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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G507630
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 130254880-130257334 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1709 bp · TkA02G507630|TK1151|cDNA

AAACGGGATAATATCCCTTTCTCACATAAAAAAAAAAAAACATAAGAGCAAAGTGGAAAAGAGACGCAATGGCTAAAAATAAGAGGATCCAACAGAAAACGAGAAGTGGTGACTGGAAACTGTCCAAGCTAACGGAGTAGCAATGGCTGCCTACTCACTTCTTTCCACATGCGCCTTTTCTTCTCATCCTTTCCATAACTCCACCAAACCTTCCCTTTCTAGAACCCTCTCTCTTCGCACACCCAATAGCTATAGGCATA...

CDS

下载 CDS FASTA

1305 bp · TkA02G507630|TK1151|CDS

ATGGCTGCCTACTCACTTCTTTCCACATGCGCCTTTTCTTCTCATCCTTTCCATAACTCCACCAAACCTTCCCTTTCTAGAACCCTCTCTCTTCGCACACCCAATAGCTATAGGCATACCCCGGGCCAATTCATCGTCGCTTCTTCTCTTCTCGAACCTTCTCGCCCCACCTACTCTCCGACGCCGGAACCTACCCACAGATCCACCTTGACCAAATTGCTGAACTCGTGCTTCGTTATTTGCACTTCCGTAGCTCTTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

434 aa · TkA02G507630|TK1151|PROTEIN

MAAYSLLSTCAFSSHPFHNSTKPSLSRTLSLRTPNSYRHTPGQFIVASSLLEPSRPTYSPTPEPTHRSTLTKLLNSCFVICTSVALSVSVFVTDVDSAAAFSVATPRKLQTDELATVRLFQENTPSVVYITNLASRQDAFTLDVLEVPQGSGSGFVWDKKGHVVTNYHVIRGASDLRVTLADQTTYDAKVVGFDQDKDVAVLSIDAPQDKLRPIPVGVSADLLVGQKVFAIGNPFGLDHTLTTGVISGLRREISSAATGR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G507630
TK1151 IDTkA02G507630
OH-1004 IDLXL04_006278
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)46.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 71.889 / OH-1004 65.859
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G507630
位置Chr02:130254880-130257334 (+)
描述Similar to DEGP8: Protease Do-like 8, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g27925 高温所需的丝氨酸蛋白酶。
High light stimulates Deg1-dependent cleavage of the minor LHCII antenna proteins CP26 and CP29 and the PsbS protein in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1505-x
Identification and characterization of DegP, a serine protease associated with the luminal side of the thylakoid membrane.1998 · DOI: 10.1074/jbc.273.12.7094
At5g39830 可能的丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献
At4g18370 可能的丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006278 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0010206 photosystem II repair 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009534 chloroplast thylakoid 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009543 chloroplast thylakoid lumen 细胞组分
GO:0009579 thylakoid 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G27925
ath:AT4G18370
ath:AT5G39830
bme:BMEI1330
bmel:DK63_73
bms:BR0611
bsi:BS1330_I0607
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.984
排名 1 · TkA02G507630 · TK1151
线粒体0.026
排名 2 · TkA02G507630 · TK1151
细胞质0.015
排名 3 · TkA02G507630 · TK1151
过氧化物酶体0.011
排名 4 · TkA02G507630 · TK1151
细胞核0.010
排名 5 · TkA02G507630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05578Peptidase_S31140-185 aa
PF05579Peptidase_S32141-185 aa
PF02907Peptidase_S29149-165 aa
PF10459Peptidase_S46150-171 aa
PF13365Trypsin_2152-291 aa
PF00089Trypsin153-313 aa
PF17820PDZ_6220-233 aa
PF10459Peptidase_S46270-292 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G507630PF05578Peptidase_S311401850.08613.0
TkA02G507630PF05579Peptidase_S321411850.001118.9
TkA02G507630PF02907Peptidase_S291491650.01615.7
TkA02G507630PF10459Peptidase_S461501710.2210.8
TkA02G507630PF13365Trypsin_21522911.4e-36127.2
TkA02G507630PF00089Trypsin1533131e-1868.7
TkA02G507630PF17820PDZ_62202330.000819.8
TkA02G507630PF10459Peptidase_S462702920.2210.8
TkA02G507630PF02907Peptidase_S292713140.01615.7
TkA02G507630PF05579Peptidase_S322732940.001118.9
TkA02G507630PF13180PDZ_23304252.5e-1144.4
TkA02G507630PF17820PDZ_63573660.000819.8
TkA02G507630PF17820PDZ_63774160.000819.8
TkA02G507630PF00595PDZ3774140.2812.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22609拟南芥sp|O22609|DEGP1_ARATH Protease Do-like 1, chloroplastic90.000%Swiss-Prot高置信
Q9LU10拟南芥sp|Q9LU10|DEGP8_ARATH Protease Do-like 8, chloroplastic48.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SEL7拟南芥sp|Q9SEL7|DEGP5_ARATH Protease Do-like 5, chloroplastic50.000%Swiss-Prot低置信

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