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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G469020
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 119616788-119619247 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1395 bp · TkA02G469020|TK1151|cDNA

AATGAGGGAGAGAGAATTTTCAATGTACTAAAAATCTAAAATTACAGATAAAAGTCTCAACTTGGAACCAAAAGAAAGTGTGGAAGCTATAAATGCATTGTTGGTTTGATGTACTTCCTTCCCTACACCTTCTTTCAGCGACACACTATTTTACTCTCTTGTGGGTAAACAATACGCCAACCGTGACTAAACCCGTGAGCCTTCCAAACCCTCTCTGCATCTTTCAATCTCAATATACACCTGAAGTTCTTTCCAGAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

909 bp · TkA02G469020|TK1151|CDS

ATGCATTGTTGGTTTGATGTACTTCCTTCCCTACACCTTCTTTCAGCGACACACTATTTTACTCTCTTGTGGGTAAACAATACGCCAACCGTGACTAAACCCGTGAGCCTTCCAAACCCTCTCTGCATCTTTCAATCTCAATATACACCTGAAGTTCTTTCCAGAAATCTCTTAGCAACTGATTCAGAAATGGAGTTTTTCACACACTCTTCTCATCCTCCCCGTTCGTCTTCACAGACTTCTGAGTCTTCGTTTGGAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

302 aa · TkA02G469020|TK1151|PROTEIN

MHCWFDVLPSLHLLSATHYFTLLWVNNTPTVTKPVSLPNPLCIFQSQYTPEVLSRNLLATDSEMEFFTHSSHPPRSSSQTSESSFGNLASKVRDFLCSAVSVIVGNVFSAIFTFFFASVGTLLGALTGALIGQETESGFVRGAAVGAISGAVFSIEVFESSLHLWQSDESGIGCLLYLIDVIVSLISGRLVRERIGPAMLSAVQSQMGAVETNFDEVQNIFDIGGCKGLPEYSVEKIPKITVTSDNNVDCSGEKVLCSVC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G469020
TK1151 IDTkA02G469020
OH-1004 IDLXL04_013838
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G469020
位置Chr02:119616788-119619247 (+)
描述Similar to NIP2: NEP1-interacting protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g17730 内在类囊体膜蛋白，将 RPOT2 固定在类囊体膜的基质侧。 暂无已核实直接文献
At4g35840 内在类囊体膜蛋白，将 RPOT2 固定在类囊体膜的基质侧。 暂无已核实直接文献
At5g66070 可能参与植物防御信号通路的早期阶段。 暂无已核实直接文献
At1g74410 可能参与植物防御信号通路的早期阶段。 暂无已核实直接文献
At2g35000 E3 泛素蛋白连接酶，能够与泛素结合酶 E2 UBC8 在体外催化多泛素化反应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013838 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006513 protein monoubiquitination 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0051865 protein autoubiquitination 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0042170 plastid membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G74410
ath:AT2G17450
ath:AT2G17730
ath:AT4G35840
ath:AT5G66070
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.376
排名 1 · TkA02G469020 · TK1151
细胞质0.238
排名 2 · TkA02G469020 · TK1151
细胞核0.234
排名 3 · TkA02G469020 · TK1151
高尔基体0.170
排名 4 · TkA02G469020 · TK1151
细胞膜0.136
排名 5 · TkA02G469020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21724DUF686186-157 aa
PF17647DUF5518101-162 aa
PF06897DUF1269105-138 aa
PF31172Gly-zipper_C13G5-2109-133 aa
PF31172Gly-zipper_C13G5-2112-153 aa
PF13436Gly-zipper_OmpA117-153 aa
PF13441Gly-zipper_YMGG118-152 aa
PF13488Gly-zipper_Omp119-152 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G469020PF21724DUF6861861573.47.8
TkA02G469020PF17647DUF55181011620.009916.7
TkA02G469020PF06897DUF12691051381.79.7
TkA02G469020PF31172Gly-zipper_C13G5-21091330.3111.8
TkA02G469020PF31172Gly-zipper_C13G5-21121530.3111.8
TkA02G469020PF13436Gly-zipper_OmpA1171533.1e-0524.4
TkA02G469020PF13441Gly-zipper_YMGG1181524.8e-0627.2
TkA02G469020PF13488Gly-zipper_Omp1191520.0002121.8
TkA02G469020PF27527Y2009_N1191320.2511.9
TkA02G469020PF06897DUF12691191571.79.7
TkA02G469020PF05433Rick_17kDa_Anti1201520.0008819.8
TkA02G469020PF27527Y2009_N1371520.2511.9
TkA02G469020PF06897DUF12691972161.79.7
TkA02G469020PF12861zf-ANAPC112492662.4e-0525.0
TkA02G469020PF14446Prok-RING_12532950.0714.0
TkA02G469020PF13920zf-C3HC4_32543010.05314.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GT74拟南芥sp|Q8GT74|NIP2_ARATH NEP1-interacting protein 269.100%Swiss-Prot高置信
Q8GT75拟南芥sp|Q8GT75|NIP1_ARATH NEP1-interacting protein 178.800%Swiss-Prot中等置信
Q9FKX5拟南芥sp|Q9FKX5|NIPL1_ARATH NEP1-interacting protein-like 171.200%Swiss-Prot高置信
Q8LBA0拟南芥sp|Q8LBA0|NIPL2_ARATH NEP1-interacting protein-like 234.200%Swiss-Prot低置信
O64763拟南芥sp|O64763|ATL9_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase ATL940.300%Swiss-Prot低置信

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