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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G579150
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 149395294-149397089 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

887 bp · TkA02G579150|TK1151|cDNA

ATGTGTTTTGCCTCTTCATCTTCTTTCAATACCACTAAAAAATGCTCTCCTCAACAAACCCTTGCGTTGCTTTTATTTAAACAAAATCTCACTTCCATACATTCCCCAGATGATGATCCACAACATAATTCTGCATGTCAGAATCTTCTTCGTTCTGATTATCATCCAATTATGATGCACTGGAGCATGGGTACCGATTGTTGCAATTGGGATGGTATTACATGCAACCACTTAACGGGTGATGTTATCGGTATCGACTT...

CDS

下载 CDS FASTA

885 bp · TkA02G579150|TK1151|CDS

ATGTGTTTTGCCTCTTCATCTTCTTTCAATACCACTAAAAAATGCTCTCCTCAACAAACCCTTGCGTTGCTTTTATTTAAACAAAATCTCACTTCCATACATTCCCCAGATGATGATCCACAACATAATTCTGCATGTCAGAATCTTCTTCGTTCTGATTATCATCCAATTATGATGCACTGGAGCATGGGTACCGATTGTTGCAATTGGGATGGTATTACATGCAACCACTTAACGGGTGATGTTATCGGTATCGACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

295 aa · TkA02G579150|TK1151|PROTEIN

MCFASSSSFNTTKKCSPQQTLALLLFKQNLTSIHSPDDDPQHNSACQNLLRSDYHPIMMHWSMGTDCCNWDGITCNHLTGDVIGIDLSCGMLQGVWNFENLLSTLPNLQVLDLSFSGLSVVSDNSTTYVDPDFWFINLASCNLNIFPPSLRAMKNLQYLLLYGNNIRGPIPNWAREIGGDGLIALDLSNNSITRLPESFQWDGLTQLAIGSNKIKGPFPPSICNMKNLQYLDLSNNSFYGMIPQCIRNIISLGMINLGTN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G579150
TK1151 IDTkA02G579150
OH-1004 IDLXL04_012240
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)44.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 73.898 / OH-1004 34.001
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G579150
位置Chr02:149395294-149397089 (+)
描述Similar to 9DC3: Receptor-like protein 9DC3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g11080 类受体蛋白 35。 暂无已核实直接文献
At5g27060 类受体蛋白 53。 暂无已核实直接文献
At3g05660 类受体蛋白33。 暂无已核实直接文献
At3g28890 受体样蛋白43。 暂无已核实直接文献
At1g45616 受体样蛋白 6。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012240 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ag:AAA65235
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.710
排名 1 · TkA02G579150 · TK1151
内质网0.124
排名 2 · TkA02G579150 · TK1151
细胞质0.073
排名 3 · TkA02G579150 · TK1151
细胞核0.071
排名 4 · TkA02G579150 · TK1151
细胞外0.068
排名 5 · TkA02G579150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_218-76 aa
PF00560LRR_174-81 aa
PF25013LRR_Zer-199-124 aa
PF12799LRR_4100-115 aa
PF23598LRR_14101-160 aa
PF13855LRR_8103-125 aa
PF00560LRR_1107-120 aa
PF00560LRR_1136-151 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G579150PF08263LRRNT_218761e-0526.4
TkA02G579150PF00560LRR_174815.6e-1861.9
TkA02G579150PF25013LRR_Zer-1991240.0003521.4
TkA02G579150PF12799LRR_41001152.7e-1350.4
TkA02G579150PF23598LRR_141011601.4e-0524.7
TkA02G579150PF13855LRR_81031257.8e-1658.3
TkA02G579150PF00560LRR_11071205.6e-1861.9
TkA02G579150PF00560LRR_11361515.6e-1861.9
TkA02G579150PF12799LRR_41361722.7e-1350.4
TkA02G579150PF13855LRR_81371667.8e-1658.3
TkA02G579150PF00560LRR_11551735.6e-1861.9
TkA02G579150PF13855LRR_81802007.8e-1658.3
TkA02G579150PF00560LRR_11822005.6e-1861.9
TkA02G579150PF12799LRR_41822152.7e-1350.4
TkA02G579150PF25013LRR_Zer-11822360.0003521.4
TkA02G579150PF23598LRR_141852591.4e-0524.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SRL7拟南芥sp|Q9SRL7|RLP35_ARATH Receptor-like protein 3541.900%Swiss-Prot低置信
Q9S9U3拟南芥sp|Q9S9U3|RLP53_ARATH Receptor-like protein 5338.200%Swiss-Prot低置信
F4J8G2拟南芥sp|F4J8G2|RLP33_ARATH Receptor-like protein 3351.600%Swiss-Prot低置信
Q9LJW7拟南芥sp|Q9LJW7|RLP43_ARATH Receptor-like protein 4337.100%Swiss-Prot低置信
Q9C637拟南芥sp|Q9C637|RLP6_ARATH Receptor-like protein 628.300%Swiss-Prot低置信

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