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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G367410
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 93474993-93476256 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1056 bp · TkA02G367410|TK1151|cDNA

TTGTTTCCTCCCACCTCAGCCCTCCGCTACGGCTGTTTCTCCATCGATTCCTCCCACCTCAGCCCTCCGCCACCACCTGCGCTCCTCCGCCTGCACTCGACGACCACGACCACGTCTGTTTCTCCATCGATTCCTCCACATCGCATCGCATCACCGTTTCCGACCACGACTGTTTGCACTAACGAGAAGACTGAAGCTATAGAGTTGCCCCATTGTCTGGTGAGTTGCGCTTCGTTGGAGTTATTAAGGTTTTCAGGTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1056 bp · TkA02G367410|TK1151|CDS

TTGTTTCCTCCCACCTCAGCCCTCCGCTACGGCTGTTTCTCCATCGATTCCTCCCACCTCAGCCCTCCGCCACCACCTGCGCTCCTCCGCCTGCACTCGACGACCACGACCACGTCTGTTTCTCCATCGATTCCTCCACATCGCATCGCATCACCGTTTCCGACCACGACTGTTTGCACTAACGAGAAGACTGAAGCTATAGAGTTGCCCCATTGTCTGGTGAGTTGCGCTTCGTTGGAGTTATTAAGGTTTTCAGGTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

351 aa · TkA02G367410|TK1151|PROTEIN

LFPPTSALRYGCFSIDSSHLSPPPPPALLRLHSTTTTTSVSPSIPPHRIASPFPTTTVCTNEKTEAIELPHCLVSCASLELLRFSGLSNCGLIFPKVMGFPALRVLQLTYVELLEDDDSVKRILESCQLLEDLSFEDCVLCKLDRLYISCPKFKRLSIINWEDVGCHGIEISCPILVDLDLTGHIACKFFFQPVDSLKKAVIEPKFVGNTTSVLYSGICRVEYLSIDLYSFSKIWNLGSPDPNFTLDAHLKGVNCLDYFT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G367410
TK1151 IDTkA02G367410
OH-1004 IDLXL04_024587
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)89.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.430 / OH-1004 95.902
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G367410
位置Chr02:93474993-93476256 (-)
描述Similar to At1g79990: Coatomer subunit beta'-1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g79990 包裹体是一个胞质蛋白复合物，可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合，进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 暂无已核实直接文献
At1g52360 包裹体是一个胞质蛋白复合物，可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合，进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 暂无已核实直接文献
At3g15980 包裹体是一个胞质蛋白复合物，可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合，进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0143900 包裹体是一个胞质蛋白复合物，可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合，进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024587 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0006890 retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum 生物过程
GO:0006891 intra-Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0030126 COPI vesicle coat 细胞组分
GO:0005198 structural molecule activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G52360
ath:AT1G79990
ath:AT3G15980
dosa:Os02g0209100
dosa:Os06g0143900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.726
排名 1 · TkA02G367410 · TK1151
细胞质0.255
排名 2 · TkA02G367410 · TK1151
细胞膜0.065
排名 3 · TkA02G367410 · TK1151
内质网0.058
排名 4 · TkA02G367410 · TK1151
线粒体0.025
排名 5 · TkA02G367410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24758LRR_At5g5637020-38 aa
PF24758LRR_At5g5637064-165 aa
PF07723LRR_2103-127 aa
PF23761Beta-prop_DCAF4204-299 aa
PF25175Beta-prop_WDR5233-296 aa
PF25174Beta-prop_THOC3233-306 aa
PF25172Beta-prop_WDR3_2nd233-305 aa
PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd233-321 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G367410PF24758LRR_At5g5637020385.3e-0833.5
TkA02G367410PF24758LRR_At5g56370641655.3e-0833.5
TkA02G367410PF07723LRR_21031270.114.0
TkA02G367410PF23761Beta-prop_DCAF42042990.001118.7
TkA02G367410PF25175Beta-prop_WDR52332962.2e-1144.3
TkA02G367410PF25174Beta-prop_THOC32333065e-0729.7
TkA02G367410PF25172Beta-prop_WDR3_2nd2333050.001218.9
TkA02G367410PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd2333210.004816.6
TkA02G367410PF25173Beta-prop_WDR3_1st2342991.8e-0938.3
TkA02G367410PF23381Beta-prop_IFT122_1st2343030.0001222.3
TkA02G367410PF00400WD402422805.4e-0833.8
TkA02G367410PF24817WD40_WDHD1_1st2423040.002417.8
TkA02G367410PF23409Beta-prop_EML2473060.007616.5
TkA02G367410PF24805EIF3I2472960.02214.6
TkA02G367410PF24796WDR552473060.04813.4
TkA02G367410PF24814WD40_Prp192493073.3e-0523.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAA0拟南芥sp|Q9CAA0|COB21_ARATH Coatomer subunit beta'-147.400%Swiss-Prot低置信
Q9C827拟南芥sp|Q9C827|COB22_ARATH Coatomer subunit beta'-246.300%Swiss-Prot低置信
Q8L828拟南芥sp|Q8L828|COB23_ARATH Coatomer subunit beta'-334.300%Swiss-Prot低置信
Q5VQ78水稻sp|Q5VQ78|COB21_ORYSJ Coatomer subunit beta'-133.100%Swiss-Prot低置信

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