TkA02G581640 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G581640

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 150068111-150072663 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3008 bp · TkA02G581640|TK1151|cDNA

GTTAGACCAGCGCAAAATAGAATTCTCCGCAAACAAACACACAAAGGGTACTTCCCCACCGTTTACTCTTGTCTTTGGCATTCTCTTTGGTATATGCTCCGGGAATCTCGTCTTATCCCTCCTCCCACCCTTTTGAGTTTTGTCTGTAAGTACCCTCCCCACCGAAAACACAAATTCTATGGCGCCAGCTACAACTTCCTTACTCCACCACAACGGCATCTACTTCACATTCTCGGCGCGTGACTCTCACACTCTCTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2607 bp · TkA02G581640|TK1151|CDS

ATGGCGCCAGCTACAACTTCCTTACTCCACCACAACGGCATCTACTTCACATTCTCGGCGCGTGACTCTCACACTCTCTTCTTCAACTCCCACAACCACAAGTCTCTCCGTCCATCAAACAAGCTTCCTCTCAGTTCACTATCGTCAGTACCGTCGTCGCCGTCCGGCCGCCGTCGAACATTTGTATCCACCGTTCCGGTAGAGTATGTACCTCCAGCTCCAGATTTTGATTTCAATTCAGAACTAGCGCGCCTCCGTAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

868 aa · TkA02G581640|TK1151|PROTEIN

MAPATTSLLHHNGIYFTFSARDSHTLFFNSHNHKSLRPSNKLPLSSLSSVPSSPSGRRRTFVSTVPVEYVPPAPDFDFNSELARLRILRSKICASKSLRDKIRVVDSDSKVKRCFRRGHDKNGIARVLESFNLNEYELFLLKCIVAAGQEHVLGSGCDTDSDVDGEFVSARGSLKAALYTLVDMIEKWDGNDDREVYEKKVESVAFRSLLKTLREVEEFYDCIGGIIGYQLMVLELLSQSTHGEKNTNFQHINNSNSIGC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G581640`
TK1151 ID	TkA02G581640
OH-1004 ID	LXL04_012211
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G581640

位置 Chr02:150068111-150072663 (-)

描述 Similar to UGP3: UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase 3, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g56040`	参与叶绿体中硫脂的生物合成。	A chloroplastic UDP-glucose pyrophosphorylase from Arabidopsis is the committed enzyme for the first step of sulfolipid biosynthesis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.063925

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012211 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006011 UDP-alpha-D-glucose metabolic process 生物过程

GO:0006048 UDP-N-acetylglucosamine biosynthetic process 生物过程

GO:0009226 nucleotide-sugar biosynthetic process 生物过程

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0033356 UDP-L-arabinose metabolic process 生物过程

GO:0046398 UDP-glucuronate metabolic process 生物过程

GO:0046506 sulfolipid biosynthetic process 生物过程

GO:0052573 UDP-D-galactose metabolic process 生物过程

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0090406 pollen tube 细胞组分

GO:0003977 UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G56040

ath:AT5G52560

cmo:103485690

dosa:Os06g0701200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.655

排名 1 · TkA02G581640 · TK1151

细胞质0.161

排名 2 · TkA02G581640 · TK1151

细胞核0.122

排名 3 · TkA02G581640 · TK1151

细胞膜0.077

排名 4 · TkA02G581640 · TK1151

过氧化物酶体0.062

排名 5 · TkA02G581640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01704UDPGP350-464 aa

PF25441Hexapep_UGP3_C455-505 aa

PF01704UDPGP469-515 aa

PF25441Hexapep_UGP3_C703-862 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G581640	`PF01704`	UDPGP	350	464	0.00075	19.0
TkA02G581640	`PF25441`	Hexapep_UGP3_C	455	505	2.9e-70	236.1
TkA02G581640	`PF01704`	UDPGP	469	515	0.00075	19.0
TkA02G581640	`PF25441`	Hexapep_UGP3_C	703	862	2.9e-70	236.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4IY62`	拟南芥	sp\|F4IY62\|UGPA3_ARATH UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase 3, chloroplastic	63.400%	Swiss-Prot	高置信

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