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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA02G451490
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 114874788-114877642 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2706 bp · TkA02G451490|TK1151|cDNA

ATGAAGATGCATGATGTCGTTTGTACTTCTCGTTGGCTTCAAAAGTTTGACACCTGGAAGCCCACAAGCAATTCATCAGATATTGGTTTTGATTGTTGTAAGTGGGATGGGGTGTTATGCCGAAATGAAGATCAAGTGATCGGGCTTGACTTGAGTGAAAGCTTTCTTTGTGGGCATATCAACTCTACCAGTACCCTCTTCAACCTTGTTAATCTTCAGACGCTTAACCTAGCAATGAACAACTTCAATGAATCTAAAAT...

2706 bp · TkA02G451490|TK1151|CDS

ATGAAGATGCATGATGTCGTTTGTACTTCTCGTTGGCTTCAAAAGTTTGACACCTGGAAGCCCACAAGCAATTCATCAGATATTGGTTTTGATTGTTGTAAGTGGGATGGGGTGTTATGCCGAAATGAAGATCAAGTGATCGGGCTTGACTTGAGTGAAAGCTTTCTTTGTGGGCATATCAACTCTACCAGTACCCTCTTCAACCTTGTTAATCTTCAGACGCTTAACCTAGCAATGAACAACTTCAATGAATCTAAAAT...

901 aa · TkA02G451490|TK1151|PROTEIN

MKMHDVVCTSRWLQKFDTWKPTSNSSDIGFDCCKWDGVLCRNEDQVIGLDLSESFLCGHINSTSTLFNLVNLQTLNLAMNNFNESKIPSEIALLKQLKSLNLSDSGFTGEIPIEISKLVQLYSLDLSRNPLKLQSPGLNLVQNMTTLEVLHLSGVDVSSSVPHFLANFSSLRSIRLFGCLLQGEFPSAIFNLPKLEILSLASNANLTGSFPEFRKKSLLRVVNVALTSFFGIIPESISNLNHLIYFRLTACSFSGHIPDF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G451490
TK1151 IDTkA02G451490
OH-1004 IDLXL04_037940
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)61.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.559 / OH-1004 48.853
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G451490
位置Chr02:114874788-114877642 (+)
描述Similar to RLP6: Receptor-like protein 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g47890 受体样蛋白 7。 暂无已核实直接文献
At5g27060 类受体蛋白 53。 暂无已核实直接文献
At3g05650 受体样蛋白32。 暂无已核实直接文献
At3g11080 类受体蛋白 35。 暂无已核实直接文献
At3g05660 类受体蛋白33。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_037940 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G45616
ath:AT1G47890
ath:AT4G13920
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.858
排名 1 · TkA02G451490 · TK1151
内质网0.094
排名 2 · TkA02G451490 · TK1151
细胞质0.061
排名 3 · TkA02G451490 · TK1151
细胞核0.052
排名 4 · TkA02G451490 · TK1151
溶酶体/液泡0.022
排名 5 · TkA02G451490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23952LRR_EndoS51-104 aa
PF23598LRR_1458-181 aa
PF12799LRR_459-83 aa
PF24758LRR_At5g5637059-105 aa
PF13855LRR_864-104 aa
PF25013LRR_Zer-165-129 aa
PF29594LRR_SKP265-197 aa
PF24048LRR_NXF1-568-132 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G451490PF23952LRR_EndoS511040.2912.1
TkA02G451490PF23598LRR_14581819.4e-2794.4
TkA02G451490PF12799LRR_459831.8e-2692.3
TkA02G451490PF24758LRR_At5g56370591055.4e-0523.7
TkA02G451490PF13855LRR_8641042.9e-33114.1
TkA02G451490PF25013LRR_Zer-1651298.2e-1039.7
TkA02G451490PF29594LRR_SKP2651970.0006419.8
TkA02G451490PF24048LRR_NXF1-5681320.2511.7
TkA02G451490PF23211LRR_LRWD1691059.3e-0626.2
TkA02G451490PF00560LRR_171925e-37118.6
TkA02G451490PF13855LRR_8711312.9e-33114.1
TkA02G451490PF13516LRR_671820.05614.2
TkA02G451490PF12799LRR_4951311.8e-2692.3
TkA02G451490PF00560LRR_1961185e-37118.6
TkA02G451490PF13516LRR_6971100.05614.2
TkA02G451490PF23952LRR_EndoS1111590.2912.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C699拟南芥sp|Q9C699|RLP7_ARATH Receptor-like protein 736.300%Swiss-Prot中等置信
Q9S9U3拟南芥sp|Q9S9U3|RLP53_ARATH Receptor-like protein 5335.800%Swiss-Prot低置信
Q9M9X0拟南芥sp|Q9M9X0|RLP32_ARATH Receptor-like protein 3241.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SRL7拟南芥sp|Q9SRL7|RLP35_ARATH Receptor-like protein 3533.200%Swiss-Prot低置信
F4J8G2拟南芥sp|F4J8G2|RLP33_ARATH Receptor-like protein 3342.900%Swiss-Prot中等置信

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