RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G455780
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 116064009-116069142 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

870 bp · TkA02G455780|TK1151|cDNA

AAAAAGGTGAAGGAGCTTGAGAAGAAGCTTACAGATCGCGAAGAGTTGGGGAATAAAACATACCAACAAAAGGTGAAGGACCTGGAAGACAAATTGAAAGCTCAAGTCAAAGAGTCAAAATCCTACACCATGACCCTTGAAGAAAAAATTGAGGAACTTGAAACAAAACTGAAAGAACAAGAACATAATTCTGATTCAACCACCCTCCTTCTAAAGATTAAGGTTCTTGAGGAGAAGCTTAAAGATCAAGAAAGGCGGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

3336 bp · TkA02G455780|TK1151|CDS

ATGGAAGGCAAAACGGGCACGCTCGACGCATCAGGTGAAAACCAAGAAAGCCAGATCTCCCATACCTCAGTGTTGGAAGATATTAATTGGAGCAACGAGTCTTCGAATCAAGAAAATGCTACATTTGGGATGATCCCAGCTTTTACCAATGGTGGATTTGATTTCAACAAACCGTTGGACCAACAGGACGATTACAAAATGGAGGAAGAAGATGGAACCCTAATTGCTGACCACCTCTTTCGCTCAGATGGATCTCTTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1111 aa · TkA02G455780|TK1151|PROTEIN

MEGKTGTLDASGENQESQISHTSVLEDINWSNESSNQENATFGMIPAFTNGGFDFNKPLDQQDDYKMEEEDGTLIADHLFRSDGSLNCEKKSGQDSTMEEDDESSLDYMVCDSTSKLIPKGFMRPNCTDEVVLFVNAGAEAMAELHYDLNFVADKYFEGGDIFQTNESITEGGDVPFIYQTARLGNFQYLFKNLPEGNYYIDLHFVEMINTFGPKGMRVFNVYLQEEKILADFDIFSVVGANKPLQLVDSVVSVKPGEKI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G455780
TK1151 IDTkA02G455780
OH-1004 IDLXL04_024893
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)66.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G455780
位置Chr02:116064009-116069142 (-)
描述Similar to KIN14R: Kinesin-like protein KIN-14R
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g22610 驱动蛋白样蛋白 KIN-14R。 暂无已核实直接文献
At1g72250 类动力蛋白 KIN-14Q。 暂无已核实直接文献
At5g27550 类动力蛋白KIN-14S。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0114000 类驱动蛋白 KIN-14E。 暂无已核实直接文献
Os12g0616000 驱动蛋白样蛋白 KIN-14R。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024893 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0051225 spindle assembly 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0015630 microtubule cytoskeleton 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G72250
ath:AT2G22610
ath:AT5G27550
dosa:Os03g0114000
dosa:Os12g0616000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.619
排名 1 · TkA02G455780 · TK1151
细胞核0.348
排名 2 · TkA02G455780 · TK1151
细胞膜0.104
排名 3 · TkA02G455780 · TK1151
高尔基体0.071
排名 4 · TkA02G455780 · TK1151
线粒体0.067
排名 5 · TkA02G455780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd47-102 aa
PF11721Malectin131-276 aa
PF12819Malectin_like188-276 aa
PF07967zf-C3HC288-370 aa
PF28019HmpF313-466 aa
PF13166AAA_13313-470 aa
PF19220Rod_CreS314-467 aa
PF07889DUF1664326-409 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G455780PF16796Microtub_bd471024.9e-46157.2
TkA02G455780PF11721Malectin1312762.5e-2073.8
TkA02G455780PF12819Malectin_like1882760.01715.1
TkA02G455780PF07967zf-C3HC2883700.4811.2
TkA02G455780PF28019HmpF3134660.005316.0
TkA02G455780PF13166AAA_133134700.839.0
TkA02G455780PF19220Rod_CreS3144671.19.1
TkA02G455780PF07889DUF16643264090.1512.8
TkA02G455780PF04899MbeD_MobD3313789.17.2
TkA02G455780PF04899MbeD_MobD3804339.17.2
TkA02G455780PF11721Malectin4384642.5e-2073.8
TkA02G455780PF16796Microtub_bd4516114.9e-46157.2
TkA02G455780PF00225Kinesin4767926.9e-115384.2
TkA02G455780PF11721Malectin5675962.5e-2073.8
TkA02G455780PF19220Rod_CreS7167501.19.1
TkA02G455780PF07889DUF16647187420.1512.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IJK6拟南芥sp|F4IJK6|KN14R_ARATH Kinesin-like protein KIN-14R66.400%Swiss-Prot中等置信
F4IBQ9拟南芥sp|F4IBQ9|KN14Q_ARATH Kinesin-like protein KIN-14Q48.700%Swiss-Prot中等置信
F4K4C5拟南芥sp|F4K4C5|KN14S_ARATH Kinesin-like protein KIN-14S58.500%Swiss-Prot低置信
B9FAF3水稻sp|B9FAF3|KN14E_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14E63.400%Swiss-Prot中等置信
Q2QM62水稻sp|Q2QM62|KN14R_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14R58.400%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看