TkA02G460770 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G460770

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 117413460-117417888 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2862 bp · TkA02G460770|TK1151|cDNA

AAAGCAATCTCCAAAAACTTCCTATAAATCCACACACTTCTTTAGGATTCAATAAGACCAAGAGCTTCCTTGAGTTGTTTCTCTATACCCTTCATAGATATCAATAATTAATCAATGGCTTCTTCAAGTGCGATCATGAAACGATCCGAATCCGTAATTGACACTATGCCCGAAGCGTTAAGAGAAAGCCGGTATCACATGAAAAAATGCTTTCTAAAATACTTAGAAAAAGGAAAGCGAATGATGAAATTGCACCATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2529 bp · TkA02G460770|TK1151|CDS

ATGGCTTCTTCAAGTGCGATCATGAAACGATCCGAATCCGTAATTGACACTATGCCCGAAGCGTTAAGAGAAAGCCGGTATCACATGAAAAAATGCTTTCTAAAATACTTAGAAAAAGGAAAGCGAATGATGAAATTGCACCATTTGATGCAAGAAATGGAGAGTATCATTGAGGACAAAGACGAAAAGGCTCAAGTCTTGGAAGGCTTACTTGGCTACATCTTGTGCACCACTCAGGAAGCTGCCATTGTTCCTCCTTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

842 aa · TkA02G460770|TK1151|PROTEIN

MASSSAIMKRSESVIDTMPEALRESRYHMKKCFLKYLEKGKRMMKLHHLMQEMESIIEDKDEKAQVLEGLLGYILCTTQEAAIVPPFVAFAIRPNPGFWEFVKVNSNTLAVEGITATDYLKFKESIVDETWANDENALELDFGSMNFKLPTMSLSSSIGHGVNFASKFITSKLYAQSGGQQLLVDYLLSLNHQGEKIMVNETLNTVSKLQAALIVAHAALSSLSNDTPYQSFELRFQQWGFEKGWGDNAERVRETIGFLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G460770`
TK1151 ID	TkA02G460770
OH-1004 ID	LXL04_013950
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.812 / OH-1004 98.930 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G460770

位置 Chr02:117413460-117417888 (-)

描述 Similar to SUS6: Sucrose synthase 6

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g73370`	蔗糖裂解酶，为各种代谢途径提供 UDP-葡萄糖和果糖。	Normal growth of Arabidopsis requires cytosolic invertase but not sucrose synthase.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0900689106
`At5g37180`	蔗糖裂解酶，为各种代谢途径提供 UDP-葡萄糖和果糖。	Normal growth of Arabidopsis requires cytosolic invertase but not sucrose synthase.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0900689106

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0249500`	蔗糖裂解酶，为各种代谢途径提供 UDP-葡萄糖和果糖。	暂无已核实直接文献
`Os04g0309600`	蔗糖裂解酶，为各种代谢途径提供 UDP-葡萄糖和果糖。	暂无已核实直接文献
`Os02g0831500`	蔗糖裂解酶，为各种代谢途径提供 UDP-葡萄糖和果糖。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013950 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005985 sucrose metabolic process 生物过程

GO:0080165 callose deposition in phloem sieve plate 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0016157 sucrose synthase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G73370

dosa:Os02g0831500

dosa:Os04g0249500

dosa:Os04g0309600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.510

排名 1 · TkA02G460770 · TK1151

细胞核0.224

排名 2 · TkA02G460770 · TK1151

线粒体0.155

排名 3 · TkA02G460770 · TK1151

过氧化物酶体0.084

排名 4 · TkA02G460770 · TK1151

内质网0.077

排名 5 · TkA02G460770 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24862SUS_EPBD4-64 aa

PF24861SUS_N10-124 aa

PF25340BCD_RFX13-69 aa

PF00862GT-B_Sucrose_synth31-53 aa

PF23713WHD_Egal32-53 aa

PF24862SUS_EPBD160-247 aa

PF23713WHD_Egal167-201 aa

PF11217DUF3013183-254 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G460770	`PF24862`	SUS_EPBD	4	64	2.1e-26	92.9
TkA02G460770	`PF24861`	SUS_N	10	124	1.1e-47	161.7
TkA02G460770	`PF25340`	BCD_RFX	13	69	0.14	12.2
TkA02G460770	`PF00862`	GT-B_Sucrose_synth	31	53	2e-168	559.3
TkA02G460770	`PF23713`	WHD_Egal	32	53	7.9	7.8
TkA02G460770	`PF24862`	SUS_EPBD	160	247	2.1e-26	92.9
TkA02G460770	`PF23713`	WHD_Egal	167	201	7.9	7.8
TkA02G460770	`PF11217`	DUF3013	183	254	0.014	16.0
TkA02G460770	`PF23713`	WHD_Egal	267	284	7.9	7.8
TkA02G460770	`PF00862`	GT-B_Sucrose_synth	270	558	2e-168	559.3
TkA02G460770	`PF11217`	DUF3013	365	407	0.014	16.0
TkA02G460770	`PF00534`	Glycos_transf_1	569	733	7.5e-28	97.9
TkA02G460770	`PF13692`	Glyco_trans_1_4	628	731	1.4e-12	48.8
TkA02G460770	`PF20706`	GT4-conflict	672	715	0.0017	18.2
TkA02G460770	`PF28946`	LvrA_C	759	799	0.044	15.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FX32`	拟南芥	sp\|Q9FX32\|SUS6_ARATH Sucrose synthase 6	70.000%	Swiss-Prot	高置信
`F4K5W8`	拟南芥	sp\|F4K5W8\|SUS5_ARATH Sucrose synthase 5	68.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q7XNX6`	水稻	sp\|Q7XNX6\|SUS7_ORYSJ Sucrose synthase 7	66.700%	Swiss-Prot	高置信
`H6TFZ4`	水稻	sp\|H6TFZ4\|SUS5_ORYSJ Sucrose synthase 5	66.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q6K973`	水稻	sp\|Q6K973\|SUS6_ORYSJ Sucrose synthase 6	67.000%	Swiss-Prot	高置信

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