGPKKDELKPVRDSTLPEPPLMVARRPDSGGTEGTTISLLANHFLVKFDPSQLIYHYDVDISPKPSKDIARLIKKKLVEQNPTLLSGANPSYDGRRSLFSSIEFQQDRLELFIDIPIPIG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G610970
TK1151 IDTkA02G610970
OH-1004 IDLXL04_011441
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G610970
位置Chr02:157612682-157617712 (-)
描述Similar to AGO7: Protein argonaute 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g69440 参与 RNA 介导的转录后基因沉默。
The Arabidopsis heterochronic gene ZIPPY is an ARGONAUTE family member.2003 · DOI: 10.1016/j.cub.2003.09.004
DRB4-dependent TAS3 trans-acting siRNAs control leaf morphology through AGO7.2006 · DOI: 10.1016/j.cub.2006.03.035
Specification of leaf polarity in Arabidopsis via the trans-acting siRNA pathway.2006 · DOI: 10.1016/j.cub.2006.03.064
Genetic interaction between the AS1-AS2 and RDR6-SGS3-AGO7 pathways for leaf morphogenesis.2006 · DOI: 10.1093/pcp/pcj057
Trans-acting siRNA-mediated repression of ETTIN and ARF4 regulates heteroblasty in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1242/dev.02491
A novel class of bacteria-induced small RNAs in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1101/gad.1595107
Arabidopsis DRB4, AGO1, AGO7, and RDR6 participate in a DCL4-initiated antiviral RNA silencing pathway negatively regulated by DCL1.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0805760105
At1g48410 参与 RNA 介导的转录后基因沉默。
Arabidopsis ARGONAUTE1 is an RNA Slicer that selectively recruits microRNAs and short interfering RNAs.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0505461102
Cucumber mosaic virus-encoded 2b suppressor inhibits Arabidopsis Argonaute1 cleavage activity to counter plant defense.2006 · DOI: 10.1101/gad.1495506
Sorting of small RNAs into Arabidopsis argonaute complexes is directed by the 5' terminal nucleotide.2008 · DOI: 10.1016/j.cell.2008.02.034
Arabidopsis DRB4, AGO1, AGO7, and RDR6 participate in a DCL4-initiated antiviral RNA silencing pathway negatively regulated by DCL1.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0805760105
Redundant and specific roles of the ARGONAUTE proteins AGO1 and ZLL in development and small RNA-directed gene silencing.2009 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1000646
The Arabidopsis thaliana double-stranded RNA binding protein DRB1 directs guide strand selection from microRNA duplexes.2009 · DOI: 10.1261/rna.1646909
Unique functionality of 22-nt miRNAs in triggering RDR6-dependent siRNA biogenesis from target transcripts in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1038/nsmb.1866
AGO1 defines a novel locus of Arabidopsis controlling leaf development.1998 · DOI: 10.1093/emboj/17.1.170

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0449200 参与 RNA 沉默途径。
Over-expression of rice OsAGO7 gene induces upward curling of the leaf blade that enhanced erect-leaf habit.2007 · DOI: 10.1007/s00425-006-0472-0
The small interfering RNA production pathway is required for shoot meristem initiation in rice.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0704339104
Os03g0800200 对于孢子发生过程中减数分裂前有丝分裂和减数分裂的进展至关重要。
A germ cell specific gene of the ARGONAUTE family is essential for the progression of premeiotic mitosis and meiosis during sporogenesis in rice.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053199
Os04g0566500 参与 RNA 沉默通路，特别是在抗病毒反应期间。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011441 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007140 male meiotic nuclear division 生物过程
GO:0007143 female meiotic nuclear division 生物过程
GO:0009561 megagametogenesis 生物过程
GO:0009616 RNAi-mediated antiviral immune response 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0009850 auxin metabolic process 生物过程
GO:0009955 adaxial/abaxial pattern specification 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010050 vegetative phase change 生物过程
GO:0010218 response to far red light 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48410
ath:AT1G69440
dosa:Os03g0449200
dosa:Os03g0800200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.549
排名 1 · TkA02G610970 · TK1151
细胞核0.387
排名 2 · TkA02G610970 · TK1151
细胞膜0.087
排名 3 · TkA02G610970 · TK1151
线粒体0.068
排名 4 · TkA02G610970 · TK1151
内质网0.056
排名 5 · TkA02G610970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16486ArgoN176-319 aa
PF08699ArgoL1330-378 aa
PF18588WcbI388-434 aa
PF02170PAZ393-513 aa
PF16488ArgoL2523-569 aa
PF16487ArgoMid587-644 aa
PF16752TBCC_N614-668 aa
PF02171Piwi677-982 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G610970PF16486ArgoN1763191.2e-29104.2
TkA02G610970PF08699ArgoL13303781.2e-1660.8
TkA02G610970PF18588WcbI3884340.07513.4
TkA02G610970PF02170PAZ3935136.7e-2897.8
TkA02G610970PF16488ArgoL25235692.5e-0525.1
TkA02G610970PF16487ArgoMid5876440.0002721.8
TkA02G610970PF16752TBCC_N6146680.05314.5
TkA02G610970PF02171Piwi6779821.6e-94317.3
TkA02G610970PF16486ArgoN7778071.2e-29104.2
TkA02G610970PF18588WcbI8368720.07513.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C793拟南芥sp|Q9C793|AGO7_ARATH Protein argonaute 765.600%Swiss-Prot高置信
O04379拟南芥sp|O04379|AGO1_ARATH Protein argonaute 140.100%Swiss-Prot中等置信
Q75HC2水稻sp|Q75HC2|AGO7_ORYSJ Protein argonaute 765.300%Swiss-Prot高置信
Q851R2水稻sp|Q851R2|MEL1_ORYSJ Protein argonaute MEL140.000%Swiss-Prot中等置信
Q7XSA2水稻sp|Q7XSA2|AGO1B_ORYSJ Protein argonaute 1B39.800%Swiss-Prot中等置信

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