基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA02G536540
当前版本: TK1151
染色体: Chr02
坐标: 138338652-138340620
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1367 bp · TkA02G536540|TK1151|cDNA
TTTAATAGTCTTAGCTAAAATTGACAAAACTGTATTTCTTGGCGGTTCAAAACTGTAAATCCACCAGTCTCGTTAAAAACACTTGCCAGGAATTCTCCGCTACTCTTCCGTTTACTCGTGCCCACGAAGCAAAACGAAATTTCCACGAAAAGATCAAACCCCAATTCCTTTTTCAGGATTAGCTAGATCGATTGATTCATTGCCTCCTAGACTTCGAATTCATCGATCATAACTCATAAGAGCTCTTCGGAAATTCCACA...
CDS
下载 CDS FASTA708 bp · TkA02G536540|TK1151|CDS
ATGAGTCAGAAAGGATTGATTTATAGCTTTGTTGCAAAAGGAACTGTCGTCTTGGCTGAACACACGGCCTACTCCGGAAACGTCAGCACGGTTGCTGTTCAATGCTTACAAAAGTTGCCTTCCGGTAGCAGTAAATACACATATTCATGCGATGGCTACACCTTTAACTTCCTGCTCGATAGTGGCTTTGTTTTTCTAGTTGTTGCTGATGAATCAGCAGGGAGGAGTTTGCCATTTGTGTTCCTGGAGAGACTGAAAGA...
235 aa · TkA02G536540|TK1151|PROTEIN
MSQKGLIYSFVAKGTVVLAEHTAYSGNVSTVAVQCLQKLPSGSSKYTYSCDGYTFNFLLDSGFVFLVVADESAGRSLPFVFLERLKDDFKKRYGASIGNDHPLADDSDDDLFEDRFSIAYNLDREFGPKIKEQMEYCLNHPDEMSKLSKLKAQITEVKGIMMDNIEKVLDRGEKIELLVDKTENLQFQADSFQRQGRQLRRKMWFQNVQMKVMIGGAIAVFILIVWLMACKGFKC
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA02G536540 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA02G536540 |
| OH-1004 ID | LXL04_000856 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 55.700 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 99.095覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA02G536540 |
|---|---|
| 位置 | Chr02:138338652-138340620 (-) |
| 描述 | Similar to VAMP722: Vesicle-associated membrane protein 722 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000045 autophagosome assembly 生物过程 GO:0009920 cell plate formation involved in plant-type cell wall biogenesis 生物过程 GO:0015031 protein transport 生物过程 GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程 GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress 生物过程 GO:0072659 protein localization to plasma membrane 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005768 endosome 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009504 cell plate 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G04750 ath:AT1G04760 ath:AT2G32670 ath:AT2G33120 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.330
高尔基体0.326
溶酶体／液泡0.294
内质网0.210
细胞膜0.206
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF13774Longin18-97 aaPF06133Com_YlbF142-156 aaPF00957Synaptobrevin146-226 aaPF06133Com_YlbF162-213 aaPF29593DUF8570210-229 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA02G536540 | PF13774 | Longin | 18 | 97 | 2.4e-20 | 73.2 |
| TkA02G536540 | PF06133 | Com_YlbF | 142 | 156 | 0.52 | 11.4 |
| TkA02G536540 | PF00957 | Synaptobrevin | 146 | 226 | 1.1e-30 | 106.0 |
| TkA02G536540 | PF06133 | Com_YlbF | 162 | 213 | 0.52 | 11.4 |
| TkA02G536540 | PF29593 | DUF8570 | 210 | 229 | 1.6 | 9.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9M376 | 拟南芥 | sp|Q9M376|VA727_ARATH Vesicle-associated membrane protein 727 | 83.600% | Swiss-Prot | 高置信 |
O48850 | 拟南芥 | sp|O48850|VA725_ARATH Vesicle-associated membrane protein 725 | 57.000% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9MAS5 | 拟南芥 | sp|Q9MAS5|VA726_ARATH Putative vesicle-associated membrane protein 726 | 56.600% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9ZTW3 | 拟南芥 | sp|Q9ZTW3|VA721_ARATH Vesicle-associated membrane protein 721 | 55.300% | Swiss-Prot | 高置信 |
P47192 | 拟南芥 | sp|P47192|VA722_ARATH Vesicle-associated membrane protein 722 | 54.500% | Swiss-Prot | 高置信 |