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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G444980
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 113055046-113055713 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

495 bp · TkA02G444980|TK1151|cDNA

CATTGTAAATGCTTTGCTAGCGGATTATATTATGCTGAAGCATGTCGTTGTAAAGGGTGCTTGAATCAACCTGTTTATGGAAGACTAGTCCAGGTGGCATGTGATAATATAAAAAAGCGGGTCCCACTTACATTTTCCCCCAAGATTCCTTCTTTTGAGGAGGGTGGTGACAAAACCAAAAAAGGTTGCAATTGTAGAAAGTTAACGTCCTGCCAACATTATTGTGGATGCTATAAGGCCAAAGTCGGATGCTCGGGTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

495 bp · TkA02G444980|TK1151|CDS

CATTGTAAATGCTTTGCTAGCGGATTATATTATGCTGAAGCATGTCGTTGTAAAGGGTGCTTGAATCAACCTGTTTATGGAAGACTAGTCCAGGTGGCATGTGATAATATAAAAAAGCGGGTCCCACTTACATTTTCCCCCAAGATTCCTTCTTTTGAGGAGGGTGGTGACAAAACCAAAAAAGGTTGCAATTGTAGAAAGTTAACGTCCTGCCAACATTATTGTGGATGCTATAAGGCCAAAGTCGGATGCTCGGGTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

164 aa · TkA02G444980|TK1151|PROTEIN

HCKCFASGLYYAEACRCKGCLNQPVYGRLVQVACDNIKKRVPLTFSPKIPSFEEGGDKTKKGCNCRKLTSCQHYCGCYKAKVGCSGECRCEGCKNVYGMKGGKCNKSLVTKNVLPYTPSEAGPSSNNEMMMRIGTSIEDEYDDMELPTFEQLEFLERFNTRHDR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G444980
TK1151 IDTkA02G444980
OH-1004 IDLXL04_005287
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 66.397
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G444980
位置Chr02:113055046-113055713 (-)
描述Similar to TCX2: Protein tesmin/TSO1-like CXC 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g14770 在雄性和雌性生殖组织的发育中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g22780 可能是花特异性细胞分裂成分，是花中正确器官形成所必需的。
Regulation of meristem organization and cell division by TSO1, an Arabidopsis gene with cysteine-rich repeats.2000 · DOI: 10.1242/dev.127.10.2207
TSO1 is a novel protein that modulates cytokinesis and cell expansion in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1242/dev.127.10.2219
TSO1 functions in cell division during Arabidopsis flower development.1997 · DOI: 10.1242/dev.124.3.665
Arabidopsis TSO1 regulates directional processes in cells during floral organogenesis.1998 · DOI: 10.1093/genetics/150.1.411
At3g22760 在雄性和雌性生殖组织的发育中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005287 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:0010235 guard mother cell cytokinesis 生物过程
GO:0010375 stomatal complex patterning 生物过程
GO:0010440 stomatal lineage progression 生物过程
GO:0010481 epidermal cell division 生物过程
GO:0048444 floral organ morphogenesis 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G04850
ath:AT3G22760
ath:AT3G22780
ath:AT4G14770
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.951
排名 1 · TkA02G444980 · TK1151
细胞质0.149
排名 2 · TkA02G444980 · TK1151
细胞膜0.018
排名 3 · TkA02G444980 · TK1151
线粒体0.013
排名 4 · TkA02G444980 · TK1151
内质网0.009
排名 5 · TkA02G444980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03638TCR2-23 aa
PF03638TCR60-95 aa
PF03638TCR101-107 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G444980PF03638TCR2231.2e-0835.9
TkA02G444980PF03638TCR60951.2e-0835.9
TkA02G444980PF03638TCR1011071.2e-0835.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JIF5拟南芥sp|F4JIF5|TCX2_ARATH Protein tesmin/TSO1-like CXC 237.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LUI3拟南芥sp|Q9LUI3|TSO1_ARATH CRC domain-containing protein TSO133.900%Swiss-Prot中等置信
Q8L548拟南芥sp|Q8L548|TCX3_ARATH Protein tesmin/TSO1-like CXC 341.700%Swiss-Prot中等置信

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