TkA02G465690 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G465690

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 118697610-118703828 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3675 bp · TkA02G465690|TK1151|cDNA

TTTCAAGGGACTTTCTTACTTATGTTTTGTACTTCAAGGGGATAAAGCGGAACATTTGATTAAATAAATATAGAATACTCGGAAGCTGTCTTTTTCCCAAATTATAAAATCCGATAAGAAATTAGGAAAACCGCAAACAACCGTTCTACGACTACTTCACGGCGGTTTTCACTAAGCAGCAAGCACGCATACTTCAACCCTCTCTCTACTGCTCGACGTCGCCATTTTTCTCCGGGCAGATCGTAAATTAATTGCTTATT...

CDS

下载 CDS FASTA

3126 bp · TkA02G465690|TK1151|CDS

ATGTTTGTCAAAAAGCTAGTCGAAAAGGCTTCGTTGAAGAAGCCTGGAGGAAATCGAGATAGTTTAAAATCTGATGATATAAATCCACGCCCCATTTTCCATTATGGTCTCCCATCAGGATGTAATTTGTTGGCTCATGATCCTATTCAGAAGATTCTTGCTATATCCACCATAGATGGCCGGATTAAGTTATTTGGACAAGACAACACTCAAGTTGTACTGGAATCTCCAGAGGCAGTACCAAGTAAATTTTTGCAGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1041 aa · TkA02G465690|TK1151|PROTEIN

MFVKKLVEKASLKKPGGNRDSLKSDDINPRPIFHYGLPSGCNLLAHDPIQKILAISTIDGRIKLFGQDNTQVVLESPEAVPSKFLQFIHNQPFLININANNHIEVWNTDLKSLAHVHVYKQEITSFTVLQRTFYMYVGDSFGNVSVFKFDKESNSIIQMKYRIPFSASHGANSTGDHSDAAVMYILPQPSAESKRVLIIYRDGFVSLWSIQESKPVFTTGGNLMQSLSHDTKKVTAACWVCPFGSKVVIGYNNGELLIWS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G465690`
TK1151 ID	TkA02G465690
OH-1004 ID	LXL04_013900
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	98.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA02G465690`
位置	Chr02:118697610-118703828 (+)
描述	Similar to Stxbp5: Syntaxin-binding protein 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_013900` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006887 exocytosis 生物过程 GO:0006893 Golgi to plasma membrane transport 生物过程 GO:0015031 protein transport 生物过程 GO:0017157 regulation of exocytosis 生物过程 GO:0042593 glucose homeostasis 生物过程 GO:0045921 positive regulation of exocytosis 生物过程 GO:0050714 positive regulation of protein secretion 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0005892 acetylcholine-gated channel complex 细胞组分 GO:0030141 secretory granule 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	hsa:134957 hsa:9515 mmu:207227 rno:81022 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.526

排名 1 · TkA02G465690 · TK1151

细胞核0.259

排名 2 · TkA02G465690 · TK1151

溶酶体／液泡0.181

排名 3 · TkA02G465690 · TK1151

高尔基体0.150

排名 4 · TkA02G465690 · TK1151

细胞膜0.135

排名 5 · TkA02G465690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23414Beta-prop_EML_234-121 aa

PF25174Beta-prop_THOC338-121 aa

PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st42-130 aa

PF25173Beta-prop_WDR3_1st43-72 aa

PF23775Beta-prop_RIG_2nd43-219 aa

PF23381Beta-prop_IFT122_1st44-153 aa

PF12894ANAPC4_WD4044-76 aa

PF00400WD4045-65 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G465690	`PF23414`	Beta-prop_EML_2	34	121	7.4e-11	42.6
TkA02G465690	`PF25174`	Beta-prop_THOC3	38	121	9e-09	35.4
TkA02G465690	`PF25171`	Beta-prop_WDR36-Utp21_1st	42	130	4.9e-08	33.4
TkA02G465690	`PF25173`	Beta-prop_WDR3_1st	43	72	2.7e-11	44.2
TkA02G465690	`PF23775`	Beta-prop_RIG_2nd	43	219	1.9e-09	38.1
TkA02G465690	`PF23381`	Beta-prop_IFT122_1st	44	153	1e-13	52.0
TkA02G465690	`PF12894`	ANAPC4_WD40	44	76	1.1e-08	35.9
TkA02G465690	`PF00400`	WD40	45	65	0.0014	19.8
TkA02G465690	`PF24817`	WD40_WDHD1_1st	46	122	2.2e-07	31.1
TkA02G465690	`PF23393`	Beta-prop_WDR90_POC16_2nd	46	161	5.9e-05	23.1
TkA02G465690	`PF25172`	Beta-prop_WDR3_2nd	47	148	0.0018	18.3
TkA02G465690	`PF24807`	WD40_CDC20-Fz	48	154	6.2e-10	39.6
TkA02G465690	`PF25175`	Beta-prop_WDR5	51	135	1.6e-08	35.0
TkA02G465690	`PF14727`	PHTB1_N	51	157	0.00062	20.2
TkA02G465690	`PF25173`	Beta-prop_WDR3_1st	85	148	2.7e-11	44.2
TkA02G465690	`PF02041`	Auxin_BP	85	110	0.22	11.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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