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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G383470
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 97460567-97468265 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1488 bp · TkA02G383470|TK1151|cDNA

ATGAGCCAATACTGTACAAAGATATATATATCGAAGTGTCGTGGTTTGTCCAATATGATTCCATATTATGCCCTAGGACAAATGCAAAAGCTTCAAAGGCTGGAAATAGACTCTTGCAACGATATGAAGGAGGTGTTTGAAACTCAAGGGATCAACAATGACAACAATATTGATGATGTAAATGGTGGTACACCGGCAATTCGAAGACCAAATGATGTTATTTTACTTAAACTTTCCAACCTAAAGTTTTTGAGAATTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1488 bp · TkA02G383470|TK1151|CDS

ATGAGCCAATACTGTACAAAGATATATATATCGAAGTGTCGTGGTTTGTCCAATATGATTCCATATTATGCCCTAGGACAAATGCAAAAGCTTCAAAGGCTGGAAATAGACTCTTGCAACGATATGAAGGAGGTGTTTGAAACTCAAGGGATCAACAATGACAACAATATTGATGATGTAAATGGTGGTACACCGGCAATTCGAAGACCAAATGATGTTATTTTACTTAAACTTTCCAACCTAAAGTTTTTGAGAATTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

495 aa · TkA02G383470|TK1151|PROTEIN

MSQYCTKIYISKCRGLSNMIPYYALGQMQKLQRLEIDSCNDMKEVFETQGINNDNNIDDVNGGTPAIRRPNDVILLKLSNLKFLRISSCHSLEYIFTFSALESLKQLEELLIDGCRRMKVIVKEENDGEQPTLSSSKVMVFPCLKSIKLVDLVDLVSFFLGMNEFRWPLLDKVTISGCPHMTSFTHGESKTPKLKYIHTRLGKHILEPAGLNFCPPILQRVDHTSLFPGPAKGMPWSFHNLIELIYVRYNHVHEKIIPCS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G383470
TK1151 IDTkA02G383470
OH-1004 IDLXL04_015200
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)53.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.364 / OH-1004 27.051
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G383470
位置Chr02:97460567-97468265 (-)
描述Similar to RPS2: Disease resistance protein RPS2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015200 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G61180
ath:AT1G61190
ath:AT4G26090
ath:AT4G27190
ath:AT4G27220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.503
排名 1 · TkA02G383470 · TK1151
细胞质0.424
排名 2 · TkA02G383470 · TK1151
细胞膜0.160
排名 3 · TkA02G383470 · TK1151
内质网0.061
排名 4 · TkA02G383470 · TK1151
细胞外0.049
排名 5 · TkA02G383470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25019LRR_R13L1-DRL216-39 aa
PF23247LRR_RPS27-57 aa
PF29594LRR_SKP210-117 aa
PF23952LRR_EndoS25-49 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2175-108 aa
PF23952LRR_EndoS76-121 aa
PF23247LRR_RPS278-183 aa
PF04399Glutaredoxin2_C116-151 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G383470PF25019LRR_R13L1-DRL216391.1e-0526.1
TkA02G383470PF23247LRR_RPS27576.9e-47160.1
TkA02G383470PF29594LRR_SKP2101170.859.5
TkA02G383470PF23952LRR_EndoS25490.0006420.6
TkA02G383470PF25019LRR_R13L1-DRL21751081.1e-0526.1
TkA02G383470PF23952LRR_EndoS761210.0006420.6
TkA02G383470PF23247LRR_RPS2781836.9e-47160.1
TkA02G383470PF04399Glutaredoxin2_C1161510.1312.8
TkA02G383470PF25019LRR_R13L1-DRL211391581.1e-0526.1
TkA02G383470PF25019LRR_R13L1-DRL211691971.1e-0526.1
TkA02G383470PF23247LRR_RPS22373716.9e-47160.1
TkA02G383470PF29594LRR_SKP22622870.859.5
TkA02G383470PF25019LRR_R13L1-DRL212652811.1e-0526.1
TkA02G383470PF23952LRR_EndoS2673190.0006420.6
TkA02G383470PF25019LRR_R13L1-DRL213073701.1e-0526.1
TkA02G383470PF29594LRR_SKP23303730.859.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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