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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G577910
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 149088197-149092628 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3406 bp · TkA02G577910|TK1151|cDNA

CTGGTTCTAGGTGTGCAGAGTCACCATTAAGCGAACTAAAAACATAAGCTAATGTCCATTCATGTTACTAATCCAATTCCGATCATCGACGACTGTTCTTCAATCCTTAATTTCGTTTGTTCTTGATTGCGTGCGTATTACACGTGTTCTTGATTGCGTGCGTATTTCAACCGGTGTGTCATCGATTTGGTTAGAACCGTCTGATTAGAGAGAATGAGAAAGAGGACATCGAGCGAGAGAGAGTGAAGACAGTACATACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1767 bp · TkA02G577910|TK1151|CDS

ATGGAGGATCGGAACTACTCCGGCCAGTTCCAGCGGTTTCACGGCATGTCCGACATCGTTTTCGAGTGCGTACTATCATACATACACGACACACGTGACCGCCAGTCGATATCGTTGGTCTGCCGGAGGTTATGCGAACTCGAAGCTCATACGCGGAAACACGTAACGATAGCGCTGTGTTATACGGCGACTCCTAAACAGCTCTCACGGCGGTTCCCGTTTCTTGAGTCGTTGAAGATAAAAGGGAAGCCACGCGCCGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

588 aa · TkA02G577910|TK1151|PROTEIN

MEDRNYSGQFQRFHGMSDIVFECVLSYIHDTRDRQSISLVCRRLCELEAHTRKHVTIALCYTATPKQLSRRFPFLESLKIKGKPRAAMYNLIPEDWGGFATPWVEEIAKSFSCIKAVHFRRMIVKDEDLELLARERGSVLQVLKLDKCSGFSTDGLRHVCRSCRNLKILFLEESQIQENDGDWLHELAINNTGVLEMLNFYMTDLNQVSVKDLELLAKKCSNLISVKIGDCEILDLVSFLNHANSLEEFGGGCFNEQPER...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G577910
TK1151 IDTkA02G577910
OH-1004 IDLXL04_012259
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G577910
位置Chr02:149088197-149092628 (+)
描述Similar to COI1: Coronatine-insensitive protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g39940 茉莉酸调节的植物育性和防御过程以及冠菌素和/或其他激发子感知/反应所需。
Differential gene expression in response to mechanical wounding and insect feeding in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.5.707
The SCF(COI1) ubiquitin-ligase complexes are required for jasmonate response in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.003368
A conditionally fertile coi1 allele indicates cross-talk between plant hormone signalling pathways in Arabidopsis thaliana seeds and young seedlings.2002 · DOI: 10.1007/s00425-002-0787-4
Arabidopsis Mutants Selected for Resistance to the Phytotoxin Coronatine Are Male Sterile, Insensitive to Methyl Jasmonate, and Resistant to a Bacterial Pathogen.1994 · DOI: 10.1105/tpc.6.5.751
COI1 links jasmonate signalling and fertility to the SCF ubiquitin-ligase complex in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01432.x
Characterization of the early response of Arabidopsis to Alternaria brassicicola infection using expression profiling.2003 · DOI: 10.1104/pp.103.022186
Activation of a COI1-dependent pathway in Arabidopsis by Pseudomonas syringae type III effectors and coronatine.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2003.01986.x
COI1: an Arabidopsis gene required for jasmonate-regulated defense and fertility.1998 · DOI: 10.1126/science.280.5366.1091

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0449500 参与茉莉酸（JA）信号传导。
Oryza sativa COI homologues restore jasmonate signal transduction in Arabidopsis coi1-1 mutants.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0052802
UniProt: A2WX30 参与茉莉酸（JA）信号传导。 暂无已核实直接文献
Os01g0853400 参与茉莉酸（JA）信号传导。
OsbHLH148, a basic helix-loop-helix protein, interacts with OsJAZ proteins in a jasmonate signaling pathway leading to drought tolerance in rice.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04477.x
Plant hormone jasmonate prioritizes defense over growth by interfering with gibberellin signaling cascade.2012 · DOI: 10.1073/pnas.1201616109
silencing COI1 in rice increases susceptibility to chewing insects and impairs inducible defense.2012 · DOI: 10.1371/journal.pone.0036214
Oryza sativa COI homologues restore jasmonate signal transduction in Arabidopsis coi1-1 mutants.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0052802
Priming of jasmonate-mediated antiherbivore defense responses in rice by silicon.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1305848110
UniProt: A2XEV1 参与茉莉酸（JA）信号传导。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012259 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002213 defense response to insect 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009625 response to insect 生物过程
GO:0009641 shade avoidance 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0009861 jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程
GO:0009867 jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009901 anther dehiscence 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G39940
dosa:Os01g0853400
dosa:Os03g0265500
dosa:Os05g0449500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.659
排名 1 · TkA02G577910 · TK1151
细胞质0.233
排名 2 · TkA02G577910 · TK1151
质体0.063
排名 3 · TkA02G577910 · TK1151
细胞膜0.057
排名 4 · TkA02G577910 · TK1151
线粒体0.042
排名 5 · TkA02G577910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18511F-box_515-54 aa
PF12937F-box-like23-47 aa
PF00646F-box30-47 aa
PF24758LRR_At5g5637069-79 aa
PF18791Transp_inhibit74-119 aa
PF29594LRR_SKP2105-239 aa
PF25372LRR_FBXL15107-228 aa
PF24758LRR_At5g56370108-203 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G577910PF18511F-box_515544.1e-1659.0
TkA02G577910PF12937F-box-like23472.98.5
TkA02G577910PF00646F-box30474.58.1
TkA02G577910PF24758LRR_At5g5637069790.001618.8
TkA02G577910PF18791Transp_inhibit741198.8e-2277.1
TkA02G577910PF29594LRR_SKP21052391.3e-1351.5
TkA02G577910PF25372LRR_FBXL151072283.2e-0626.5
TkA02G577910PF24758LRR_At5g563701082030.001618.8
TkA02G577910PF23598LRR_141351780.07912.4
TkA02G577910PF24409wHTH-PRTase_assc1451690.2512.1
TkA02G577910PF12937F-box-like1561632.98.5
TkA02G577910PF00646F-box1561664.58.1
TkA02G577910PF12799LRR_41621760.7410.9
TkA02G577910PF12799LRR_42052410.7410.9
TkA02G577910PF13516LRR_62192330.005817.3
TkA02G577910PF29594LRR_SKP22813481.3e-1351.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O04197拟南芥sp|O04197|COI1_ARATH Coronatine-insensitive protein 164.700%Swiss-Prot高置信
Q60EH4水稻sp|Q60EH4|COI1B_ORYSJ Coronatine-insensitive protein homolog 1b58.700%Swiss-Prot高置信
A2WX30水稻sp|A2WX30|COI1A_ORYSI Coronatine-insensitive protein homolog 1a57.300%Swiss-Prot高置信
Q6Y9P5水稻sp|Q6Y9P5|COI1A_ORYSJ Coronatine-insensitive protein homolog 1a57.300%Swiss-Prot高置信
A2XEV1水稻sp|A2XEV1|COI2_ORYSI Coronatine-insensitive protein homolog 255.600%Swiss-Prot高置信

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