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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G600370
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 154795173-154797250 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

578 bp · TkA02G600370|TK1151|cDNA

GAATGGTCTTATCCATATTCGTAACTTCCCTATCACAATAAATCAATAAAAATTGTACAAAATATATACCACAGTCCACAAGGGTAGAAGTACAAGTAGCGGCGGTATCAATCCTTGTAAAGTTGCAGAGAGGTTGAGAGATCATGGGCAAGGGAGGAAAGAGTGACGGCTCAAATGGAGAAGAAGAAAACATGGCTGCTTGGCTGGTTTCCATCAACACCCTCAAGATCCAGCCCTTTAAGCTTCCACCTCTTGGGCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1089 bp · TkA02G600370|TK1151|CDS

ATGGGCAAGGGAGGAAAGAGTGACGGCTCAAATGGAGAAGAAGAAAACATGGCTGCTTGGCTGGTTTCCATCAACACCCTCAAGATCCAGCCCTTTAAGCTTCCACCTCTTGGGCCCTATGATGTTAGAGTAAGGATGAAAGCTGTGGGTATCTGCGGTAGCGATGTTCACTATCTCAAGACATTAAGATGTGCAGATTTTGTGGTGAAAGAACCAATGGTTATCGGACATGAATGTGCTGGAGTGATTGAAGAAATTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

362 aa · TkA02G600370|TK1151|PROTEIN

MGKGGKSDGSNGEEENMAAWLVSINTLKIQPFKLPPLGPYDVRVRMKAVGICGSDVHYLKTLRCADFVVKEPMVIGHECAGVIEEIGSNVEDLVPGDRVALEPGISCWRCTQCKEGRYNLCPDMKFFATPPVHGSLANQVVHPADLCFKLPENVSLEEGAMCEPLSVGVHACRRANIGPETNVLVMGAGPIGLVAMLAARAFGAPRIVIVDVDDSRLSVAKQLGADEIIKVSINVQDVEGEVELIQKAMGGGVDVSFDCA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G600370
TK1151 IDTkA02G600370
OH-1004 IDLXL04_011965
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G600370
位置Chr02:154795173-154797250 (+)
描述Similar to SDH: Sorbitol dehydrogenase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g51970 可能催化多种糖醇的 NAD⁺ 依赖性氧化。
Sorbitol dehydrogenase is a cytosolic protein required for sorbitol metabolism in Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2013.01.012

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011965 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006060 sorbitol metabolic process 生物过程
GO:0006062 sorbitol catabolic process 生物过程
GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程
GO:0009725 response to hormone 生物过程
GO:0019640 D-glucuronate catabolic process to D-xylulose 5-phosphate 生物过程
GO:0030317 flagellated sperm motility 生物过程
GO:0031667 response to nutrient levels 生物过程
GO:0046183 L-idonate catabolic process 生物过程
GO:0046370 fructose biosynthetic process 生物过程
GO:0046686 response to cadmium ion 生物过程
GO:0046688 response to copper ion 生物过程
GO:0051160 xylitol catabolic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G51970
bta:508954
mmu:20322
rno:24788
vvi:100232980
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.582
排名 1 · TkA02G600370 · TK1151
细胞核0.217
排名 2 · TkA02G600370 · TK1151
线粒体0.164
排名 3 · TkA02G600370 · TK1151
过氧化物酶体0.103
排名 4 · TkA02G600370 · TK1151
细胞膜0.091
排名 5 · TkA02G600370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08240ADH_N38-152 aa
PF13738Pyr_redox_340-77 aa
PF00070Pyr_redox74-99 aa
PF07992Pyr_redox_274-99 aa
PF07562NCD3G95-119 aa
PF16912Glu_dehyd_C160-288 aa
PF01262AlaDh_PNT_C180-231 aa
PF00899ThiF181-214 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G600370PF08240ADH_N381521.9e-2796.3
TkA02G600370PF13738Pyr_redox_340770.2111.5
TkA02G600370PF00070Pyr_redox74990.01117.0
TkA02G600370PF07992Pyr_redox_274990.0713.3
TkA02G600370PF07562NCD3G951190.01316.0
TkA02G600370PF16912Glu_dehyd_C1602883.5e-0937.1
TkA02G600370PF01262AlaDh_PNT_C1802310.005816.8
TkA02G600370PF00899ThiF1812140.05213.4
TkA02G600370PF07992Pyr_redox_21812170.0713.3
TkA02G600370PF00070Pyr_redox1822110.01117.0
TkA02G600370PF07992Pyr_redox_21822170.0713.3
TkA02G600370PF03435Sacchrp_dh_NADP1832760.001319.8
TkA02G600370PF13649Methyltransf_251832390.05914.8
TkA02G600370PF13738Pyr_redox_31852110.2111.5
TkA02G600370PF00107ADH_zinc_N1903202.2e-30105.9
TkA02G600370PF13602ADH_zinc_N_22233392.8e-0732.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FJ95拟南芥sp|Q9FJ95|DHSO_ARATH Sorbitol dehydrogenase84.900%Swiss-Prot高置信

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