TkA02G574900 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G574900

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 148415732-148418835 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

759 bp · TkA02G574900|TK1151|cDNA

ATGCTTTTATCTTCCTCCAGATCTTCTAGTGGTTTTTCTATTTGGCGCGAACTTCAAACTCCACAGTGTGACGCCGTCGGATCTACTGCCGTCGTTGCGGTAGTGACTCCCGAGAAGATCGTCGTTTCCGACTGTGGATATTCGCGTGTAGAGCTTTGCAGGAACGGCGTCGCTATTCCTTTCTCCGTAGGTCATAAGGATAGGCTTACGTTAGAGTTTGTACATGATTTGTTACGACCCGGGTTGGACCAACTCCGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

759 bp · TkA02G574900|TK1151|CDS

ATGCTTTTATCTTCCTCCAGATCTTCTAGTGGTTTTTCTATTTGGCGCGAACTTCAAACTCCACAGTGTGACGCCGTCGGATCTACTGCCGTCGTTGCGGTAGTGACTCCCGAGAAGATCGTCGTTTCCGACTGTGGATATTCGCGTGTAGAGCTTTGCAGGAACGGCGTCGCTATTCCTTTCTCCGTAGGTCATAAGGATAGGCTTACGTTAGAGTTTGTACATGATTTGTTACGACCCGGGTTGGACCAACTCCGAAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

252 aa · TkA02G574900|TK1151|PROTEIN

MLLSSSRSSSGFSIWRELQTPQCDAVGSTAVVAVVTPEKIVVSDCGYSRVELCRNGVAIPFSVGHKDRLTLEFVHDLLRPGLDQLRRPGILRFESHQQPASTVLSKAIWLGCIGLLDLTMPGLWSWSNPGRNKKSALFCYDPGWTNSEGPASVMSQVRVSPTTCLRGIVQGDMVGVYWAARPYDAGPSELVTFLLRPGLDQLRRPGIVRVRSQVRVSPTTCLRGIVQGDMVGVYWAARPYDAGPSELVQPGS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G574900`
TK1151 ID	TkA02G574900
OH-1004 ID	LXL04_003769
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	58.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 64.683 / OH-1004 57.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G574900

位置 Chr02:148415732-148418835 (+)

描述 Protein of unknown function

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g11410`	种子萌发和冷驯化过程中脱落酸反应的主要负调节因子。	Antisense inhibition of protein phosphatase 2C accelerates cold acclimation in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01048.x Physical and functional interaction of the Arabidopsis K(+) channel AKT2 and phosphatase AtPP2CA.2002 · DOI: 10.1105/tpc.000943 ABA-hypersensitive germination3 encodes a protein phosphatase 2C (AtPP2CA) that strongly regulates abscisic acid signaling during germination among Arabidopsis protein phosphatase 2Cs.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.070128 The protein phosphatase AtPP2CA negatively regulates abscisic acid signal transduction in Arabidopsis, and effects of abh1 on AtPP2CA mRNA.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.070318 ABA-Hypersensitive Germination1 encodes a protein phosphatase 2C, an essential component of abscisic acid signaling in Arabidopsis seed.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03107.x ABI1 and PP2CA phosphatases are negative regulators of Snf1-related protein kinase1 signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.114066
`At1g07430`	通过去磷酸化作用参与K(+)钾通道AKT1的负调控，与CIPK蛋白（如CIPK23）相反。	暂无已核实直接文献
`At2g29380`	可能的蛋白质磷酸酶 2C 24。	暂无已核实直接文献
`At5g59220`	作为叶片中脱落酸(ABA)信号导致气孔关闭的负调控因子，并控制叶片衰老期间的水分流失。	An ABA-regulated and Golgi-localized protein phosphatase controls water loss during leaf senescence in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04821.x An abscisic acid-AtNAP transcription factor-SAG113 protein phosphatase 2C regulatory chain for controlling dehydration in senescing Arabidopsis leaves.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.190876 Selective inhibition of clade A phosphatases type 2C by PYR/PYL/RCAR abscisic acid receptors.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.188623 Unique drought resistance functions of the highly ABA-induced clade A protein phosphatase 2Cs.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.202408

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os05g0457200`	可能的蛋白磷酸酶 2C 49。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003769 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）暂无功能描述

KEGG 基因交叉引用暂无功能描述

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.525

排名 1 · TkA02G574900 · TK1151

细胞核0.331

排名 2 · TkA02G574900 · TK1151

线粒体0.137

排名 3 · TkA02G574900 · TK1151

细胞膜0.093

排名 4 · TkA02G574900 · TK1151

内质网0.083

排名 5 · TkA02G574900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00481PP2C20-71 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G574900	`PF00481`	PP2C	20	71	3.4e-07	30.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P49598`	拟南芥	sp\|P49598\|P2C37_ARATH Protein phosphatase 2C 37	82.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q9LNW3`	拟南芥	sp\|Q9LNW3\|P2C03_ARATH Protein phosphatase 2C 3	72.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q9ZW21`	拟南芥	sp\|Q9ZW21\|P2C24_ARATH Probable protein phosphatase 2C 24	66.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q9FIF5`	拟南芥	sp\|Q9FIF5\|P2C78_ARATH Probable protein phosphatase 2C 78	70.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q65XG6`	水稻	sp\|Q65XG6\|P2C49_ORYSJ Probable protein phosphatase 2C 49	64.700%	Swiss-Prot	低置信

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