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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G372710
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 94835306-94839402 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2149 bp · TkA02G372710|TK1151|cDNA

GTAAAATAATTGGGACAATGGTCCAAAAGCGTTCAGTGCTCTCACATGGCGACGATGCATGTGATGTGAATCATCGAGATCGGGCTCACCTACCATTATATTTTACGACAATCTTCACTTCACTTCTGCCCATAAATACCCACGAGGCCACGAAGCAAATCCCACAAATATCATCAATCCCTTTGCATTTTGCATAGTTAGATCCAACTTCTATGCAGCAGAAAGGAAGATCATTCAACAGTAGATCACGATCATTCTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1479 bp · TkA02G372710|TK1151|CDS

ATGGCTACTGTCGTTAATGGAGAAGAACGCGAGATTCAGAAGAATTACTGGGTGGAACACTCTGTCGACCTTACAGTTGAGGCTATGATGCTTGATTCTATGGCATCTGATCTTGACAAAGAAGAACGCCCTGAGGTACTGTCACTACTCCCACCTTATGAAGGGAAAACCGTTCTTGAACTAGGAGCTGGAATTGGTCGTTTTACTGGTGAACTAGTCAAAAAGGCTGGAAAGGTCATAGCCCTTGATTTCATTGAAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

492 aa · TkA02G372710|TK1151|PROTEIN

MATVVNGEEREIQKNYWVEHSVDLTVEAMMLDSMASDLDKEERPEVLSLLPPYEGKTVLELGAGIGRFTGELVKKAGKVIALDFIESVVKKNESNNGHHKNVEFMCADVTSPDLKFEAESIDLIFSNWLLMYLSDKEVENIAERLLKWVKVGGHIFFRESCFHQSGDHKRKSNPTHYREPRFYTKVFKECHVSNESGNSYELSLVGSKCIGAYVRNKKNQNQICWIWQKVNAEDDKGFQKFLDNVQYKSSGILRYERIFG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G372710
TK1151 IDTkA02G372710
OH-1004 IDLXL04_015043
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G372710
位置Chr02:94835306-94839402 (+)
描述Similar to NMT1: Phosphoethanolamine N-methyltransferase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g48600 催化磷酸单甲基乙醇胺和磷酸二甲基乙醇胺的 N-甲基化，这是将磷酸单乙醇胺转化为磷酸胆碱所需的两个甲基化步骤。
Identification of phosphomethylethanolamine N-methyltransferase from Arabidopsis and its role in choline and phospholipid metabolism.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m110.112151
At3g18000 参与磷酸胆碱生物合成。
The xipotl mutant of Arabidopsis reveals a critical role for phospholipid metabolism in root system development and epidermal cell integrity.2004 · DOI: 10.1105/tpc.103.018648
NMT1 and NMT3 N -Methyltransferase Activity Is Critical to Lipid Homeostasis, Morphogenesis, and Reproduction.2018 · DOI: 10.1104/pp.18.00457
Phosphoethanolamine N-methyltransferase 1 contributes to maintenance of root apical meristem by affecting ROS and auxin-regulated cell differentiation in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1111/nph.16028
At1g73600 参与磷酸胆碱生物合成。
NMT1 and NMT3 N -Methyltransferase Activity Is Critical to Lipid Homeostasis, Morphogenesis, and Reproduction.2018 · DOI: 10.1104/pp.18.00457

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015043 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006651 diacylglycerol biosynthetic process 生物过程
GO:0006656 phosphatidylcholine biosynthetic process 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0019432 triglyceride biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0042425 choline biosynthetic process 生物过程
GO:0046337 phosphatidylethanolamine metabolic process 生物过程
GO:0048528 post-embryonic root development 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48600
ath:AT1G73600
ath:AT3G18000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.727
排名 1 · TkA02G372710 · TK1151
细胞核0.396
排名 2 · TkA02G372710 · TK1151
线粒体0.070
排名 3 · TkA02G372710 · TK1151
过氧化物酶体0.053
排名 4 · TkA02G372710 · TK1151
细胞膜0.053
排名 5 · TkA02G372710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01209Ubie_methyltran32-157 aa
PF13489Methyltransf_2343-164 aa
PF08003Methyltransf_946-80 aa
PF05175MTS47-127 aa
PF01189Methyltr_RsmB-F49-124 aa
PF01135PCMT50-108 aa
PF00398RrnaAD50-114 aa
PF01269Fibrillarin53-127 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G372710PF01209Ubie_methyltran321576.3e-2072.2
TkA02G372710PF13489Methyltransf_23431641.2e-29103.9
TkA02G372710PF08003Methyltransf_946800.0002520.8
TkA02G372710PF05175MTS471275.4e-0936.6
TkA02G372710PF01189Methyltr_RsmB-F491240.08713.2
TkA02G372710PF01135PCMT501083e-0937.7
TkA02G372710PF00398RrnaAD501140.000122.2
TkA02G372710PF01269Fibrillarin531270.01115.6
TkA02G372710PF10294Methyltransf_16531260.01615.7
TkA02G372710PF13847Methyltransf_31541781.2e-36126.4
TkA02G372710PF02353CMAS54845.6e-1556.1
TkA02G372710PF01728FtsJ541262.2e-0835.0
TkA02G372710PF07021MetW54721.5e-0628.7
TkA02G372710PF06325PrmA551550.0006819.9
TkA02G372710PF05891Methyltransf_PK561924.6e-1246.7
TkA02G372710PF00891Methyltransf_2561715.7e-0833.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q944H0拟南芥sp|Q944H0|PEAM2_ARATH Phosphoethanolamine N-methyltransferase 283.300%Swiss-Prot高置信
Q9FR44拟南芥sp|Q9FR44|PEAM1_ARATH Phosphoethanolamine N-methyltransferase 182.400%Swiss-Prot高置信
Q9C6B9拟南芥sp|Q9C6B9|PEAM3_ARATH Phosphoethanolamine N-methyltransferase 381.400%Swiss-Prot高置信

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