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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G273700
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 69855533-69857566 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1893 bp · TkA02G273700|TK1151|cDNA

TTGAAATAAACCATCAATAATGCAAGGAGAGAGAGAGTTGACTAATAGCTTTGGTTTTATATATGGCTAGGAGACAATTGAAGCGATATCATATCTTTCAAACACATCTACTATAATTCTTGCAAGGCCTTTCTTTTGCATCATAGTTTTCATCAAGCATCAACACTATGTCGGTTTTAAAGCAGTTTGAACATCTTAGAATTCCACTATCTGATATCTTATCAGCAACCAACAACTTTGCGGAAGGTTGTTGCATTGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1425 bp · TkA02G273700|TK1151|CDS

ATGTCGGTTTTAAAGCAGTTTGAACATCTTAGAATTCCACTATCTGATATCTTATCAGCAACCAACAACTTTGCGGAAGGTTGTTGCATTGGAGGAGGTGGATTTGGAAAAGTGTACGAGGGAATACTCAGTTCAAGAGGGAATAAGATGGTGGCTATAAAAGTTTTGGATCGCGCACTTGGTCAAGGAGACGCTGAGTTTTGGAAAGAGGTCATGATGCTTTCGGAGTACAAGCATGAAAATATCATCTCCCTCCTAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

474 aa · TkA02G273700|TK1151|PROTEIN

MSVLKQFEHLRIPLSDILSATNNFAEGCCIGGGGFGKVYEGILSSRGNKMVAIKVLDRALGQGDAEFWKEVMMLSEYKHENIISLLGFCDEDKQKILIYKHASRKSLDAHIDNKELTWARRLKVCIDAARGLAYLHNPAGTQHRLLHRDIKSSNILLDENWNGIIADFGLSKFGPANQKNTFLITNNTVGTLGYVDPEYMEGGLLTKESDVYSFGVVLFEVLCGRLCIVNSVGQQSLTIMIRTHIKRHKLEKLKDIVWCN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G273700
TK1151 IDTkA02G273700
OH-1004 IDLXL04_015969
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G273700
位置Chr02:69855533-69857566 (-)
描述Similar to HERK1: Receptor-like protein kinase HERK 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献
At5g38990 可能的受体样蛋白激酶At5g38990。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015969 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分
GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分
GO:0090404 pollen tube tip 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G46290
ath:AT5G24010
ath:AT5G28680
ath:AT5G39000
ath:AT5G59700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.576
排名 1 · TkA02G273700 · TK1151
细胞核0.323
排名 2 · TkA02G273700 · TK1151
细胞膜0.292
排名 3 · TkA02G273700 · TK1151
内质网0.045
排名 4 · TkA02G273700 · TK1151
高尔基体0.038
排名 5 · TkA02G273700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase29-296 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr29-297 aa
PF03109ABC130-57 aa
PF17667Pkinase_fungal122-219 aa
PF01636APH136-176 aa
PF03109ABC1141-181 aa
PF19134DUF5817223-265 aa
PF00462Glutaredoxin333-398 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G273700PF00069Pkinase292962.9e-41142.3
TkA02G273700PF07714PK_Tyr_Ser-Thr292971.3e-40140.1
TkA02G273700PF03109ABC130570.02214.6
TkA02G273700PF17667Pkinase_fungal1222190.005216.3
TkA02G273700PF01636APH1361760.004417.5
TkA02G273700PF03109ABC11411810.02214.6
TkA02G273700PF19134DUF58172232653.88.3
TkA02G273700PF00462Glutaredoxin3333982e-1041.5
TkA02G273700PF04908SH3BGR3344090.004118.0
TkA02G273700PF00069Pkinase3523742.9e-41142.3
TkA02G273700PF25436BSD2_CRD4264460.1912.6
TkA02G273700PF23733GRXCR1-2_C4294743.4e-1040.4
TkA02G273700PF19134DUF58174384643.88.3
TkA02G273700PF25436BSD2_CRD4574730.1912.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LX66拟南芥sp|Q9LX66|HERK_ARATH Receptor-like protein kinase HERK 143.700%Swiss-Prot中等置信
Q3E8W4拟南芥sp|Q3E8W4|ANX2_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR244.100%Swiss-Prot中等置信
Q9FN92拟南芥sp|Q9FN92|Y5597_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g5970042.700%Swiss-Prot中等置信
Q9FID8拟南芥sp|Q9FID8|Y5900_ARATH Putative receptor-like protein kinase At5g3900038.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FID9拟南芥sp|Q9FID9|Y5389_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g3899038.000%Swiss-Prot中等置信

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