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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G371100
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 94449507-94455074 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3147 bp · TkA02G371100|TK1151|cDNA

CTCTCCTCTTGTCTTGATCTTGAAAGTGTGAGTTCGTTTTCGTGTATCTATACTCTTTCTCTTTTCTCTGACTCTGTTCGCAAGAAATTTATTTAAAACTTCAAAGCTGCAAATGTAATCACCCAATATAACCGAAGTGTGTGACAGCAGGTTCAGATTGTAGCATGCACTCCCTTTTCTTTCCTCCTTTCTGCTTTCTGAATCATATTTTAATTTAAAAAAAACACACACTTCTCTGTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

2568 bp · TkA02G371100|TK1151|CDS

ATGACCACTTTCACAGAAAGTATGGCCGCCATTGAAGAGAAGCTCAATTCATCAGGTGTGAACAGTGGGGCACACAGCTTACTTGAAGAGATGAAATTGTTGAAGGAAATGCAGGACCATTCTGTGCTAAAGAAGCCAATAAATTCGGAGCTGTGGCATGCATGTGCTGGGCCATTGGTGTCTCTTCCACAAGTTGGAAGCCTTGTTTATTACTTCCCACAAGGACATAGCGAACAGGTTGCAGTTTCGACCAATAGAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

855 aa · TkA02G371100|TK1151|PROTEIN

MTTFTESMAAIEEKLNSSGVNSGAHSLLEEMKLLKEMQDHSVLKKPINSELWHACAGPLVSLPQVGSLVYYFPQGHSEQVAVSTNRTATSQVPNYPNLPSQLLCQVLNATLHADKDTDEIYAQMSLRPVNSEKDVLPIPDFGMKPSRHPTEFFCKTLTPSDTSTHGGFSVPRRAAEKLFPQLDFSMQPPTQELVVRDLHDNTWTFRHIYRGQPKRHLLTTGWSMFVGAKRLKAGDAVLFIRDEKSQLLLGVRRANRQQTS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G371100
TK1151 IDTkA02G371100
OH-1004 IDLXL04_015063
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G371100
位置Chr02:94449507-94455074 (+)
描述Similar to ARF5: Auxin response factor 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g19850 生长素反应因子 是与生长素反应启动子元件 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。
Overlapping and non-redundant functions of the Arabidopsis auxin response factors MONOPTEROS and NONPHOTOTROPIC HYPOCOTYL 4.2004 · DOI: 10.1242/dev.00925
AMP1 and MP antagonistically regulate embryo and meristem development in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1242/dev.006759

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q01K26 生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os04g0664400 生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2X1A1 生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os02g0164900 生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015063 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009942 longitudinal axis specification 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048507 meristem development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19850
dosa:Os04g0664400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.959
排名 1 · TkA02G371100 · TK1151
细胞质0.102
排名 2 · TkA02G371100 · TK1151
细胞膜0.031
排名 3 · TkA02G371100 · TK1151
内质网0.020
排名 4 · TkA02G371100 · TK1151
质体0.017
排名 5 · TkA02G371100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25313BRWD_AD62-91 aa
PF02362B3153-254 aa
PF02362B3260-283 aa
PF25313BRWD_AD282-385 aa
PF06507ARF_AD302-384 aa
PF02309AUX_IAA728-818 aa
PF00564PB1739-795 aa
PF02362B3759-801 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G371100PF25313BRWD_AD62914.4e-0937.3
TkA02G371100PF02362B31532541.9e-2383.0
TkA02G371100PF02362B32602831.9e-2383.0
TkA02G371100PF25313BRWD_AD2823854.4e-0937.3
TkA02G371100PF06507ARF_AD3023843.8e-31107.5
TkA02G371100PF02309AUX_IAA7288182.8e-1247.6
TkA02G371100PF00564PB17397950.1113.2
TkA02G371100PF02362B37598011.9e-2383.0
TkA02G371100PF06507ARF_AD7757873.8e-31107.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P93024拟南芥sp|P93024|ARFE_ARATH Auxin response factor 557.800%Swiss-Prot高置信
Q01K26水稻sp|Q01K26|ARFK_ORYSI Auxin response factor 1146.400%Swiss-Prot中等置信
Q8S983水稻sp|Q8S983|ARFK_ORYSJ Auxin response factor 1146.400%Swiss-Prot中等置信
A2X1A1水稻sp|A2X1A1|ARFF_ORYSI Auxin response factor 643.700%Swiss-Prot中等置信
Q6H6V4水稻sp|Q6H6V4|ARFF_ORYSJ Auxin response factor 643.700%Swiss-Prot中等置信

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