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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G321390
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 81645834-81646322 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

309 bp · TkA02G321390|TK1151|cDNA

ATGAGATTCAAACTGTTAACATTAAGAGTGTGGGAGCTGATTATGAGGTGTCTGATGGAGAGGTTGCCTTTAGGATTTAAAGAACTGGGAACATGTGATCTCTACCCACAAAGCTTGAAACACAACCCAAATGGGAGGTTTGTAGCTGTGTGGGGTGGTGGTGAATACATCATATACACAGCTTTAGCATGGAGAAATAGATCCTTTGGGTCTGCATTGGAGATTGTTTGGTCAACTAATGGTGAATGTGTTGTTAGAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

309 bp · TkA02G321390|TK1151|CDS

ATGAGATTCAAACTGTTAACATTAAGAGTGTGGGAGCTGATTATGAGGTGTCTGATGGAGAGGTTGCCTTTAGGATTTAAAGAACTGGGAACATGTGATCTCTACCCACAAAGCTTGAAACACAACCCAAATGGGAGGTTTGTAGCTGTGTGGGGTGGTGGTGAATACATCATATACACAGCTTTAGCATGGAGAAATAGATCCTTTGGGTCTGCATTGGAGATTGTTTGGTCAACTAATGGTGAATGTGTTGTTAGAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

102 aa · TkA02G321390|TK1151|PROTEIN

MRFKLLTLRVWELIMRCLMERLPLGFKELGTCDLYPQSLKHNPNGRFVAVWGGGEYIIYTALAWRNRSFGSALEIVWSTNGECVVRENTIKIKIFNKSFQFH

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G321390
TK1151 IDTkA02G321390
OH-1004 IDLXL04_008495
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)87.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 79.412 / OH-1004 8.891
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G321390
位置Chr02:81645834-81646322 (+)
描述Similar to At1g52360: Coatomer subunit beta'-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g15980 包裹体是一个胞质蛋白复合物，可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合，进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 暂无已核实直接文献
At1g52360 包裹体是一个胞质蛋白复合物，可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合，进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 暂无已核实直接文献
At1g79990 包裹体是一个胞质蛋白复合物，可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合，进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0143900 包裹体是一个胞质蛋白复合物，可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合，进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 暂无已核实直接文献
Os02g0209100 包裹体是一个胞质蛋白复合物，可以结合二赖氨酸基序并可逆地与高尔基非网格蛋白囊泡结合，进一步介导从 ER 经高尔基体到反式高尔基体网络的生物合成蛋白运输。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008495 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0006890 retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum 生物过程
GO:0006891 intra-Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0030126 COPI vesicle coat 细胞组分
GO:0005198 structural molecule activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G52360
ath:AT1G79990
ath:AT3G15980
dosa:Os02g0209100
dosa:Os06g0143900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.402
排名 1 · TkA02G321390 · TK1151
细胞质0.363
排名 2 · TkA02G321390 · TK1151
内质网0.140
排名 3 · TkA02G321390 · TK1151
高尔基体0.114
排名 4 · TkA02G321390 · TK1151
细胞膜0.089
排名 5 · TkA02G321390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04053B-prop_COPA_B_2nd20-99 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G321390PF04053B-prop_COPA_B_2nd20991.1e-2488.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L828拟南芥sp|Q8L828|COB23_ARATH Coatomer subunit beta'-381.500%Swiss-Prot高置信
Q9C827拟南芥sp|Q9C827|COB22_ARATH Coatomer subunit beta'-281.500%Swiss-Prot高置信
Q9CAA0拟南芥sp|Q9CAA0|COB21_ARATH Coatomer subunit beta'-181.500%Swiss-Prot高置信
Q5VQ78水稻sp|Q5VQ78|COB21_ORYSJ Coatomer subunit beta'-179.000%Swiss-Prot高置信
Q6H8D5水稻sp|Q6H8D5|COB22_ORYSJ Coatomer subunit beta'-279.000%Swiss-Prot高置信

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