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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G358380
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 91038423-91041148 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

967 bp · TkA02G358380|TK1151|cDNA

AACCTCAGTTGAGGTTTATATTTTTAAATTTAGTAGTTCAGGCCTTCTAGCATCCTTGATACTTTCAAGTTATCTTTCTAGTGACTTAGAAACCATAAAGGCGATAAGTTATGAGAGCTCCGAAATGGGATGCACGATTAGGCTTAAACAGAGGTAAGTGGACTGCCGAAGAAGATGAAAAGTTATTAACCTACATCAGTAAATACGGCATTTGGAATTGGTGTAAGATGCCTCCGTATGCAGGTCTTTCCAGAACCGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

687 bp · TkA02G358380|TK1151|CDS

ATGAGAGCTCCGAAATGGGATGCACGATTAGGCTTAAACAGAGGTAAGTGGACTGCCGAAGAAGATGAAAAGTTATTAACCTACATCAGTAAATACGGCATTTGGAATTGGTGTAAGATGCCTCCGTATGCAGGTCTTTCCAGAACCGGAAAAAGTTGCAGGTTAAGATGGATGAATTATTTGAAGCCAAATATAAAACGAGGAAATTTCACAAGTGAAGACGAAGAAACAATAATTCATTACCATTCAATTCTAGGGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

228 aa · TkA02G358380|TK1151|PROTEIN

MRAPKWDARLGLNRGKWTAEEDEKLLTYISKYGIWNWCKMPPYAGLSRTGKSCRLRWMNYLKPNIKRGNFTSEDEETIIHYHSILGNRWSAIAKKIPGRTDNEVKNYWHAHLMKKQMAKYPISETKPANIQTSNNDVESSIKSTIDHFVSSITEDYNTSSCMLHKYDRCEHKPIKLETSHDMSSPGTVEDIESLWQQLYANNQDIELQNLLEDTFSCESIGFSNSNNM

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G358380
TK1151 IDTkA02G358380
OH-1004 IDLXL04_015179
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 50.000 / OH-1004 89.062
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G358380
位置Chr02:91038423-91041148 (-)
描述Similar to MYB15: Transcription factor MYB15
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g23250 转录因子，参与CBF基因的低温调控以及抗冻能力的发育。
A R2R3 type MYB transcription factor is involved in the cold regulation of CBF genes and in acquired freezing tolerance.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m605895200
Transgenic expression of MYB15 confers enhanced sensitivity to abscisic acid and improved drought tolerance in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1016/s1673-8527(09)60003-5
At2g31180 转录激活剂，通过影响 CBF 基因的表达来调节耐冻性。
AtMYB14 Regulates Cold Tolerance in Arabidopsis. 2013 · DOI: 10.1007/s11105-012-0481-z
At4g05100 可能在盐胁迫响应中发挥作用的可能转录因子。
Salt-induced transcription factor MYB74 is regulated by the RNA-directed DNA methylation pathway in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1093/jxb/erv312

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0624300 作为耐冷性的负调控因子。
The OsMYB30 Transcription Factor Suppresses Cold Tolerance by Interacting with a JAZ Protein and Suppressing β-Amylase Expression.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01725
Os04g0517100 参与低温胁迫反应的转录激活因子。
Overexpression of the rice Osmyb4 gene increases chilling and freezing tolerance of Arabidopsis thaliana plants.2004 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01938.x
Supra-optimal expression of the cold-regulated OsMyb4 transcription factor in transgenic rice changes the complexity of transcriptional network with major effects on stress tolerance and panicle development.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2010.02221.x
The rice Osmyb4 gene enhances tolerance to frost and improves germination under unfavourable conditions in transgenic barley plants.2012 · DOI: 10.1007/s13353-011-0081-x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015179 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0050826 response to freezing 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G31180
ath:AT3G23250
ath:AT4G05100
dosa:Os02g0624300
dosa:Os04g0517100
osa:4330027
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.892
排名 1 · TkA02G358380 · TK1151
细胞质0.223
排名 2 · TkA02G358380 · TK1151
线粒体0.029
排名 3 · TkA02G358380 · TK1151
细胞膜0.018
排名 4 · TkA02G358380 · TK1151
内质网0.008
排名 5 · TkA02G358380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249Myb_DNA-binding14-61 aa
PF23588HTH_CHD1_Hrp315-40 aa
PF09111SLIDE15-36 aa
PF23082Myb_DNA-binding_216-32 aa
PF13921Myb_DNA-bind_617-75 aa
PF09111SLIDE60-96 aa
PF00249Myb_DNA-binding67-112 aa
PF13921Myb_DNA-bind_670-124 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G358380PF00249Myb_DNA-binding14614.8e-34116.9
TkA02G358380PF23588HTH_CHD1_Hrp315400.003618.0
TkA02G358380PF09111SLIDE15360.1113.3
TkA02G358380PF23082Myb_DNA-binding_216320.01316.3
TkA02G358380PF13921Myb_DNA-bind_617759.2e-2174.5
TkA02G358380PF09111SLIDE60960.1113.3
TkA02G358380PF00249Myb_DNA-binding671124.8e-34116.9
TkA02G358380PF13921Myb_DNA-bind_6701249.2e-2174.5
TkA02G358380PF23082Myb_DNA-binding_2871040.01316.3
TkA02G358380PF23082Myb_DNA-binding_21111230.01316.3
TkA02G358380PF03659Glyco_hydro_711152030.01115.2
TkA02G358380PF09111SLIDE1301540.1113.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LTC4拟南芥sp|Q9LTC4|MYB15_ARATH Transcription factor MYB1559.500%Swiss-Prot中等置信
Q9SJX8拟南芥sp|Q9SJX8|MYB14_ARATH Transcription factor MYB1455.000%Swiss-Prot中等置信
Q9M0Y5拟南芥sp|Q9M0Y5|MYB74_ARATH Transcription factor MYB7456.300%Swiss-Prot中等置信
Q6K1S6水稻sp|Q6K1S6|MYB30_ORYSJ Transcription factor MYB3060.000%Swiss-Prot中等置信
Q7XBH4水稻sp|Q7XBH4|MYB4_ORYSJ Transcription factor MYB461.700%Swiss-Prot低置信

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