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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G548850
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 141662933-141666300 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2134 bp · TkA02G548850|TK1151|cDNA

AATATTCAATCAAATAACTTAAAATATTAATATAATATTAAATAATTGGAGGCTAGACCAAACAGAAAACACATACATGATCCACCACCACTCAAGAAGCATATCATTTGCTCCTTGTCCTTTTTCAAATAACCCATTTTTTCTTCCACTCTTTGAAATTAACAGACCCTACCCATCTTCAATCCCCACCCAACAACCCTCTCGTTTCAGAACCCTGTTTTTTACTCCTCTATCAATGTCGCCCTAAAAGTTCTTGAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1620 bp · TkA02G548850|TK1151|CDS

ATGGATTCTCCAGTCGCTACAGGGAAAATGCATCAGAGTTTAAGCCGAACCAGGACTATGGAGAAAAAAGACGATACACCTTTGCATATTGCTGCAAGAACAGGGGATTTAGATGCAGCTTTTGAGATTCTAAATAGTTACGAGGAAGAAAAATTGATGGAATTGCTAAAGAAGAAGAATCAATCGGGTGAAATCGCGCTTTATGTTGCTGCTGAATATGGTTGTGTTGATTTGGTGAAAGAGATGATAAAGTATTATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

539 aa · TkA02G548850|TK1151|PROTEIN

MDSPVATGKMHQSLSRTRTMEKKDDTPLHIAARTGDLDAAFEILNSYEEEKLMELLKKKNQSGEIALYVAAEYGCVDLVKEMIKYYDSESASIKAKNGFDAFHIATKQGNLDVIKVFMEMNSELCMTIDQQNTTALHTASEQGHLEVVNYLLEKNSNMANIARSNLKTALHSCARKGHLEVVKALSQRVPEIVGRADKKGQTALHMAVKGQNVEVVDALIEADNGLINMVDKKDNTALHITTRKGRTEILWALLSHKETI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G548850
TK1151 IDTkA02G548850
OH-1004 IDLXL04_004910
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G548850
位置Chr02:141662933-141666300 (-)
描述Similar to At5g02620: Ankyrin repeat-containing protein At5g02620
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g02620 含锚蛋白重复序列的蛋白At5g02620。 暂无已核实直接文献
At3g12360 参与耐盐胁迫。
ITN1, a novel gene encoding an ankyrin-repeat protein that affects the ABA-mediated production of reactive oxygen species and is involved in salt-stress tolerance in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03614.x
At2g01680 含锚蛋白重复的蛋白 At2g01680。 暂无已核实直接文献
At4g14400 对抗致病微生物（包括细菌、真菌和卵菌）的防御反应的剂量依赖性激活因子，与防御信号水杨酸（SA）形成正反馈回路。
The gain-of-function Arabidopsis acd6 mutant reveals novel regulation and function of the salicylic acid signaling pathway in controlling cell death, defenses, and cell growth.1999 · DOI: 10.1105/tpc.11.9.1695
A role for salicylic acid and NPR1 in regulating cell growth in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01158.x
ACD6, a novel ankyrin protein, is a regulator and an effector of salicylic acid signaling in the Arabidopsis defense response.2003 · DOI: 10.1105/tpc.015412
Structure-function analysis of the plasma membrane- localized Arabidopsis defense component ACD6.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02567.x
Genetic analysis of acd6-1 reveals complex defense networks and leads to identification of novel defense genes in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03791.x
Natural allelic variation underlying a major fitness trade-off in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1038/nature09083
Salicylic acid signaling controls the maturation and localization of the arabidopsis defense protein ACCELERATED CELL DEATH6.2014 · DOI: 10.1093/mp/ssu072

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0837000 参与耐盐胁迫。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004910 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0007010 cytoskeleton organization 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0045199 maintenance of epithelial cell apical/basal polarity 生物过程
GO:0072659 protein localization to plasma membrane 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005856 cytoskeleton 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G01680
ath:AT3G12360
ath:AT5G02620
dosa:Os01g0837000
hsa:286
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.865
排名 1 · TkA02G548850 · TK1151
细胞质0.078
排名 2 · TkA02G548850 · TK1151
内质网0.070
排名 3 · TkA02G548850 · TK1151
细胞核0.046
排名 4 · TkA02G548850 · TK1151
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · TkA02G548850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12796Ank_221-85 aa
PF24521Ank_KRIT121-120 aa
PF13637Ank_422-40 aa
PF00023Ank25-44 aa
PF13606Ank_326-45 aa
PF13857Ank_526-40 aa
PF24279HVO_2525_N26-67 aa
PF13857Ank_559-83 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G548850PF12796Ank_221858.9e-43145.5
TkA02G548850PF24521Ank_KRIT1211208.5e-0832.8
TkA02G548850PF13637Ank_422406.5e-37125.4
TkA02G548850PF00023Ank25441.1e-35120.3
TkA02G548850PF13606Ank_326455.1e-2894.4
TkA02G548850PF13857Ank_526402.2e-2795.5
TkA02G548850PF24279HVO_2525_N26670.2511.8
TkA02G548850PF13857Ank_559832.2e-2795.5
TkA02G548850PF00023Ank63851.1e-35120.3
TkA02G548850PF13606Ank_366855.1e-2894.4
TkA02G548850PF13637Ank_4671176.5e-37125.4
TkA02G548850PF13857Ank_5881252.2e-2795.5
TkA02G548850PF12796Ank_2931578.9e-43145.5
TkA02G548850PF00023Ank971181.1e-35120.3
TkA02G548850PF13606Ank_3981215.1e-2894.4
TkA02G548850PF24521Ank_KRIT1991558.5e-0832.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6AWW5拟南芥sp|Q6AWW5|Y5262_ARATH Ankyrin repeat-containing protein At5g0262062.800%Swiss-Prot高置信
Q9C7A2拟南芥sp|Q9C7A2|ITN1_ARATH Ankyrin repeat-containing protein ITN154.500%Swiss-Prot高置信
Q9ZU96拟南芥sp|Q9ZU96|Y2168_ARATH Ankyrin repeat-containing protein At2g0168050.900%Swiss-Prot高置信
Q8LPS2拟南芥sp|Q8LPS2|ACD6_ARATH Protein ACCELERATED CELL DEATH 634.400%Swiss-Prot低置信
A2CIR5水稻sp|A2CIR5|NPR4_ORYSJ Ankyrin repeat-containing protein NPR442.100%Swiss-Prot中等置信

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