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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G278230
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 71027734-71034388 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3179 bp · TkA02G278230|TK1151|cDNA

TTTTGTTTCGCAACCAATTTTCCCCTCACACACACACACACACACTCCACCTGCTCCCATCGTTTGCTTCTTTCCCGTTTATATACATACACGCAGGTGGAGGGAACCATAAAACCCTAAAACCGGTGATTAATGGAAAGTTCAGATCCGGAATCAAGCACCAAAAATAATAAATGGATGGCATTCGATAATCAAAACAAACCGCCAATCGCTAGAATCACTCCACCTGAAGATGAATATGACACGGATCACATAGCCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1656 bp · TkA02G278230|TK1151|CDS

ATGGAAAGTTCAGATCCGGAATCAAGCACCAAAAATAATAAATGGATGGCATTCGATAATCAAAACAAACCGCCAATCGCTAGAATCACTCCACCTGAAGATGAATATGACACGGATCACATAGCCGAACGGACAGCGGCTTGGCCGGGAGCAACAGCAGTCGCAGGTTTAATCGGGGATGAGGAGAGAAATAAGCGAAGCTCATCGTCGTCATGGAGGACGTCAGATGATTTGAATCATCAACCGCGAGTCTCGCAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

551 aa · TkA02G278230|TK1151|PROTEIN

MESSDPESSTKNNKWMAFDNQNKPPIARITPPEDEYDTDHIAERTAAWPGATAVAGLIGDEERNKRSSSSSWRTSDDLNHQPRVSQDLKDALATLQQTFVVSDATKPDCPIMYASSGFFTMTGYSSKEVIGRNCRFLQGKETDQKEVDKIRNAVKTGTSYCGRLYNYKKDGTPFWNLLTVTPIKDENGKTIKFIGMQVEVSKYTEGVNDKELRPNGLPTSLIRYDARQKETALGSIVEVVQTVERPRTNNQSSKTETVER...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G278230
TK1151 IDTkA02G278230
OH-1004 IDLXL04_016001
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.103 / OH-1004 57.658
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G278230
位置Chr02:71027734-71034388 (-)
描述Similar to PHOT2: Phototropin-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58140 在光诱导运动的信号传导通路中，作为蓝光光受体的蛋白激酶。
Arabidopsis NPL1: a phototropin homolog controlling the chloroplast high-light avoidance response.2001 · DOI: 10.1126/science.291.5511.2138
Arabidopsis nph1 and npl1: blue light receptors that mediate both phototropism and chloroplast relocation.2001 · DOI: 10.1073/pnas.101137598
Phot1 and phot2 mediate blue light-induced transient increases in cytosolic Ca2+ differently in Arabidopsis leaves.2003 · DOI: 10.1073/pnas.1336802100
A transgene encoding a blue-light receptor, phot1, restores blue-light responses in the Arabidopsis phot1 phot2 double mutant.2004 · DOI: 10.1093/jxb/erh044
Functional analysis of each blue light receptor, cry1, cry2, phot1, and phot2, by using combinatorial multiple mutants in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0305984101
RPT2 is a signal transducer involved in phototropic response and stomatal opening by association with phototropin 1 in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019901
Biochemical characterization of plasma membrane H+-ATPase activation in guard cell protoplasts of Arabidopsis thaliana in response to blue light.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci104
An ATP-Binding Cassette Transporter, ABCB19, Regulates Leaf Position and Morphology during Phototropin1-Mediated Blue Light Responses.2020 · DOI: 10.1104/pp.20.00223
At3g45780 蛋白激酶，在光诱导运动的信号转导途径中作为蓝光（BL）光受体。
RPT2. A signal transducer of the phototropic response in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.2.225
Unexpected roles for cryptochrome 2 and phototropin revealed by high-resolution analysis of blue light-mediated hypocotyl growth inhibition.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01038.x
Phototropin 1 is required for high-fluence blue-light-mediated mRNA destabilization.2003 · DOI: 10.1023/a:1022393406204
Phot1 and phot2 mediate blue light-induced transient increases in cytosolic Ca2+ differently in Arabidopsis leaves.2003 · DOI: 10.1073/pnas.1336802100
A transgene encoding a blue-light receptor, phot1, restores blue-light responses in the Arabidopsis phot1 phot2 double mutant.2004 · DOI: 10.1093/jxb/erh044
Functional analysis of each blue light receptor, cry1, cry2, phot1, and phot2, by using combinatorial multiple mutants in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0305984101
RPT2 is a signal transducer involved in phototropic response and stomatal opening by association with phototropin 1 in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019901
Biochemical characterization of plasma membrane H+-ATPase activation in guard cell protoplasts of Arabidopsis thaliana in response to blue light.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci104
PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE 1 is a phototropin 1 binding protein required for phototropism.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0603799103
In vivo phosphorylation site mapping and functional characterization of Arabidopsis phototropin 1.2008 · DOI: 10.1093/mp/ssm017
An ATP-Binding Cassette Transporter, ABCB19, Regulates Leaf Position and Morphology during Phototropin1-Mediated Blue Light Responses.2020 · DOI: 10.1104/pp.20.00223

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0304200 蛋白激酶，在光向性反应的信号转导通路中作为蓝光光受体。 暂无已核实直接文献
Os11g0102200 蛋白激酶，在光向性反应的信号转导通路中作为蓝光光受体。 暂无已核实直接文献
Os12g0101800 蛋白激酶，在光向性反应的信号转导通路中作为蓝光光受体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016001 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009638 phototropism 生物过程
GO:0009639 response to red or far red light 生物过程
GO:0009785 blue light signaling pathway 生物过程
GO:0009902 chloroplast relocation 生物过程
GO:0009903 chloroplast avoidance movement 生物过程
GO:0009904 chloroplast accumulation movement 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010155 regulation of proton transport 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G45780
ath:AT5G58140
dosa:Os04g0304200
dosa:Os11g0102200
dosa:Os12g0101800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.434
排名 1 · TkA02G278230 · TK1151
细胞膜0.433
排名 2 · TkA02G278230 · TK1151
细胞核0.240
排名 3 · TkA02G278230 · TK1151
线粒体0.063
排名 4 · TkA02G278230 · TK1151
高尔基体0.055
排名 5 · TkA02G278230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08448PAS_472-99 aa
PF13426PAS_9105-201 aa
PF08448PAS_4108-200 aa
PF00989PAS111-196 aa
PF08447PAS_3111-195 aa
PF13426PAS_9378-470 aa
PF00989PAS381-470 aa
PF08447PAS_3382-467 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G278230PF08448PAS_472995.7e-1040.1
TkA02G278230PF13426PAS_91052012.2e-44150.6
TkA02G278230PF08448PAS_41082005.7e-1040.1
TkA02G278230PF00989PAS1111964e-1969.4
TkA02G278230PF08447PAS_31111951.1e-1764.8
TkA02G278230PF13426PAS_93784702.2e-44150.6
TkA02G278230PF00989PAS3814704e-1969.4
TkA02G278230PF08447PAS_33824671.1e-1764.8
TkA02G278230PF08448PAS_43824675.7e-1040.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P93025拟南芥sp|P93025|PHOT2_ARATH Phototropin-265.500%Swiss-Prot高置信
O48963拟南芥sp|O48963|PHOT1_ARATH Phototropin-154.400%Swiss-Prot高置信
Q9ST27水稻sp|Q9ST27|PHOT2_ORYSJ Phototropin-262.600%Swiss-Prot高置信
Q2RBR1水稻sp|Q2RBR1|PHT1B_ORYSJ Phototropin-1B53.700%Swiss-Prot高置信
Q2QYY8水稻sp|Q2QYY8|PHT1A_ORYSJ Phototropin-1A54.000%Swiss-Prot高置信

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