RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G603510
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 155615790-155617911 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1192 bp · TkA02G603510|TK1151|cDNA

ACCCTTTTTCTCTCTATAAAGTCAGCGCCACCACCGGTGGTGTCTCTCCTCCTTTTTCCTTAGAAATTACTGTTGTATCATACTTTATAAACTAGCTGTTCACATTTGCGTTAATATTAGTTCTTGTTTAATTATATGGATGGCGAGTGGGATTTGCATGCGGTTGTGAGGAGCTGCGCCACCCCGACCACGGCGGCCGTGAAGAATACCACCACCGTGGAGGATTACGACGATGGTTCTTATAACTTGGAGAGTTTAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

933 bp · TkA02G603510|TK1151|CDS

ATGGATGGCGAGTGGGATTTGCATGCGGTTGTGAGGAGCTGCGCCACCCCGACCACGGCGGCCGTGAAGAATACCACCACCGTGGAGGATTACGACGATGGTTCTTATAACTTGGAGAGTTTAGCTTCTGGGAAAAACGAGGGAAACGCTTTTTTATATCCGAGTTTTGTTGGAAACCCATGTAATGTTTCCGGCGGATTGGAGGATGTTTACAAGGCAGGGTGTGGAACTGGTCTGCCGGCCGCCACCGCGACGACGAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

310 aa · TkA02G603510|TK1151|PROTEIN

MDGEWDLHAVVRSCATPTTAAVKNTTTVEDYDDGSYNLESLASGKNEGNAFLYPSFVGNPCNVSGGLEDVYKAGCGTGLPAATATTTSGTIDLDVIERFVHEQLPMLTDSHSFSMHTMNSQSTRTRKRKNQEKRVFQLTQDELSNDLWAWRKYGQKPIKGSPFPRNYYRCSTTKACGAKKQVERSPADASIFIVSYSGEHIHPRPTHRSSLAGSTRSNKFNTDNSNKQRPVFGNTASSILEHPPCSSSSPAYASSFSPTT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G603510
TK1151 IDTkA02G603510
OH-1004 IDLXL04_026695
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)67.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 32.258 / OH-1004 28.986
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G603510
位置Chr02:155615790-155617911 (-)
描述Similar to WRKY22: WRKY transcription factor 22
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g01250 参与植物先天免疫反应中防御基因表达的转录因子。
MAP kinase signalling cascade in Arabidopsis innate immunity.2002 · DOI: 10.1038/415977a
At5g52830 转录因子。 暂无已核实直接文献
At4g23550 参与植物先天免疫反应中防御基因表达的转录因子。
MAP kinase signalling cascade in Arabidopsis innate immunity.2002 · DOI: 10.1038/415977a
At1g30650 转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g45050 转录因子。
Two linked pairs of Arabidopsis TNL resistance genes independently confer recognition of bacterial effector AvrRps4.2015 · DOI: 10.1038/ncomms7338

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026695 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007263 nitric oxide mediated signal transduction 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0140921 negative regulation of thermomorphogenesis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G30650
ath:AT2G34830
ath:AT4G01250
ath:AT5G52830
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.969
排名 1 · TkA02G603510 · TK1151
细胞质0.095
排名 2 · TkA02G603510 · TK1151
细胞膜0.025
排名 3 · TkA02G603510 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA02G603510 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA02G603510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03106WRKY123-137 aa
PF03106WRKY145-203 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G603510PF03106WRKY1231371e-2487.2
TkA02G603510PF03106WRKY1452031e-2487.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O04609拟南芥sp|O04609|WRK22_ARATH WRKY transcription factor 2235.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FLX8拟南芥sp|Q9FLX8|WRK27_ARATH Probable WRKY transcription factor 2767.900%Swiss-Prot低置信
Q9SUS1拟南芥sp|Q9SUS1|WRK29_ARATH Probable WRKY transcription factor 2954.100%Swiss-Prot低置信
Q9SA80拟南芥sp|Q9SA80|WRK14_ARATH Probable WRKY transcription factor 1436.400%Swiss-Prot中等置信
Q9FL92拟南芥sp|Q9FL92|RRS1B_ARATH Disease resistance protein RRS1B42.800%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看