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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G471730
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 120362129-120362527 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

399 bp · TkA02G471730|TK1151|cDNA

ATGGCACAGTATGGAGGACAACAGGGTCAATACACCGACGAAGGAGTGGATGGGCATGAGAAGAAGGGAGTGATGGAAAAAATACAGGAGAAGCTACCGGGTGGTGGTGAGCACAAGGATTCAACCACAGCCACTGTGGGCGGTGGCAGAGGTGCATATGAGGGAGTTGAAGGGCATGAGAAGAAGGGAGCAATGGAAAAAATACAGGAGAAGCTACCGGGTGGTGGTGAGCACAAGGATTCAACCACAGCCACTGTGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

399 bp · TkA02G471730|TK1151|CDS

ATGGCACAGTATGGAGGACAACAGGGTCAATACACCGACGAAGGAGTGGATGGGCATGAGAAGAAGGGAGTGATGGAAAAAATACAGGAGAAGCTACCGGGTGGTGGTGAGCACAAGGATTCAACCACAGCCACTGTGGGCGGTGGCAGAGGTGCATATGAGGGAGTTGAAGGGCATGAGAAGAAGGGAGCAATGGAAAAAATACAGGAGAAGCTACCGGGTGGTGGTGAGCACAAGGATTCAACCACAGCCACTGTGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

132 aa · TkA02G471730|TK1151|PROTEIN

MAQYGGQQGQYTDEGVDGHEKKGVMEKIQEKLPGGGEHKDSTTATVGGGRGAYEGVEGHEKKGAMEKIQEKLPGGGEHKDSTTATVGGGRGAYEGVEGHEKKGMVEKIKEKLPGGNEQKTSTTTTVGGSGGA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G471730
TK1151 IDTkA02G471730
OH-1004 IDLXL04_013783
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)81.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 40.152 / OH-1004 25.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G471730
位置Chr02:120362129-120362527 (-)
描述Similar to XERO2: Dehydrin Xero 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013783 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009631 cold acclimation 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005507 copper ion binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0016151 nickel cation binding 分子功能
GO:0050897 cobalt ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G50970
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.659
排名 1 · TkA02G471730 · TK1151
细胞核0.265
排名 2 · TkA02G471730 · TK1151
细胞膜0.210
排名 3 · TkA02G471730 · TK1151
细胞外0.063
排名 4 · TkA02G471730 · TK1151
线粒体0.063
排名 5 · TkA02G471730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03786UxuA3-37 aa
PF00257Dehydrin13-75 aa
PF23403LTI65_LTI78_N19-31 aa
PF20861Isd_H_B_linker25-33 aa
PF12153CAP18_C26-32 aa
PF12521DUF372439-54 aa
PF23403LTI65_LTI78_N58-71 aa
PF20861Isd_H_B_linker65-73 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G471730PF03786UxuA3370.2111.2
TkA02G471730PF00257Dehydrin13755.2e-2176.4
TkA02G471730PF23403LTI65_LTI78_N19310.09813.7
TkA02G471730PF20861Isd_H_B_linker25330.09113.7
TkA02G471730PF12153CAP18_C26323.88.2
TkA02G471730PF12521DUF372439540.5511.0
TkA02G471730PF23403LTI65_LTI78_N58710.09813.7
TkA02G471730PF20861Isd_H_B_linker65730.09113.7
TkA02G471730PF12153CAP18_C66723.88.2
TkA02G471730PF00257Dehydrin781155.2e-2176.4
TkA02G471730PF12521DUF372479940.5511.0
TkA02G471730PF03786UxuA941200.2111.2
TkA02G471730PF23403LTI65_LTI78_N981110.09813.7
TkA02G471730PF20861Isd_H_B_linker1051130.09113.7
TkA02G471730PF12153CAP18_C1051123.88.2
TkA02G471730PF12521DUF37241221250.5511.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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