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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G348840
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 88672121-88690525 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5179 bp · TkA02G348840|TK1151|cDNA

TAAAGCAATTAAAAACCACACCTACAAATTTTGCAATTAACTCTTGTCGTACATATCCCATTATTCAAATCTTGACTACAGCTGTCCTGTTCGATTTCCTGTTTGGAAATTTTGTACAATAATTCTCTCTTTTGAGTCTATAGCCACCCATCTTTCTCATCTTATCTCTCAGAACAGGAAATTTTGTACAATAATTTTCTCTTTTGAGTCTATGGCCACCCATCTTTCTCATCTTATCTCTCAGTTCTTCGTCTCCAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

5886 bp · TkA02G348840|TK1151|CDS

ATGGAGGTTGCTAATGAAATAGCGAAAGGAGTTGTTCAGGTTCTCATGGTTCCGGTTAAAAAACAATTGGATTACGTAATTTCCCACAAAAAATATCTGGAGGATATGCACAAAAAAATGAAGGATTTGGATGCTAAAAAAGTCGGCGTTGAATCCCAAAAGAAGCAAAACAGAGAAAGACGTCTTGAGGTTCCTGCCGAAGTCAGCCCTTGGTTGGAAGAAGTAGAACATATGAATGCAAAGGTGGCAGATTTTCCAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1961 aa · TkA02G348840|TK1151|PROTEIN

MEVANEIAKGVVQVLMVPVKKQLDYVISHKKYLEDMHKKMKDLDAKKVGVESQKKQNRERRLEVPAEVSPWLEEVEHMNAKVADFPSEVTGCLDLKSRHKLGSKASKIIKEIDSVLGRCPEIRGTELQIPLGRIDSTIGSTSTLSSDRSDFRSREHTFTKALEALGPNHSSHMVALWGMGGVGKTTMMKKLKEVVVEKKMFNHYVEVVIGEKTDPIAIQRAVAEYLGIDLTQTSKSARTDKLRTWFVNNSDGGKKKFLVI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G348840
TK1151 IDTkA02G348840
OH-1004 IDLXL04_015282
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)81.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.592 / OH-1004 99.600
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G348840
位置Chr02:88672121-88690525 (+)
描述Similar to At4g27220: Probable disease resistance protein At4g27220
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27220 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g27190 抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g15890 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g26090 疾病抗性（R）蛋白，能特异性识别来自铜绿假单胞菌（Pseudomonas syringae）的AvrRpt2 III型效应子致病蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g12280 抗病蛋白，可介导对细菌病原体番茄青枯假单胞菌（Pseudomonas syringae pv tomato）DC3000株及高毒性卵菌Hyaloperonospora arabidopsidis Noco2分离株的防御反应。
The MEKK1-MKK1/MKK2-MPK4 kinase cascade negatively regulates immunity mediated by a mitogen-activated protein kinase kinase kinase in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.097253

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015282 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G61180
ath:AT4G10780
ath:AT4G26090
ath:AT4G27190
ath:AT4G27220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.488
排名 1 · TkA02G348840 · TK1151
细胞质0.324
排名 2 · TkA02G348840 · TK1151
细胞核0.246
排名 3 · TkA02G348840 · TK1151
内质网0.091
排名 4 · TkA02G348840 · TK1151
细胞外0.046
排名 5 · TkA02G348840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25019LRR_R13L1-DRL21147-188 aa
PF13191AAA_16153-210 aa
PF00931NB-ARC155-323 aa
PF25201nSTAND6155-228 aa
PF20720nSTAND3158-199 aa
PF03193RsgA_GTPase160-193 aa
PF01637ATPase_2162-269 aa
PF13604AAA_30171-227 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G348840PF25019LRR_R13L1-DRL211471885.2e-0523.9
TkA02G348840PF13191AAA_161532100.02116.1
TkA02G348840PF00931NB-ARC1553231.6e-2487.1
TkA02G348840PF25201nSTAND61552280.0215.7
TkA02G348840PF20720nSTAND31581992.58.5
TkA02G348840PF03193RsgA_GTPase1601930.1612.5
TkA02G348840PF01637ATPase_21622690.1212.8
TkA02G348840PF13604AAA_301712270.06813.6
TkA02G348840PF13401AAA_221722630.001719.4
TkA02G348840PF23952LRR_EndoS5166280.0001223.0
TkA02G348840PF12799LRR_45225370.000421.3
TkA02G348840PF23598LRR_145255562.1e-1350.5
TkA02G348840PF13855LRR_85285840.8210.2
TkA02G348840PF23247LRR_RPS25526074.2e-125414.3
TkA02G348840PF25019LRR_R13L1-DRL215526075.2e-0523.9
TkA02G348840PF23598LRR_145626502.1e-1350.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81825拟南芥sp|O81825|DRL28_ARATH Probable disease resistance protein At4g2722030.000%Swiss-Prot低置信
Q9T048拟南芥sp|Q9T048|DRL27_ARATH Disease resistance protein At4g2719030.900%Swiss-Prot低置信
Q9LMP6拟南芥sp|Q9LMP6|DRL3_ARATH Probable disease resistance protein At1g1589025.700%Swiss-Prot低置信
Q42484拟南芥sp|Q42484|RPS2_ARATH Disease resistance protein RPS227.000%Swiss-Prot低置信
P60838拟南芥sp|P60838|SUMM2_ARATH Disease resistance protein SUMM228.000%Swiss-Prot低置信

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