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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G464850
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 118458497-118459102 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

576 bp · TkA02G464850|TK1151|cDNA

ATGACTCGTCCCCACAGATTTCTCTCCTCAATCGCTAACCCATCTTCATCCTTCGATCAGACGGATGCGGAACCGCCTGAGGCAGTTGCCGTTGAGTCCGATTTCGTTATCATCCTCGCCGCTCTCCTCTGTGCTCTGATTTGTGTTCTAGGCCTTATCGCAGTAGCTCGCTGCGCTTGGCTCCGTCGTGGATCCACCTCCAACGCCGACCAGATTACTTCCCAGAAGACTGCGAATAAAGGAGTTAAGAAGAAGATCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

576 bp · TkA02G464850|TK1151|CDS

ATGACTCGTCCCCACAGATTTCTCTCCTCAATCGCTAACCCATCTTCATCCTTCGATCAGACGGATGCGGAACCGCCTGAGGCAGTTGCCGTTGAGTCCGATTTCGTTATCATCCTCGCCGCTCTCCTCTGTGCTCTGATTTGTGTTCTAGGCCTTATCGCAGTAGCTCGCTGCGCTTGGCTCCGTCGTGGATCCACCTCCAACGCCGACCAGATTACTTCCCAGAAGACTGCGAATAAAGGAGTTAAGAAGAAGATCGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

191 aa · TkA02G464850|TK1151|PROTEIN

MTRPHRFLSSIANPSSSFDQTDAEPPEAVAVESDFVIILAALLCALICVLGLIAVARCAWLRRGSTSNADQITSQKTANKGVKKKIVDSLPKFVYDSAKKEGGDCAICLAEYADGDEIRVLPQCGHGFHVGCIDMWLGSHSSCPSCRQILVITRCRKCGEFPTVSNGQISSSEEHKGRQHDTSSCSSDFLP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G464850
TK1151 IDTkA02G464850
OH-1004 IDLXL04_013918
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)95.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G464850
位置Chr02:118458497-118459102 (-)
描述Similar to ATL80: RING-H2 finger protein ATL80
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g20823 可能参与植物防御信号通路的早期阶段。 暂无已核实直接文献
At1g76410 RING-H2 指蛋白 ATL8。 暂无已核实直接文献
At2g17450 E3 泛素-蛋白连接酶，在体外具有 E3 泛素连接酶活性，并介导蛋白单泛素化。
Ligand-induced monoubiquitination of BIK1 regulates plant immunity.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2210-3
At4g35480 E3 泛素-蛋白连接酶，在体外具有 E3 泛素连接酶活性，并介导蛋白单泛素化。
Ligand-induced monoubiquitination of BIK1 regulates plant immunity.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2210-3
At1g49230 RING-H2锌指蛋白ATL78。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013918 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006513 protein monoubiquitination 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009901 anther dehiscence 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0010966 regulation of phosphate transport 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0048443 stamen development 生物过程
GO:0051865 protein autoubiquitination 生物过程
GO:0070417 cellular response to cold 生物过程
GO:0080141 regulation of jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G20823
ath:AT1G76410
ath:AT2G17450
ath:AT4G35480
ath:AT5G05280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.497
排名 1 · TkA02G464850 · TK1151
内质网0.241
排名 2 · TkA02G464850 · TK1151
溶酶体／液泡0.144
排名 3 · TkA02G464850 · TK1151
细胞质0.144
排名 4 · TkA02G464850 · TK1151
细胞核0.141
排名 5 · TkA02G464850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07754Ribosomal_aS2153-65 aa
PF14446Prok-RING_1100-133 aa
PF13920zf-C3HC4_3103-148 aa
PF13639zf-RING_2104-147 aa
PF17123zf-RING_11104-133 aa
PF14634zf-RING_5104-148 aa
PF11793FANCL_C104-158 aa
PF13923zf-C3HC4_2105-146 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G464850PF07754Ribosomal_aS2153653.58.2
TkA02G464850PF14446Prok-RING_11001330.01116.6
TkA02G464850PF13920zf-C3HC4_31031480.001319.2
TkA02G464850PF13639zf-RING_21041479.8e-1555.3
TkA02G464850PF17123zf-RING_111041337.7e-1245.4
TkA02G464850PF14634zf-RING_51041483e-0524.6
TkA02G464850PF11793FANCL_C1041580.511.4
TkA02G464850PF13923zf-C3HC4_21051465.9e-0936.3
TkA02G464850PF00097zf-C3HC41051466.5e-0729.8
TkA02G464850PF13445zf-RING_UBOX1051441.4e-0525.7
TkA02G464850PF23412zf_RING_Vps81051340.00417.7
TkA02G464850PF14570zf-RING_41051480.01615.7
TkA02G464850PF12678zf-rbx11121471.5e-0732.3
TkA02G464850PF12861zf-ANAPC111141527.7e-0626.6
TkA02G464850PF23413zf_RING_Vps8_fungal1201480.004317.0
TkA02G464850PF07754Ribosomal_aS211221263.58.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LM69拟南芥sp|Q9LM69|ATL80_ARATH RING-H2 finger protein ATL8052.300%Swiss-Prot高置信
Q8LC69拟南芥sp|Q8LC69|ATL8_ARATH RING-H2 finger protein ATL857.500%Swiss-Prot高置信
O22755拟南芥sp|O22755|ATL44_ARATH Probable E3 ubiquitin-protein ligase ATL4447.500%Swiss-Prot中等置信
Q9ZT49拟南芥sp|Q9ZT49|ATL45_ARATH Probable E3 ubiquitin-protein ligase ATL4541.700%Swiss-Prot中等置信
Q6NQG7拟南芥sp|Q6NQG7|ATL78_ARATH RING-H2 finger protein ATL7839.600%Swiss-Prot中等置信

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