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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G610660
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 157541106-157543565 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1220 bp · TkA02G610660|TK1151|cDNA

CATGTCGGTACATGTTGTTTTTATATTATAAACAAAAAATCGATTCCATTTCCTCCACCCCATAAAAAGTTGCCACCGAATAGCCTGCCACCCCACTCACACTCTCACTCGCCACCGTCTTTCTCGTATTATTTGTCTACAAATCTTCGTTCACTGCATCTCTCTTTTCCTTCCCGTTGCATTTTCAGAACACCTTTTTTAATCTTACACACTTTCATCACTAATTACTCCTCAATCTGGCTTCAATCATGGCTGTTCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

648 bp · TkA02G610660|TK1151|CDS

ATGGCTGTTCTTGCTCTTCCTTTGCTTATTATCTTCGCCATAGCTGGCTATTCAAGTGCGGCTTATTGTGTATGCAACTCTGGATTAAGTGACGCAGTACTTCAGAAGAACATAGATTACGCTTGTGGAGCTGGAGCTGACTGCGGTCAGATCGCTCCAAATGGTGCCTGTTTTAGCCCTAATTCAGTCAAAGATCATTGCAATTTCGCCGTTAATAGTTATTTCCAGAAAAAGGGCCAAACGGCGGAAGCCTGTGGTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

215 aa · TkA02G610660|TK1151|PROTEIN

MAVLALPLLIIFAIAGYSSAAYCVCNSGLSDAVLQKNIDYACGAGADCGQIAPNGACFSPNSVKDHCNFAVNSYFQKKGQTAEACGFSGTATVTASAPSGATSSCFSGSSSSSTPTNPTIAPPGSGTGTGTGTGTGTGTGMGSGTGTGSGMGNGTGTSTGTGVGSGINTNPAFGGMAPSGSIGTDNSAAVTIHQTTTGFALSTSFILSLVWSTLF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G610660
TK1151 IDTkA02G610660
OH-1004 IDLXL04_011403
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G610660
位置Chr02:157541106-157543565 (-)
描述Similar to PDCB3: PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g08000 可结合(1→3)-β-D-葡聚糖（昆布多糖，laminarin）。
An Arabidopsis GPI-anchor plasmodesmal neck protein with callose binding activity and potential to regulate cell-to-cell trafficking.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.060145
At5g61130 可结合(1→3)-β-D-葡聚糖（昆布多糖，laminarin）。
An Arabidopsis GPI-anchor plasmodesmal neck protein with callose binding activity and potential to regulate cell-to-cell trafficking.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.060145
At1g18650 胞间连丝胼胝质结合蛋白3。 暂无已核实直接文献
At1g69295 胞间连丝胼胝质结合蛋白4。 暂无已核实直接文献
At1g26450 含碳水化合物结合X8结构域的蛋白质。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011403 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0052543 callose deposition in cell wall 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0098552 side of membrane 细胞组分
GO:0001872 (1->3)-beta-D-glucan binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18650
ath:AT1G26450
ath:AT1G69295
ath:AT5G08000
ath:AT5G61130
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.798
排名 1 · TkA02G610660 · TK1151
内质网0.090
排名 2 · TkA02G610660 · TK1151
细胞质0.073
排名 3 · TkA02G610660 · TK1151
细胞外0.066
排名 4 · TkA02G610660 · TK1151
细胞核0.053
排名 5 · TkA02G610660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07983X822-92 aa
PF29337GRP071-181 aa
PF22584CFAP14396-172 aa
PF06679DUF1180111-161 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G610660PF07983X822925.3e-2175.8
TkA02G610660PF29337GRP0711810.2211.4
TkA02G610660PF22584CFAP143961720.0215.4
TkA02G610660PF06679DUF11801111615.18.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SD84拟南芥sp|Q9SD84|PDCB2_ARATH PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 262.400%Swiss-Prot低置信
Q9FNQ2拟南芥sp|Q9FNQ2|PDCB1_ARATH PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 158.600%Swiss-Prot低置信
Q9FZ86拟南芥sp|Q9FZ86|PDCB3_ARATH PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 361.700%Swiss-Prot低置信
Q93V72拟南芥sp|Q93V72|PDCB4_ARATH PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 454.600%Swiss-Prot低置信
Q9FZD0拟南芥sp|Q9FZD0|CBX8D_ARATH Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein52.100%Swiss-Prot低置信

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