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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G309360
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 78729373-78737676 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2064 bp · TkA02G309360|TK1151|cDNA

GTTGAACCCACGCATCTTCAACTTCAACTCATAAATAGCATTCAAGGAAAGATCAACAATTGATACTTTTCTATGTCTTTCCTTCAAGCATCAGTTATATATAAAGTTGAACCCACGCATCTTCAACTTCAACTCATCAAATATCCTTCTTTTTTTCAACTCACGTATGGCTAACACTCCGATCCTGGTGCTCTTATTTCTAGTTTTGTGGGCTTCAACCACCACCGCCATCCCACCACCACCACCAATTCAGTGCACCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1743 bp · TkA02G309360|TK1151|CDS

ATGGCTAACACTCCGATCCTGGTGCTCTTATTTCTAGTTTTGTGGGCTTCAACCACCACCGCCATCCCACCACCACCACCAATTCAGTGCACCGTCGGAACCACCGGCTGCACCCTCCACAACTCCTACGGCATATGGGGTGACAGAAAAGACTGTCTTGCCTCCCACGTCATCTACCCAACGACCCAACAACAACTTCTCTCAATCGTAGCCAATGCAGCCAAAAACAAACTTAAACTCAAAGTAGTCTCCAAATTCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

580 aa · TkA02G309360|TK1151|PROTEIN

MANTPILVLLFLVLWASTTTAIPPPPPIQCTVGTTGCTLHNSYGIWGDRKDCLASHVIYPTTQQQLLSIVANAAKNKLKLKVVSKFSHTIPKFACPAAGNSSVLISTEKYNSGIDIDVAGLTVTADAGVSLRDLINKVENAGLSLVAAPYWEGVSVGGVISTGAHGSSWWGKGGAVHDHVVKIDMVVPAKENEGFAKILHLDSKNQLFNAAKVSLGTLGIISKVTLSLEKWFKRSITFNFTDDGGLEDEFISHAKAHEFG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G309360
TK1151 IDTkA02G309360
OH-1004 IDLXL04_015610
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G309360
位置Chr02:78729373-78737676 (-)
描述Similar to GULLO3: L-gulonolactone oxidase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g11540 催化 L-古洛糖-1,4-内酯氧化为抗坏血酸。 暂无已核实直接文献
At2g46740 催化 L-古洛糖-1,4-内酯氧化为抗坏血酸。 暂无已核实直接文献
At2g46750 催化 L-古洛糖-1,4-内酯氧化为抗坏血酸。
The contribution of Arabidopsis homologs of L-gulono-1,4-lactone oxidase to the biosynthesis of ascorbic acid.2010 · DOI: 10.1271/bbb.100157
At2g46760 可能参与抗坏血酸的生物合成。 暂无已核实直接文献
At1g32300 可能参与抗坏血酸的生物合成。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015610 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0019853 L-ascorbic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0003885 D-arabinono-1,4-lactone oxidase activity 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0050105 L-gulonolactone oxidase activity 分子功能
GO:0071949 FAD binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G32300
ath:AT2G46740
ath:AT2G46750
ath:AT2G46760
ath:AT5G11540
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.340
排名 1 · TkA02G309360 · TK1151
溶酶体／液泡0.271
排名 2 · TkA02G309360 · TK1151
细胞膜0.160
排名 3 · TkA02G309360 · TK1151
内质网0.110
排名 4 · TkA02G309360 · TK1151
细胞质0.100
排名 5 · TkA02G309360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20381Rv147650-83 aa
PF01565FAD_binding_455-187 aa
PF25638DUF5983_N69-88 aa
PF20381Rv1476111-142 aa
PF25638DUF5983_N128-145 aa
PF04030ALO247-285 aa
PF01565FAD_binding_4276-302 aa
PF17492D_CNTX322-334 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G309360PF20381Rv147650830.1212.8
TkA02G309360PF01565FAD_binding_4551872.2e-1763.8
TkA02G309360PF25638DUF5983_N69880.1912.1
TkA02G309360PF20381Rv14761111420.1212.8
TkA02G309360PF25638DUF5983_N1281450.1912.1
TkA02G309360PF04030ALO2472854.4e-1556.8
TkA02G309360PF01565FAD_binding_42763022.2e-1763.8
TkA02G309360PF17492D_CNTX3223342.98.9
TkA02G309360PF01565FAD_binding_44254482.2e-1763.8
TkA02G309360PF04030ALO4275244.4e-1556.8
TkA02G309360PF22906GULLO2-like_3rd5365746.4e-2071.3
TkA02G309360PF17492D_CNTX5365602.98.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LYD8拟南芥sp|Q9LYD8|GGLO3_ARATH L-gulonolactone oxidase 366.100%Swiss-Prot高置信
O81030拟南芥sp|O81030|GGLO5_ARATH L-gulonolactone oxidase 546.000%Swiss-Prot中等置信
Q6NQ66拟南芥sp|Q6NQ66|GGLO2_ARATH L-gulonolactone oxidase 246.200%Swiss-Prot中等置信
O81032拟南芥sp|O81032|GGLO6_ARATH Probable L-gulonolactone oxidase 646.400%Swiss-Prot中等置信
Q9C614拟南芥sp|Q9C614|GGLO1_ARATH Probable L-gulonolactone oxidase 144.400%Swiss-Prot中等置信

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