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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G581950
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 150152341-150155725 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2298 bp · TkA02G581950|TK1151|cDNA

AGCCCCAATTTCTTTCTCTCAAACGTCACTTTTACTTTTTAACTACATTTTAAATCCCTCCATTCTCGACACCATTTACCGCGATCTCACTTTTCCAAACCCCAAAAGCCATTCAAGCCATTCACACTCCTTGCCTCACTCTCTTTTCCTCTCCGATCATCGGATTCCTCCGTTTTCGTAGATCTGAAACAGTACTCTGAGCCACCGACAATGGCTATTTCCGTTCAGAACCTCCTGAAAGAACGCAGATATCCTTTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1809 bp · TkA02G581950|TK1151|CDS

ATGGCTATTTCCGTTCAGAACCTCCTGAAAGAACGCAGATATCCTTTCATTGCATCTCTCCTCCTCCTACTCCTCTTCGTCGCCTTCTTCGTCCTATCCATCAACACTTCTCAACCACCACCTCTCTACTCTGTCCGTCAACCGCCTGCTCAACCTTCAACCCCACAAAATATCCCTAGCAAGGCACCGACGCCGTCGTTAGAAATAGAGGGTAAAATTAGTAATAGCTTGGTAGATCCTGATCCTGATTCGGATGATGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

602 aa · TkA02G581950|TK1151|PROTEIN

MAISVQNLLKERRYPFIASLLLLLLFVAFFVLSINTSQPPPLYSVRQPPAQPSTPQNIPSKAPTPSLEIEGKISNSLVDPDPDSDDGGGGEDLVIKWEVCPGRVGVDYIPCLDNFKVIKSLKSRRHMEHRERHCPKPNPRCLIPLPDGYKVPVPWPKSRDMIWFDNVPHLKLVEYKKEQNWVKKSGQYLLFPGGGTQFKEGVNHYIQYIEKNLPKIGWGKRTRVILDVGCGVASFGGYLLEKNVITMSFAPKDEHEAQIQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G581950
TK1151 IDTkA02G581950
OH-1004 IDLXL04_012202
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G581950
位置Chr02:150152341-150155725 (-)
描述Similar to At2g40280: Probable methyltransferase PMT23
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g40280 可能的甲基转移酶 PMT23。 暂无已核实直接文献
At3g56080 可能的甲基转移酶 PMT22。 暂无已核实直接文献
At3g51070 可能的甲基转移酶 PMT27。 暂无已核实直接文献
At2g34300 可能的甲基转移酶 PMT25。 暂无已核实直接文献
At1g29470 可能的甲基转移酶 PMT24。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012202 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0000137 Golgi cis cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005797 Golgi medial cisterna 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G29470
ath:AT2G34300
ath:AT2G40280
ath:AT3G51070
ath:AT3G56080
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.793
排名 1 · TkA02G581950 · TK1151
内质网0.078
排名 2 · TkA02G581950 · TK1151
细胞膜0.063
排名 3 · TkA02G581950 · TK1151
细胞外0.061
排名 4 · TkA02G581950 · TK1151
细胞质0.039
排名 5 · TkA02G581950 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03141Methyltransf_29107-584 aa
PF13489Methyltransf_23207-337 aa
PF01209Ubie_methyltran220-320 aa
PF05175MTS221-243 aa
PF13847Methyltransf_31224-325 aa
PF13649Methyltransf_25225-317 aa
PF08241Methyltransf_11226-320 aa
PF08242Methyltransf_12226-319 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G581950PF03141Methyltransf_291075842.2e-211703.5
TkA02G581950PF13489Methyltransf_232073374.5e-0524.0
TkA02G581950PF01209Ubie_methyltran2203200.0009419.3
TkA02G581950PF05175MTS2212430.1412.4
TkA02G581950PF13847Methyltransf_312243252.6e-0834.5
TkA02G581950PF13649Methyltransf_252253172.6e-1144.8
TkA02G581950PF08241Methyltransf_112263208.1e-1349.5
TkA02G581950PF08242Methyltransf_122263192e-0629.2
TkA02G581950PF20922Anamorsin_N2823290.113.0
TkA02G581950PF01209Ubie_methyltran4394780.0009419.3
TkA02G581950PF05175MTS4454770.1412.4
TkA02G581950PF13489Methyltransf_234585664.5e-0524.0
TkA02G581950PF13649Methyltransf_255115542.6e-1144.8
TkA02G581950PF08241Methyltransf_115125588.1e-1349.5
TkA02G581950PF01209Ubie_methyltran5125630.0009419.3
TkA02G581950PF08242Methyltransf_125155562e-0629.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SIZ3拟南芥sp|Q9SIZ3|PMTN_ARATH Probable methyltransferase PMT2370.600%Swiss-Prot高置信
Q9LYN3拟南芥sp|Q9LYN3|PMTM_ARATH Probable methyltransferase PMT2257.900%Swiss-Prot高置信
Q9SD39拟南芥sp|Q9SD39|PMTR_ARATH Probable methyltransferase PMT2755.900%Swiss-Prot高置信
Q0WT31拟南芥sp|Q0WT31|PMTP_ARATH Probable methyltransferase PMT2555.300%Swiss-Prot高置信
Q6NPR7拟南芥sp|Q6NPR7|PMTO_ARATH Probable methyltransferase PMT2454.000%Swiss-Prot高置信

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