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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G578320
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 149198563-149202119 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3461 bp · TkA02G578320|TK1151|cDNA

AAGAACTAATAATGGATGCCATTATGAAATTTCGTATAGTGAACGTATACAACACTCTTTACAAGACTCCAAGACTTGTAGCCCATGTTTCACTCCAGTCCCCATCAAATAATAACTGTGCGGAAGACTCGACACATCACACATGTACGCCTATTTAAAAAACATCTAAAATCTTGAATCCCAAACAAATCTATTAAAAAACTATTACTTTTTCATGGCATGCCTTTCTTCCTTCTTCCATGCAATAGCATTACTGTTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2451 bp · TkA02G578320|TK1151|CDS

ATGGATGGAATCATTCCATCTTCTTTAGGTCGATTAAGAAGCTTGATGAGAATCGGCTTTGCTAACAATCAACTATACGGTACTATCCCGGTATCCATCTACAATTTATCATCGTTATTGGTTCTTGATTTTAGCGGGAATCGTATCAATGGAGAATTGCCGAAAGATATAGGATTGAAGCTACCGAATCTTGAGATTTTTCAAATTTGGGGGAACAATTTTACGGGAAGCATTCCGGTTTCGTTTTCTAATTGTTCAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

816 aa · TkA02G578320|TK1151|PROTEIN

MDGIIPSSLGRLRSLMRIGFANNQLYGTIPVSIYNLSSLLVLDFSGNRINGELPKDIGLKLPNLEIFQIWGNNFTGSIPVSFSNCSNLVHINLAENGFTGKVDVSFRRTPNLRVLGLFYNSLGSGESDEMNFIDSMINCSNLELLLVHGNQLRGVLPLSIGNLSSELKTLSFGGNFIYGNLPSGIGNLVKLERLIMLSNQFTGVIPSEIGNLRNLQLLYLNDNNFIGKFPDFIGNLSLLNELDLSDNRLKGKISTNLGNC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G578320
TK1151 IDTkA02G578320
OH-1004 IDLXL04_012253
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.382 / OH-1004 70.538
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G578320
位置Chr02:149198563-149202119 (+)
描述Similar to At3g47570: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g47570 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At3g47570。 暂无已核实直接文献
At3g47110 推测的类受体蛋白激酶 At3g47110。 暂无已核实直接文献
At5g20480 构成了模式识别受体（PPR），决定对延伸因子Tu（EF-Tu）的特异性感知，EF-Tu 是一种强效的病原相关分子模式（PAMPs）防御反应诱导物；在诱导后磷酸化BIK1，以调控免疫反应，例如防御激素的表达（如茉莉酸（JA）和水杨酸（SA））。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os11g0569733 受体激酶，可检测稻瘟病菌 X.oryzae pv. oryzae 的蛋白 Ax21 以促进先天免疫。
Cleavage and nuclear localization of the rice XA21 immune receptor.2012 · DOI: 10.1038/ncomms1932
UniProt: Q1MX30 受体激酶，可检测稻瘟病菌 X.oryzae pv. oryzae 的蛋白 Ax21 以促进先天免疫。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012253 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002764 immune response-regulating signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0031349 positive regulation of defense response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G47110
ath:AT3G47570
ath:AT5G20480
osa:107276510
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.880
排名 1 · TkA02G578320 · TK1151
内质网0.080
排名 2 · TkA02G578320 · TK1151
细胞质0.059
排名 3 · TkA02G578320 · TK1151
细胞核0.041
排名 4 · TkA02G578320 · TK1151
溶酶体／液泡0.022
排名 5 · TkA02G578320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23211LRR_LRWD16-75 aa
PF23598LRR_149-151 aa
PF13855LRR_810-49 aa
PF00560LRR_115-36 aa
PF12799LRR_420-49 aa
PF25013LRR_Zer-133-49 aa
PF13516LRR_637-52 aa
PF00560LRR_138-58 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G578320PF23211LRR_LRWD16750.003517.8
TkA02G578320PF23598LRR_1491511.4e-2487.3
TkA02G578320PF13855LRR_810499.5e-2999.7
TkA02G578320PF00560LRR_115364.5e-37118.7
TkA02G578320PF12799LRR_420499.2e-2483.6
TkA02G578320PF25013LRR_Zer-133490.4411.4
TkA02G578320PF13516LRR_637520.007117.0
TkA02G578320PF00560LRR_138584.5e-37118.7
TkA02G578320PF12799LRR_438789.2e-2483.6
TkA02G578320PF13855LRR_8621229.5e-2999.7
TkA02G578320PF12799LRR_462969.2e-2483.6
TkA02G578320PF00560LRR_163854.5e-37118.7
TkA02G578320PF24048LRR_NXF1-5631310.1912.1
TkA02G578320PF13516LRR_6841000.007117.0
TkA02G578320PF00560LRR_1871064.5e-37118.7
TkA02G578320PF12799LRR_4871209.2e-2483.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGP4拟南芥sp|C0LGP4|Y3475_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g4757044.200%Swiss-Prot低置信
Q9SD62拟南芥sp|Q9SD62|Y3471_ARATH Putative receptor-like protein kinase At3g4711042.500%Swiss-Prot中等置信
C0LGT6拟南芥sp|C0LGT6|EFR_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR40.500%Swiss-Prot低置信
Q2R2D5水稻sp|Q2R2D5|XA21_ORYSJ Receptor kinase-like protein Xa2147.100%Swiss-Prot低置信
Q1MX30水稻sp|Q1MX30|XA21_ORYSI Receptor kinase-like protein Xa2146.900%Swiss-Prot低置信

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