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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G579390
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 149472159-149474967 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2483 bp · TkA02G579390|TK1151|cDNA

CTCAAACCTTCCCAAGATCTTCCTCAACAAAACAATCAACAGGACATCAAAGATGGTGGATCCTGATCCCCCTGGCAATGAGGAAAATCTTATTGATAATAGCAACAACAATGACACCAATAGTAGCAATGACAACAACAATGGTAACGACGGTGACAACACTACTAATGACGGTGGCAACACTACTAACGACGGTCGTAACACTACTAATGACAATGCTAGTGGCAACAATAACGACAATGGAAATGAGGATGGTAGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2238 bp · TkA02G579390|TK1151|CDS

ATGGTGGATCCTGATCCCCCTGGCAATGAGGAAAATCTTATTGATAATAGCAACAACAATGACACCAATAGTAGCAATGACAACAACAATGGTAACGACGGTGACAACACTACTAATGACGGTGGCAACACTACTAACGACGGTCGTAACACTACTAATGACAATGCTAGTGGCAACAATAACGACAATGGAAATGAGGATGGTAGTGCCAATAGTAATCATAGTTTGACTCTCAACGACAATGATGACAACAACAACAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

745 aa · TkA02G579390|TK1151|PROTEIN

MVDPDPPGNEENLIDNSNNNDTNSSNDNNNGNDGDNTTNDGGNTTNDGRNTTNDNASGNNNDNGNEDGSANSNHSLTLNDNDDNNNTNTNTNTNTNTSNNSNDNDNDNNTNTNTSNNSNDNDTSNNDGDGNINDHDSLAISQGMNIEDDPKKQSCVCVRRDFFPEESFKSWSNYGKALLATRARLKERLLARSSDDNEIHGMRARSQNQMKRTLNWFDLIWFGVGAVMGAGVFVLTGEAAHDLAGPAVLISYLVSGCAAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G579390
TK1151 IDTkA02G579390
OH-1004 IDLXL04_012239
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G579390
位置Chr02:149472159-149474967 (-)
描述Similar to CAT1: Cationic amino acid transporter 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g21120 高亲和力渗透蛋白，参与阳离子氨基酸（如精氨酸、赖氨酸、组氨酸、瓜氨酸、缬氨酸和谷氨酸）的转运。 暂无已核实直接文献
At2g34960 高亲和力通透酶，可转运阳离子氨基酸精氨酸，也能以较低程度转运瓜氨酸和谷氨酸。
Molecular and functional characterization of a family of amino acid transporters from Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.045278
At1g17120 渗透酶参与阳离子中性或酸性氨基酸的转运。
Molecular and functional characterization of a family of amino acid transporters from Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.045278
At5g04770 渗透酶参与阳离子中性或酸性氨基酸的转运。
Molecular and functional characterization of a family of amino acid transporters from Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.045278
At3g10600 参与阳离子氨基酸运输的渗透酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012239 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006865 amino acid transport 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0015171 amino acid transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17120
ath:AT2G34960
ath:AT3G10600
ath:AT4G21120
ath:AT5G04770
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.660
排名 1 · TkA02G579390 · TK1151
溶酶体／液泡0.151
排名 2 · TkA02G579390 · TK1151
内质网0.108
排名 3 · TkA02G579390 · TK1151
细胞质0.092
排名 4 · TkA02G579390 · TK1151
高尔基体0.050
排名 5 · TkA02G579390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01080Presenilin23-121 aa
PF13520AA_permease_2214-584 aa
PF13906AA_permease_C214-235 aa
PF00324AA_permease219-574 aa
PF03845Spore_permease224-295 aa
PF03845Spore_permease345-453 aa
PF03845Spore_permease544-576 aa
PF01080Presenilin595-645 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G579390PF01080Presenilin231213.07.2
TkA02G579390PF13520AA_permease_22145842.9e-40139.2
TkA02G579390PF13906AA_permease_C2142357.6e-1658.7
TkA02G579390PF00324AA_permease2195743.2e-32112.6
TkA02G579390PF03845Spore_permease2242950.0002121.0
TkA02G579390PF03845Spore_permease3454530.0002121.0
TkA02G579390PF03845Spore_permease5445760.0002121.0
TkA02G579390PF01080Presenilin5956453.07.2
TkA02G579390PF13520AA_permease_26006732.9e-40139.2
TkA02G579390PF00324AA_permease6006763.2e-32112.6
TkA02G579390PF03845Spore_permease6116260.0002121.0
TkA02G579390PF13906AA_permease_C6146287.6e-1658.7
TkA02G579390PF13906AA_permease_C6537027.6e-1658.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84MA5拟南芥sp|Q84MA5|CAAT1_ARATH Cationic amino acid transporter 159.900%Swiss-Prot高置信
O64759拟南芥sp|O64759|CAAT5_ARATH Cationic amino acid transporter 555.100%Swiss-Prot高置信
Q9SHH0拟南芥sp|Q9SHH0|CAAT8_ARATH Cationic amino acid transporter 8, vacuolar50.400%Swiss-Prot高置信
Q9LZ20拟南芥sp|Q9LZ20|CAAT6_ARATH Cationic amino acid transporter 6, chloroplastic38.500%Swiss-Prot中等置信
Q9SQZ0拟南芥sp|Q9SQZ0|CAAT7_ARATH Cationic amino acid transporter 7, chloroplastic36.900%Swiss-Prot中等置信

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