TkA02G501240 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G501240

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 128425729-128426103 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

375 bp · TkA02G501240|TK1151|cDNA

ATGATCAAAAGACTGCAAGACACCCAACATTCCGAAAAACAATTCGCATCGGAAATGTCAACCCTCGGAAAAGTCAAACACCGAAACCTCGTCCCCCTCTTAGGGTTTTGTCTCGCAAAAAAAGAACGTCTGTTAGTCTACAAATACATGCCAAACGGCAACCTCCACGACAAACTCCACCTCTCAGAATACTCCACAAAACCCCTCGACTGGCCTTCAAGGCTAAGAATTGGGATCGGTATAGCCAAAGGATTAGCCTG...

CDS

下载 CDS FASTA

375 bp · TkA02G501240|TK1151|CDS

ATGATCAAAAGACTGCAAGACACCCAACATTCCGAAAAACAATTCGCATCGGAAATGTCAACCCTCGGAAAAGTCAAACACCGAAACCTCGTCCCCCTCTTAGGGTTTTGTCTCGCAAAAAAAGAACGTCTGTTAGTCTACAAATACATGCCAAACGGCAACCTCCACGACAAACTCCACCTCTCAGAATACTCCACAAAACCCCTCGACTGGCCTTCAAGGCTAAGAATTGGGATCGGTATAGCCAAAGGATTAGCCTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

124 aa · TkA02G501240|TK1151|PROTEIN

MIKRLQDTQHSEKQFASEMSTLGKVKHRNLVPLLGFCLAKKERLLVYKYMPNGNLHDKLHLSEYSTKPLDWPSRLRIGIGIAKGLAWLHHNCNPRILHRNISSRCILLDSDLEPRISDLGSPGS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G501240`
TK1151 ID	TkA02G501240
OH-1004 ID	LXL04_036691
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	98.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 96.774 / OH-1004 19.608 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G501240

位置 Chr02:128425729-128426103 (+)

描述 Similar to At5g48380: Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g48380

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g48380`	可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶At5g48380。	暂无已核实直接文献
`At1g27190`	可能失活的受体激酶At1g27190。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0718300`	参与油菜素甾醇（BR）信号转导的受体激酶。	Loss of function of a rice brassinosteroid insensitive1 homolog prevents internode elongation and bending of the lamina joint.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.9.1591 The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330 OsBRI1 Activates BR Signaling by Preventing Binding between the TPR and Kinase Domains of OsBSK3 via Phosphorylation.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01668 OsREM4.1 Interacts with OsSERK1 to Coordinate the Interlinking between Abscisic Acid and Brassinosteroid Signaling in Rice.2016 · DOI: 10.1016/j.devcel.2016.06.011

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036691 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009416 response to light stimulus 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0009791 post-embryonic development 生物过程

GO:0031348 negative regulation of defense response 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程

GO:1900425 negative regulation of defense response to bacterium 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G27190

ath:AT1G69990

ath:AT3G28450

ath:AT5G48380

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.502

排名 1 · TkA02G501240 · TK1151

细胞质0.401

排名 2 · TkA02G501240 · TK1151

细胞核0.274

排名 3 · TkA02G501240 · TK1151

线粒体0.036

排名 4 · TkA02G501240 · TK1151

内质网0.034

排名 5 · TkA02G501240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2-120 aa

PF00069Pkinase3-121 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G501240	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	2	120	9.3e-22	78.3
TkA02G501240	`PF00069`	Pkinase	3	121	1.7e-14	54.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ASS4`	拟南芥	sp\|Q9ASS4\|Y5838_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g48380	71.900%	Swiss-Prot	高置信
`O04567`	拟南芥	sp\|O04567\|Y1719_ARATH Probable inactive receptor kinase At1g27190	56.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q942F3`	水稻	sp\|Q942F3\|BRI1_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRI1	54.100%	Swiss-Prot	高置信

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